Authors: Gebreyesus G, Buitenhuis A J, Poulsen N A, Visker M H P W, Zhang Q, van Valenberg H J F, Sun D, Bovenhuis H
(Contact: grum.gebreyesus@mbg.au.dk ) Affiliation: Animal Breeding and Genomics, Wageningen University and Research, P.O. Box 338, 6700 AH, Wageningen, the Netherlands Title: Multi-population GWAS and enrichment analyses reveal novel genomic regions and promising candidate genes underlying bovine milk fatty acid composition Journal: BMC Genomics, 20(1): 178 (2019)
DOI :
10.1186/s12864-019-5573-9 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk palmitic acid content
Chr.1 : QTL:172058 . Chr.2 : QTL:172064 , QTL:172071 . Chr.5 : QTL:172083 . Chr.11 : QTL:172111 , QTL:172112 . Chr.14 : QTL:172123 , QTL:172135 . Chr.19 : QTL:172167 . Chr.26 : QTL:172197 . Chr.27 : QTL:172203 . Chr.29 : QTL:172206 .
QTL for Milk C18 index
Chr.1 : QTL:172059 . Chr.6 : QTL:172089 . Chr.10 : QTL:172110 . Chr.14 : QTL:172131 , QTL:172143 , QTL:172147 . Chr.19 : QTL:172170 . Chr.20 : QTL:172176 . Chr.23 : QTL:172186 . Chr.26 : QTL:172202 .
QTL for Milk pentadecylic acid content
Chr.1 : QTL:172060 . Chr.2 : QTL:172070 . Chr.4 : QTL:172075 . Chr.5 : QTL:172076 . Chr.7 : QTL:172094 . Chr.8 : QTL:172095 . Chr.9 : QTL:172102 . Chr.14 : QTL:172122 , QTL:172134 . Chr.23 : QTL:172183 .
QTL for Milk caprylic acid content
Chr.2 : QTL:172061 . Chr.5 : QTL:172077 , QTL:172079 . Chr.7 : QTL:172090 . Chr.14 : QTL:172118 , QTL:172132 . Chr.17 : QTL:172158 . Chr.19 : QTL:172163 . Chr.26 : QTL:172192 .
QTL for Milk capric acid content
Chr.2 : QTL:172062 . Chr.5 : QTL:172078 , QTL:172080 . Chr.7 : QTL:172091 . Chr.10 : QTL:172103 . Chr.13 : QTL:172117 . Chr.14 : QTL:172119 , QTL:172133 . Chr.15 : QTL:172148 , QTL:172151 . Chr.17 : QTL:172159 . Chr.19 : QTL:172164 . Chr.21 : QTL:172177 . Chr.26 : QTL:172193 .
QTL for Milk myristoleic acid content
Chr.2 : QTL:172063 . Chr.5 : QTL:172082 . Chr.9 : QTL:172101 . Chr.10 : QTL:172105 . Chr.12 : QTL:172114 . Chr.14 : QTL:172121 , QTL:172144 . Chr.20 : QTL:172173 . Chr.26 : QTL:172196 .
QTL for Milk palmitoleic acid content
Chr.2 : QTL:172065 , QTL:172067 . Chr.5 : QTL:172084 . Chr.8 : QTL:172096 . Chr.14 : QTL:172124 , QTL:172136 , QTL:172145 . Chr.16 : QTL:172154 . Chr.17 : QTL:172156 , QTL:172160 . Chr.20 : QTL:172171 . Chr.26 : QTL:172198 . Chr.28 : QTL:172204 .
QTL for Milk C14 index
Chr.2 : QTL:172066 . Chr.5 : QTL:172087 . Chr.14 : QTL:172129 , QTL:172141 , QTL:172146 . Chr.19 : QTL:172169 . Chr.20 : QTL:172175 . Chr.22 : QTL:172181 . Chr.25 : QTL:172191 . Chr.26 : QTL:172200 .
QTL for Milk lauric acid content
Chr.2 : QTL:172069 . Chr.5 : QTL:172081 . Chr.7 : QTL:172093 . Chr.10 : QTL:172104 . Chr.19 : QTL:172165 . Chr.21 : QTL:172178 . Chr.25 : QTL:172188 . Chr.26 : QTL:172194 .
QTL for Milk C16 index
Chr.2 : QTL:172068 . Chr.5 : QTL:172088 . Chr.8 : QTL:172097 . Chr.12 : QTL:172116 . Chr.14 : QTL:172130 , QTL:172142 . Chr.16 : QTL:172153 , QTL:172155 . Chr.17 : QTL:172157 , QTL:172162 . Chr.23 : QTL:172185 . Chr.26 : QTL:172201 . Chr.28 : QTL:172205 .
QTL for Milk oleic acid content
Chr.2 : QTL:172072 . Chr.5 : QTL:172085 . Chr.12 : QTL:172113 . Chr.14 : QTL:172125 , QTL:172137 . Chr.19 : QTL:172168 . Chr.20 : QTL:172174 . Chr.21 : QTL:172180 . Chr.23 : QTL:172184 . Chr.25 : QTL:172189 . Chr.29 : QTL:172207 .
QTL for Milk linolenic acid content
Chr.3 : QTL:172073 . Chr.10 : QTL:172107 . Chr.14 : QTL:172127 , QTL:172139 . Chr.17 : QTL:172161 .
QTL for Milk conjugated linoleic acid content
Chr.3 : QTL:172074 . Chr.5 : QTL:172086 . Chr.8 : QTL:172099 . Chr.10 : QTL:172109 . Chr.12 : QTL:172115 . Chr.14 : QTL:172128 , QTL:172140 . Chr.23 : QTL:172182 . Chr.25 : QTL:172190 .
QTL for Milk linoleic acid content
Chr.7 : QTL:172092 . Chr.14 : QTL:172126 , QTL:172138 .
QTL for Milk myristic acid content
Chr.8 : QTL:172098 . Chr.14 : QTL:172120 . Chr.15 : QTL:172149 . Chr.19 : QTL:172166 . Chr.21 : QTL:172179 . Chr.26 : QTL:172195 .
QTL for Milk stearic acid content
Chr.8 : Asso:172100 . Chr.10 : QTL:172106 , QTL:172108 . Chr.15 : QTL:172150 . Chr.16 : QTL:172152 . Chr.20 : QTL:172172 . Chr.24 : QTL:172187 . Chr.26 : QTL:172199 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (3) ,
Chr.2 (12) ,
Chr.3 (2) ,
Chr.4 (1) ,
Chr.5 (13) ,
Chr.6 (1) ,
Chr.7 (5) ,
Chr.8 (6) ,
Chr.9 (2) ,
Chr.10 (8) ,
Chr.11 (2) ,
Chr.12 (4) ,
Chr.13 (1) ,
Chr.14 (30) ,
Chr.15 (4) ,
Chr.16 (4) ,
Chr.17 (7) ,
Chr.19 (8) ,
Chr.20 (6) ,
Chr.21 (4) ,
Chr.22 (1) ,
Chr.23 (5) ,
Chr.24 (1) ,
Chr.25 (4) ,
Chr.26 (11) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (2) ,
Chr.29 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Gebreyesus G, Buitenhuis A J, Poulsen N A, Visker M H P W, Zhang Q, van Valenberg H J F, Sun D, Bovenhuis H (2019). Multi-population GWAS and enrichment analyses reveal novel genomic regions and promising candidate genes underlying bovine milk fatty acid composition. BMC genomics, 20(1): 178;
Curated into QTLdb on 2019-06-19. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=CaIc4M8XyA
OR
Gebreyesus G, Buitenhuis A J, Poulsen N A, Visker M H P W, Zhang Q, van Valenberg H J F, Sun D, Bovenhuis H (2019). Multi-population GWAS and enrichment analyses reveal novel genomic regions and promising candidate genes underlying bovine milk fatty acid composition. BMC genomics, 20(1): 178; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-019-5573-9
