Authors:
Benedet A, Ho PN, Xiang R, Bolormaa S, De Marchi M, Goddard ME, Pryce JE
(Contact: jennie.pryce@ecodev.vic.gov.au )
Affiliation:
Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBioscience, Bundoora, Victoria 3083, Australia; School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Victoria 3083, Australia
Title:
The use of mid-infrared spectra to map genes affecting milk composition
Journal:
J Dairy Sci, 102(8):7189-7203 (2019)
DOI :
S0022-0302(19)30485-0
Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk margaric acid content reported for chromosome(s):
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QTL for Milk oleic acid content reported for chromosome(s):
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QTL for Milk fat percentage reported for chromosome(s):
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QTL for Milk butyric acid content reported for chromosome(s):
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QTL for Milk caproic acid content reported for chromosome(s):
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QTL for Milk caprylic acid content reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173161 . Chr.2 : Asso:172771 . Chr.5 : Asso:172792 , Asso:172805 , Asso:172818 . Chr.8 : Asso:172834 , Asso:172843 . Chr.11 : Asso:172863 . Chr.12 : Asso:172875 . Chr.14 : Asso:172891 , Asso:172904 , Asso:172917 , Asso:172929 , Asso:172943 , Asso:172957 , Asso:172970 , Asso:172982 , Asso:172994 , Asso:173007 . Chr.15 : Asso:173022 . Chr.17 : Asso:173040 . Chr.18 : Asso:173052 , Asso:173064 . Chr.19 : Asso:173081 . Chr.20 : Asso:173095 , Asso:173108 , Asso:173121 , Asso:173132 . Chr.28 : Asso:173146 .
QTL for Milk capric acid content reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173162 . Chr.2 : Asso:172772 . Chr.5 : Asso:172793 , Asso:172806 , Asso:172819 . Chr.8 : Asso:172835 , Asso:172844 . Chr.10 : Asso:172854 . Chr.11 : Asso:172864 . Chr.12 : Asso:172876 . Chr.14 : Asso:172892 , Asso:172905 , Asso:172918 , Asso:172930 , Asso:172944 , Asso:172956 , Asso:172958 , Asso:172971 , Asso:172983 , Asso:172995 , Asso:173008 . Chr.15 : Asso:173023 . Chr.17 : Asso:173041 . Chr.18 : Asso:173053 , Asso:173065 . Chr.19 : Asso:173082 . Chr.20 : Asso:173096 , Asso:173109 , Asso:173122 , Asso:173133 . Chr.28 : Asso:173147 .
QTL for Milk lauric acid content reported for chromosome(s):
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QTL for Milk myristic acid content reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173164 . Chr.2 : Asso:172774 . Chr.5 : Asso:172795 , Asso:172808 , Asso:172821 . Chr.8 : Asso:172837 , Asso:172846 . Chr.10 : Asso:172856 . Chr.11 : Asso:172865 . Chr.12 : Asso:172878 . Chr.14 : Asso:172894 , Asso:172907 , Asso:172920 , Asso:172932 , Asso:172946 , Asso:172960 , Asso:172973 , Asso:172985 , Asso:172997 , Asso:173010 . Chr.15 : Asso:173025 . Chr.16 : Asso:173034 . Chr.17 : Asso:173043 . Chr.18 : Asso:173055 , Asso:173067 . Chr.19 : Asso:173084 . Chr.20 : Asso:173098 , Asso:173111 , Asso:173124 , Asso:173135 . Chr.28 : Asso:173149 .
QTL for Milk stearic acid content reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:172776 . Chr.5 : Asso:172798 , Asso:172810 , Asso:172824 . Chr.8 : Asso:172849 . Chr.11 : Asso:172868 . Chr.12 : Asso:172881 . Chr.14 : Asso:172897 , Asso:172910 , Asso:172923 , Asso:172935 , Asso:172949 , Asso:173000 , Asso:173013 . Chr.15 : Asso:173028 . Chr.17 : Asso:173046 . Chr.18 : Asso:173058 , Asso:173070 . Chr.19 : Asso:173087 , Asso:173076 . Chr.20 : Asso:173101 , Asso:173114 , Asso:173127 , Asso:173138 . Chr.28 : Asso:173151 .
QTL for Milk arachidic acid content reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:172777 . Chr.5 : Asso:172799 , Asso:172812 , Asso:172825 . Chr.8 : Asso:172850 . Chr.11 : Asso:172869 . Chr.12 : Asso:172882 . Chr.14 : Asso:172898 , Asso:172911 , Asso:172924 , Asso:172936 , Asso:172950 , Asso:172963 , Asso:173001 , Asso:173014 . Chr.15 : Asso:173029 . Chr.17 : Asso:173047 . Chr.18 : Asso:173059 , Asso:173071 . Chr.19 : Asso:173077 , Asso:173088 . Chr.20 : Asso:173102 , Asso:173115 , Asso:173128 , Asso:173139 . Chr.28 : Asso:173152 .
QTL for Milk protein percentage reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173157 . Chr.3 : Asso:172780 , Asso:172785 . Chr.5 : Asso:172802 , Asso:172815 . Chr.6 : Asso:172827 . Chr.8 : Asso:172830 , Asso:172840 . Chr.10 : Asso:172853 . Chr.12 : Asso:172872 . Chr.13 : Asso:172884 . Chr.14 : Asso:172888 , Asso:172901 , Asso:172914 , Asso:172939 , Asso:172953 , Asso:172966 , Asso:172978 , Asso:172990 , Asso:173004 . Chr.15 : Asso:173016 . Chr.16 : Asso:173032 . Chr.19 : Asso:173073 . Chr.20 : Asso:173092 , Asso:173105 , Asso:173118 .
QTL for Milk lactose content reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173158 . Chr.3 : Asso:172781 , Asso:172786 . Chr.7 : Asso:172828 . Chr.8 : Asso:172831 . Chr.13 : Asso:172886 . Chr.14 : Asso:172940 , Asso:172954 , Asso:172967 , Asso:172979 , Asso:172991 . Chr.15 : Asso:173017 . Chr.19 : Asso:173074 , Asso:173089 . Chr.28 : Asso:173141 , Asso:173143 . Chr.29 : Asso:173154 , Asso:173155 .
QTL for Milk palmitic acid content reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173165 . Chr.3 : Asso:172783 , Asso:172788 . Chr.5 : Asso:172796 , Asso:172809 , Asso:172822 . Chr.8 : Asso:172838 , Asso:172847 . Chr.10 : Asso:172857 . Chr.11 : Asso:172866 . Chr.12 : Asso:172879 . Chr.14 : Asso:172895 , Asso:172908 , Asso:172921 , Asso:172933 , Asso:172947 , Asso:172961 , Asso:172974 , Asso:172986 , Asso:172998 , Asso:173011 . Chr.15 : Asso:173026 . Chr.16 : Asso:173035 . Chr.17 : Asso:173044 . Chr.18 : Asso:173056 , Asso:173068 . Chr.19 : Asso:173085 , Asso:173090 . Chr.20 : Asso:173099 , Asso:173112 , Asso:173125 , Asso:173136 .
QTL for Milk mid-infrared spectra reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:173248 , Asso:173269 . Chr.1 : Asso:173210 , Asso:173249 . Chr.2 : Asso:173211 , Asso:173250 . Chr.3 : Asso:173212 , Asso:173213 . Chr.5 : Asso:173214 , Asso:173215 , Asso:173216 , Asso:173251 , Asso:173252 . Chr.7 : Asso:173217 , Asso:173253 . Chr.8 : Asso:173218 , Asso:173219 , Asso:173254 . Chr.9 : Asso:173255 . Chr.10 : Asso:173220 , Asso:173256 . Chr.12 : Asso:173221 , Asso:173257 . Chr.13 : Asso:173222 , Asso:173223 , Asso:173258 . Chr.14 : Asso:173224 , Asso:173225 , Asso:173226 , Asso:173227 , Asso:173228 , Asso:173229 , Asso:173230 . Chr.15 : Asso:173231 , Asso:173232 , Asso:173259 . Chr.16 : Asso:173233 , Asso:173260 . Chr.17 : Asso:173234 , Asso:173261 . Chr.18 : Asso:173235 , Asso:173236 , Asso:173262 . Chr.19 : Asso:173237 , Asso:173238 , Asso:173239 . Chr.20 : Asso:173240 , Asso:173241 , Asso:173242 , Asso:173243 . Chr.21 : Asso:173263 . Chr.23 : Asso:173264 . Chr.25 : Asso:173265 . Chr.26 : Asso:173266 . Chr.27 : Asso:173267 . Chr.28 : Asso:173244 , Asso:173245 . Chr.29 : Asso:173246 , Asso:173247 , Asso:173268 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (14) ,
Chr.1 (4) ,
Chr.2 (13) ,
Chr.3 (12) ,
Chr.5 (43) ,
Chr.6 (1) ,
Chr.7 (3) ,
Chr.8 (26) ,
Chr.9 (1) ,
Chr.10 (10) ,
Chr.11 (11) ,
Chr.12 (15) ,
Chr.13 (6) ,
Chr.14 (136) ,
Chr.15 (18) ,
Chr.16 (8) ,
Chr.17 (14) ,
Chr.18 (27) ,
Chr.19 (21) ,
Chr.20 (55) ,
Chr.21 (1) ,
Chr.23 (1) ,
Chr.25 (1) ,
Chr.26 (1) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (15) ,
Chr.29 (5) .
Number of gene-based eQTL/associations: