Authors:
Zhang F, Zhang Z, Yan X, Chen H, Zhang W, Hong Y, Huang L
(Contact: lushenghuang@hotmail.com )
Affiliation:
Key Laboratory for Animal Biotechnology of Jiangxi Province and the Ministry of Agriculture of China, Jiangxi Agricultural University, 330045 Nanchang, China
Title:
Genome-wide association studies for hematological traits in Chinese Sutai pigs
Journal:
BMC Genetics, 15: 41 (2014)
DOI :
10.1186/1471-2156-15-41
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QTL for Hematocrit reported for chromosome(s):
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QTL for Hemoglobin reported for chromosome(s):
Chr.13 : Asso:27304 .
QTL for Mean corpuscular hemoglobin content reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:27305 , Asso:27306 , Asso:27307 , Asso:27308 , Asso:27309 , Asso:27310 , Asso:27311 , Asso:27312 , Asso:27313 , Asso:27314 , Asso:27315 , Asso:27316 , Asso:27317 , Asso:27318 , Asso:27319 , Asso:27320 , Asso:27321 , Asso:27322 , Asso:27323 , Asso:27324 , Asso:27325 , Asso:27326 , Asso:27327 , Asso:27329 , Asso:27330 , Asso:27331 , Asso:27332 , Asso:27333 , Asso:27334 , Asso:27335 , Asso:27336 , Asso:27337 , Asso:27338 , Asso:27339 , Asso:27340 , Asso:27341 , Asso:27342 , Asso:27343 , Asso:27344 , Asso:27649 , Asso:27650 , Asso:27651 , Asso:27652 , Asso:27653 , Asso:27654 , Asso:27655 , Asso:27656 , Asso:27657 , Asso:27658 , Asso:27659 , Asso:27660 , Asso:27661 , Asso:27662 , Asso:27663 , Asso:27664 , Asso:27665 , Asso:27666 , Asso:27667 , Asso:27668 , Asso:27669 , Asso:27670 , Asso:27671 , Asso:27672 , Asso:27673 , Asso:27674 , Asso:27675 , Asso:27676 , Asso:27677 , Asso:27678 , Asso:27679 , Asso:27680 , Asso:27681 , Asso:27682 , Asso:27683 , Asso:27684 . Chr.3 : Asso:27328 . Chr.4 : Asso:27685 , Asso:27686 , Asso:27687 , Asso:27688 , Asso:27689 , Asso:27690 , Asso:27691 , Asso:27692 , Asso:27693 , Asso:27694 , Asso:27695 , Asso:27696 , Asso:27697 , Asso:27698 , Asso:27699 . Chr.5 : Asso:27700 , Asso:27701 , Asso:27702 , Asso:27703 , Asso:27704 , Asso:27705 , Asso:27706 , Asso:27707 , Asso:27708 .
QTL for Mean corpuscular hemoglobin concentration reported for chromosome(s):
Chr.6 : Asso:27345 , Asso:27346 , Asso:27347 , Asso:27348 , Asso:27349 , Asso:27350 , Asso:27351 , Asso:27352 , Asso:27353 , Asso:27354 , Asso:27355 , Asso:27356 , Asso:27357 , Asso:27358 , Asso:27359 , Asso:27360 , Asso:27361 , Asso:27362 , Asso:27363 , Asso:27364 , Asso:27365 , Asso:27366 .
QTL for Mean corpuscular volume reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:27367 , Asso:27368 , Asso:27369 , Asso:27370 , Asso:27371 , Asso:27372 , Asso:27373 , Asso:27374 , Asso:27375 , Asso:27376 , Asso:27377 , Asso:27378 , Asso:27379 , Asso:27380 , Asso:27381 , Asso:27382 , Asso:27383 , Asso:27384 , Asso:27385 , Asso:27386 , Asso:27387 , Asso:27388 , Asso:27389 , Asso:27390 , Asso:27391 , Asso:27393 , Asso:27395 , Asso:27396 , Asso:27397 , Asso:27398 , Asso:27399 , Asso:27400 , Asso:27401 , Asso:27402 , Asso:27403 , Asso:27404 , Asso:27405 , Asso:27406 , Asso:27407 , Asso:27408 , Asso:27409 , Asso:27410 , Asso:27411 , Asso:27412 , Asso:27413 , Asso:27414 , Asso:27415 , Asso:27416 , Asso:27417 , Asso:27418 , Asso:27419 , Asso:27420 , Asso:27421 , Asso:27709 . Chr.3 : Asso:27392 . Chr.6 : Asso:27394 . Chr.7 : Asso:27710 , Asso:27711 , Asso:27712 , Asso:27713 , Asso:27714 , Asso:27715 , Asso:27716 , Asso:27717 , Asso:27718 , Asso:27719 , Asso:27720 , Asso:27721 , Asso:27722 , Asso:27723 , Asso:27724 , Asso:27725 , Asso:27726 , Asso:27727 , Asso:27728 , Asso:27729 , Asso:27730 , Asso:27731 , Asso:27732 , Asso:27733 , Asso:27734 , Asso:27735 , Asso:27736 , Asso:27737 , Asso:27738 , Asso:27739 , Asso:27740 , Asso:27741 , Asso:27742 , Asso:27743 , Asso:27744 , Asso:27745 , Asso:27746 , Asso:27747 , Asso:27748 , Asso:27749 , Asso:27750 , Asso:27751 , Asso:27752 , Asso:27753 , Asso:27754 , Asso:27755 , Asso:27756 , Asso:27757 , Asso:27758 , Asso:27759 , Asso:27760 , Asso:27761 , Asso:27762 , Asso:27763 , Asso:27764 , Asso:27765 , Asso:27766 , Asso:27767 , Asso:27768 , Asso:27769 , Asso:27770 , Asso:27771 , Asso:27772 , Asso:27773 , Asso:27774 , Asso:27775 , Asso:27776 .
QTL for Mean platelet volume reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:27422 , Asso:27423 , Asso:27424 , Asso:27425 , Asso:27426 .
QTL for Platelet-large cell ratio reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:27427 , Asso:27428 , Asso:27429 , Asso:27430 , Asso:27431 , Asso:27432 , Asso:27433 , Asso:27434 , Asso:27435 , Asso:27437 . Chr.4 : Asso:27438 . Chr.6 : Asso:27436 .
QTL for Red blood cell count reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:27777 , Asso:27778 , Asso:27779 , Asso:27780 , Asso:27781 . Chr.2 : Asso:27441 . Chr.4 : Asso:27439 , Asso:27442 . Chr.7 : Asso:27782 , Asso:27783 , Asso:27784 , Asso:27785 , Asso:27786 , Asso:27787 , Asso:27788 , Asso:27789 , Asso:27790 , Asso:27791 , Asso:27792 , Asso:27793 , Asso:27794 , Asso:27795 , Asso:27796 , Asso:27797 , Asso:27798 , Asso:27799 , Asso:27800 , Asso:27801 , Asso:27802 , Asso:27803 , Asso:27804 . Chr.8 : Asso:27805 , Asso:27806 , Asso:27807 , Asso:27808 , Asso:27809 , Asso:27810 , Asso:27811 , Asso:27812 , Asso:27813 , Asso:27814 , Asso:27815 . Chr.9 : Asso:27816 , Asso:27817 , Asso:27818 , Asso:27819 , Asso:27820 , Asso:27821 , Asso:27822 , Asso:27823 , Asso:27824 , Asso:27825 , Asso:27826 , Asso:27827 , Asso:27828 , Asso:27829 , Asso:27830 , Asso:27831 , Asso:27832 , Asso:27833 , Asso:27834 , Asso:27835 , Asso:27836 , Asso:27837 , Asso:27838 , Asso:27839 , Asso:27840 , Asso:27841 , Asso:27842 , Asso:27843 , Asso:27844 , Asso:27845 , Asso:27846 , Asso:27847 , Asso:27848 , Asso:27849 , Asso:27850 , Asso:27851 , Asso:27852 , Asso:27853 , Asso:27854 , Asso:27855 , Asso:27856 , Asso:27857 , Asso:27858 , Asso:27859 , Asso:27860 , Asso:27861 , Asso:27862 , Asso:27863 , Asso:27864 , Asso:27865 . Chr.12 : Asso:27866 , Asso:27867 , Asso:27868 , Asso:27869 , Asso:27870 , Asso:27871 , Asso:27872 , Asso:27873 , Asso:27874 , Asso:27875 , Asso:27876 , Asso:27877 , Asso:27878 , Asso:27879 , Asso:27880 , Asso:27881 , Asso:27882 , Asso:27883 , Asso:27884 , Asso:27885 , Asso:27886 , Asso:27887 , Asso:27888 , Asso:27889 , Asso:27890 , Asso:27891 , Asso:27892 , Asso:27893 , Asso:27894 , Asso:27895 , Asso:27896 . Chr.13 : Asso:27440 . Chr.14 : Asso:27897 , Asso:27898 , Asso:27899 , Asso:27900 , Asso:27901 , Asso:27902 , Asso:27903 , Asso:27904 , Asso:27905 , Asso:27906 , Asso:27907 , Asso:27908 , Asso:27909 , Asso:27910 , Asso:27911 , Asso:27912 , Asso:27913 , Asso:27914 , Asso:27915 , Asso:27916 , Asso:27917 , Asso:27918 , Asso:27919 , Asso:27920 , Asso:27921 , Asso:27922 , Asso:27923 , Asso:27924 , Asso:27925 , Asso:27926 , Asso:27927 , Asso:27928 , Asso:27929 , Asso:27930 , Asso:27931 , Asso:27932 , Asso:27933 , Asso:27934 , Asso:27935 , Asso:27936 , Asso:27937 , Asso:27938 , Asso:27939 , Asso:27940 .
QTL for Red cell distribution width reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:27443 , Asso:27444 , Asso:27445 , Asso:27446 , Asso:27447 , Asso:27448 , Asso:27449 , Asso:27450 , Asso:27452 , Asso:27453 , Asso:27454 , Asso:27455 . Chr.9 : Asso:27941 , Asso:27942 , Asso:27943 , Asso:27944 , Asso:27945 , Asso:27946 , Asso:27947 , Asso:27948 , Asso:27949 , Asso:27950 , Asso:27951 , Asso:27952 , Asso:27953 . Chr.16 : Asso:27451 .
QTL for White blood cell number reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:27954 . Chr.2 : Asso:27456 , Asso:27457 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (13) ,
Chr.2 (160) ,
Chr.3 (2) ,
Chr.4 (20) ,
Chr.5 (9) ,
Chr.6 (24) ,
Chr.7 (113) ,
Chr.8 (22) ,
Chr.9 (120) ,
Chr.11 (2) ,
Chr.12 (62) ,
Chr.13 (3) ,
Chr.14 (88) ,
Chr.15 (17) ,
Chr.16 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations: