Authors: Bovo S, Mazzoni G, Bertolini F, Schiavo G, Galimberti G, Gallo M, Dall'Olio S, Fontanesi L
(Contact: luca.fontanesi@unibo.it ) Affiliation: Department of Agricultural and Food Sciences, Division of Animal Sciences, University of Bologna, Viale G. Fanin 46, 40127, Bologna, Italy Title: Genome-wide association studies for 30 haematological and blood clinical-biochemical traits in Large White pigs reveal genomic regions affecting intermediate phenotypes Journal: Scientific Reports, 9(1): 7003 (2019)
DOI :
10.1038/s41598-019-43297-1 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Blood albumin level
Chr.6 : Asso:170965 , QTL:171146 .
QTL for Blood albumin to globulin ratio
Chr.5 : Asso:170966 .
QTL for Blood alanine transaminase level
Chr.4 : Asso:170967 , Asso:170968 , Asso:170969 , Asso:170970 . Chr.7 : Asso:171131 , Asso:171132 , Asso:171133 , Asso:171134 , Asso:171135 , Asso:171136 , Asso:171137 . Chr.18 : Asso:170971 , QTL:171157 .
QTL for Aspartate aminotransferase activity
Chr.14 : Asso:170972 , Asso:170973 , Asso:170974 , Asso:170975 , Asso:170976 , Asso:170977 .
QTL for Basophil number
Chr.14 : Asso:170978 , Asso:170979 , Asso:170980 , Asso:170981 , Asso:170982 , Asso:170983 , Asso:170984 , Asso:170985 , Asso:170986 , Asso:170987 , Asso:170988 , Asso:170989 , Asso:170990 , Asso:170991 , Asso:170992 , Asso:170993 , Asso:170994 , Asso:170995 , Asso:170996 , Asso:170997 , Asso:170998 , Asso:170999 , Asso:171000 , Asso:171001 , Asso:171002 , Asso:171003 , Asso:171004 , Asso:171005 , Asso:171006 , Asso:171007 , Asso:171008 , Asso:171009 , Asso:171010 , Asso:171011 , Asso:171012 , Asso:171013 , Asso:171014 , Asso:171015 , Asso:171016 , Asso:171017 , Asso:171018 , Asso:171019 , Asso:171020 , Asso:171021 , Asso:171022 , Asso:171023 , Asso:171024 , Asso:171025 , Asso:171026 , Asso:171027 , Asso:171028 , Asso:171029 , Asso:171030 , Asso:171031 , Asso:171032 , Asso:171033 , Asso:171034 , Asso:171035 , Asso:171036 , Asso:171037 , Asso:171038 , Asso:171039 , Asso:171040 , Asso:171041 , Asso:171042 , Asso:171043 , Asso:171044 , Asso:171045 , Asso:171046 , Asso:171047 , Asso:171048 , Asso:171049 , Asso:171050 , Asso:171051 , Asso:171052 , Asso:171053 , Asso:171054 , Asso:171055 , Asso:171056 , Asso:171057 , Asso:171058 , Asso:171059 , Asso:171060 , Asso:171061 , Asso:171062 , Asso:171063 , Asso:171064 , Asso:171065 , Asso:171066 , Asso:171067 , Asso:171068 , Asso:171069 , Asso:171070 , Asso:171071 , Asso:171072 , Asso:171073 , Asso:171074 , Asso:171075 , QTL:171155 .
QTL for Eosinophil number
Chr.3 : Asso:171076 , Asso:171077 . Chr.7 : Asso:171078 . Chr.10 : Asso:171079 .
QTL for Blood glucose level
Chr.7 : Asso:171080 .
QTL for Hematocrit
Chr.7 : QTL:171148 . Chr.18 : Asso:171081 .
QTL for Hemoglobin
Chr.7 : QTL:171147 , QTL:171149 . Chr.18 : Asso:171082 , QTL:171156 .
QTL for LDL cholesterol
Chr.1 : Asso:171083 , Asso:171084 , Asso:171085 , Asso:171086 , QTL:171139 . Chr.3 : Asso:171087 , Asso:171088 , Asso:171089 , QTL:171140 , QTL:171141 . Chr.14 : Asso:171090 , QTL:171154 .
QTL for Lymphocyte number
Chr.2 : Asso:171091 .
QTL for Mean corpuscular hemoglobin content
Chr.5 : Asso:171092 . Chr.14 : Asso:171093 , QTL:171152 , QTL:171153 .
QTL for Mean corpuscular hemoglobin concentration
Chr.5 : Asso:171094 . Chr.14 : Asso:171095 , Asso:171158 .
QTL for Mean corpuscular volume
Chr.5 : Asso:171096 . Chr.8 : Asso:171097 , QTL:171150 .
QTL for Monocyte number
Chr.15 : Asso:171098 , Asso:171099 .
QTL for Mean platelet volume
Chr.12 : Asso:171100 .
QTL for Blood non-esterified fatty acid level
Chr.2 : Asso:171101 . Chr.9 : Asso:171102 . Chr.14 : Asso:171103 , Asso:171104 , Asso:171105 , Asso:171106 , Asso:171107 , Asso:171108 , Asso:171109 , Asso:171110 , Asso:171111 .
QTL for Neutrophil count
Chr.4 : Asso:171112 .
QTL for Platelet count
Chr.1 : Asso:171113 , Asso:171114 , QTL:171138 . Chr.4 : Asso:171115 .
QTL for Red blood cell count
Chr.5 : Asso:171116 , QTL:171145 .
QTL for Red cell distribution width
Chr.12 : Asso:171117 . Chr.16 : Asso:171118 , Asso:171119 , Asso:171159 .
QTL for Bilirubin level
Chr.14 : Asso:171120 . Chr.17 : Asso:171121 .
QTL for Cholesterol level
Chr.3 : QTL:171142 . Chr.4 : Asso:171122 . Chr.5 : Asso:171123 . Chr.7 : Asso:171124 .
QTL for Triglyceride level
Chr.16 : Asso:171125 .
QTL for Blood total protein level
Chr.17 : Asso:171126 .
QTL for Blood urea level
Chr.5 : Asso:171127 , Asso:171128 , QTL:171144 . Chr.9 : Asso:171129 .
QTL for White blood cell number
Chr.6 : Asso:171130 .
QTL for HDL cholesterol
Chr.4 : QTL:171143 . Chr.9 : QTL:171151 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (8) ,
Chr.2 (2) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (8) ,
Chr.5 (10) ,
Chr.6 (3) ,
Chr.7 (13) ,
Chr.8 (2) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.14 (122) ,
Chr.15 (2) ,
Chr.16 (4) ,
Chr.17 (2) ,
Chr.18 (5) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Bovo S, Mazzoni G, Bertolini F, Schiavo G, Galimberti G, Gallo M, Dall'Olio S, Fontanesi L (2019). Genome-wide association studies for 30 haematological and blood clinical-biochemical traits in Large White pigs reveal genomic regions affecting intermediate phenotypes. Scientific reports, 9(1): 7003;
Curated into QTLdb on 2019-05-13. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=FbFu8U4RdN
OR
Bovo S, Mazzoni G, Bertolini F, Schiavo G, Galimberti G, Gallo M, Dall'Olio S, Fontanesi L (2019). Genome-wide association studies for 30 haematological and blood clinical-biochemical traits in Large White pigs reveal genomic regions affecting intermediate phenotypes. Scientific reports, 9(1): 7003; DOI: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-43297-1
