Authors: Ponsuksili S, Murani E, Trakooljul N, Schwerin M, Wimmers K
(Contact: wimmers@fbn-dummerstorf.de ) Affiliation: 2. Research Unit 'Molecular Biology', Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN), Wilhelm-Stahl-Allee 2, D-18196 Dummerstorf, Germany Title: Discovery of candidate genes for muscle traits based on GWAS supported by eQTL-analysis Journal: International Journal Of Biological Sciences, 10(3): 327-37 (2014)
DOI :
10.7150/ijbs.8134 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Meat color
Chr.1 : Asso:36127 , Asso:36128 , Asso:36130 , Asso:36131 , Asso:36135 , Asso:36136 , Asso:36137 , Asso:36140 . Chr.4 : Asso:36124 , Asso:36126 , Asso:36132 , Asso:36133 , Asso:36134 , Asso:36141 . Chr.6 : Asso:36075 , Asso:36076 , Asso:36078 , Asso:36079 , Asso:36080 , Asso:36081 , Asso:36082 , Asso:36083 , Asso:36084 , Asso:36085 , Asso:36125 , Asso:36129 , Asso:36151 , Asso:36157 . Chr.8 : Asso:36138 , Asso:36139 . Chr.12 : Asso:36123 . Chr.13 : Asso:36077 . Chr.14 : Asso:36142 , Asso:36143 , Asso:36144 , Asso:36145 , Asso:36146 , Asso:36147 , Asso:36148 , Asso:36149 , Asso:36152 , Asso:36153 , Asso:36154 , Asso:36155 , Asso:36156 . Chr.15 : Asso:36074 , Asso:36150 .
QTL for Muscle impedance
Chr.1 : Asso:36207 , Asso:36211 , Asso:36213 , Asso:36214 , Asso:36215 , Asso:36219 . Chr.3 : Asso:36087 . Chr.6 : Asso:36086 , Asso:36183 , Asso:36184 , Asso:36185 , Asso:36186 , Asso:36187 , Asso:36188 , Asso:36189 , Asso:36190 , Asso:36191 , Asso:36192 , Asso:36193 , Asso:36194 , Asso:36195 , Asso:36196 , Asso:36197 , Asso:36198 , Asso:36199 , Asso:36200 , Asso:36201 , Asso:36202 , Asso:36203 , Asso:36204 , Asso:36205 , Asso:36206 , Asso:36208 , Asso:36209 , Asso:36210 , Asso:36212 , Asso:36216 , Asso:36217 , Asso:36218 , Asso:36220 , Asso:36221 , Asso:36222 , Asso:36223 , Asso:36224 , Asso:36281 . Chr.8 : Asso:36088 .
QTL for Muscle conductivity
Chr.1 : Asso:36229 . Chr.6 : Asso:36089 , Asso:36225 , Asso:36226 , Asso:36227 , Asso:36228 . Chr.8 : Asso:36090 , Asso:36091 . Chr.13 : Asso:36230 .
QTL for Muscle pH
Chr.X : Asso:36272 . Chr.3 : Asso:36234 , Asso:36238 . Chr.4 : Asso:36092 , Asso:36093 , Asso:36094 , Asso:36095 , Asso:36096 , Asso:36097 , Asso:36098 , Asso:36099 , Asso:36100 , Asso:36101 , Asso:36102 , Asso:36103 , Asso:36104 , Asso:36105 , Asso:36106 , Asso:36107 , Asso:36108 , Asso:36109 , Asso:36110 , Asso:36112 , Asso:36113 , Asso:36114 , Asso:36115 , Asso:36116 , Asso:36117 , Asso:36118 , Asso:36119 . Chr.6 : Asso:36120 , Asso:36121 , Asso:36122 , Asso:36235 , Asso:36236 , Asso:36237 , Asso:36239 , Asso:36240 , Asso:36241 , Asso:36242 , Asso:36243 , Asso:36244 , Asso:36245 , Asso:36246 , Asso:36247 , Asso:36248 , Asso:36249 , Asso:36250 , Asso:36251 , Asso:36252 , Asso:36253 , Asso:36254 , Asso:36255 , Asso:36256 , Asso:36257 , Asso:36258 , Asso:36260 , Asso:36262 , Asso:36263 , Asso:36264 , Asso:36265 , Asso:36266 , Asso:36267 , Asso:36268 , Asso:36269 , Asso:36270 , Asso:36274 , Asso:36275 , Asso:36277 , Asso:36278 . Chr.10 : Asso:36233 , Asso:36280 . Chr.12 : Asso:36259 , Asso:36261 , Asso:36271 , Asso:36273 , Asso:36276 , Asso:36279 . Chr.14 : Asso:36111 , Asso:36231 , Asso:36232 .
QTL for Drip loss
Chr.6 : Asso:36158 , Asso:36159 , Asso:36160 , Asso:36161 , Asso:36162 , Asso:36163 , Asso:36165 , Asso:36166 , Asso:36167 , Asso:36168 , Asso:36169 , Asso:36170 , Asso:36171 , Asso:36172 , Asso:36173 , Asso:36174 , Asso:36175 , Asso:36176 , Asso:36177 , Asso:36178 , Asso:36179 , Asso:36180 , Asso:36181 , Asso:36182 . Chr.13 : Asso:36164 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (1) ,
Chr.1 (15) ,
Chr.3 (3) ,
Chr.4 (33) ,
Chr.6 (121) ,
Chr.8 (5) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.12 (7) ,
Chr.13 (3) ,
Chr.14 (16) ,
Chr.15 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
