Authors: Crispim AC, Kelly MJ, Guimarães SEF, E Silva FF, Fortes MRS, Wenceslau RR, Moore S
(Contact: aline.crispim@ufv.br ) Affiliation: Department of Animal Science, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, Minas Gerais, Brazil; Queensland Alliance for Agriculture & Food Innovation University of Queensland, Brisbane, Queensland, Australia Title: Multi-Trait GWAS and New Candidate Genes Annotation for Growth Curve Parameters in Brahman Cattle. Journal: PloS One, 10(10): e0139906 (2015)
DOI :
10.1371/journal.pone.0139906 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body weight
Chr.X : Asso:65327 , Asso:65328 , Asso:65329 . Chr.2 : Asso:65164 , Asso:65165 , Asso:65166 , Asso:65167 , Asso:65168 , Asso:65169 , Asso:65170 . Chr.3 : Asso:65171 , Asso:65172 . Chr.4 : Asso:65173 , Asso:65174 , Asso:65175 , Asso:65176 , Asso:65177 , Asso:65178 , Asso:65179 , Asso:65180 , Asso:65181 , Asso:65182 , Asso:65183 , Asso:65184 , Asso:65185 . Chr.5 : Asso:65186 , Asso:65187 , Asso:65188 , Asso:65189 , Asso:65190 , Asso:65191 , Asso:65192 , Asso:65193 , Asso:65194 , Asso:65195 , Asso:65196 , Asso:65197 , Asso:65198 , Asso:65199 , Asso:65200 . Chr.6 : Asso:65201 , Asso:65202 , Asso:65203 , Asso:65204 , Asso:65205 , Asso:65206 , Asso:65207 , Asso:65208 , Asso:65209 , Asso:65210 , Asso:65211 , Asso:65212 , Asso:65213 , Asso:65214 , Asso:65215 , Asso:65216 , Asso:65217 , Asso:65218 , Asso:65219 , Asso:65220 , Asso:65221 , Asso:65222 , Asso:65223 , Asso:65224 , Asso:65225 , Asso:65226 , Asso:65227 , Asso:65228 , Asso:65229 , Asso:65230 , Asso:65231 , Asso:65232 , Asso:65233 , Asso:65234 , Asso:65236 , Asso:65237 , Asso:65238 , Asso:65239 , Asso:65240 , Asso:65241 , Asso:65242 , Asso:65243 , Asso:65244 . Chr.8 : Asso:65245 , Asso:65246 , Asso:65247 , Asso:65248 , Asso:65249 , Asso:65250 , Asso:65251 , Asso:65252 , Asso:65253 , Asso:65254 , Asso:65255 , Asso:65256 , Asso:65257 , Asso:65258 , Asso:65259 . Chr.9 : Asso:65260 , Asso:65261 . Chr.10 : Asso:65262 . Chr.11 : Asso:65263 , Asso:65264 , Asso:65265 , Asso:65266 , Asso:65267 , Asso:65268 , Asso:65269 . Chr.12 : Asso:65270 , Asso:65271 , Asso:65272 , Asso:65273 . Chr.13 : Asso:65274 . Chr.15 : Asso:65275 . Chr.16 : Asso:65276 , Asso:65277 , Asso:65278 . Chr.17 : Asso:65279 , Asso:65280 . Chr.18 : Asso:65281 , Asso:65282 , Asso:65283 , Asso:65284 . Chr.19 : Asso:65285 , Asso:65286 , Asso:65287 , Asso:65288 , Asso:65289 , Asso:65290 , Asso:65291 , Asso:65292 , Asso:65293 . Chr.20 : Asso:65294 , Asso:65295 . Chr.21 : Asso:65296 , Asso:65297 . Chr.22 : Asso:65298 , Asso:65299 , Asso:65300 , Asso:65301 , Asso:65302 , Asso:65303 , Asso:65304 . Chr.23 : Asso:65305 , Asso:65306 , Asso:65307 , Asso:65308 , Asso:65309 , Asso:65310 , Asso:65311 , Asso:65312 . Chr.24 : Asso:65235 , Asso:65313 . Chr.27 : Asso:65314 , Asso:65315 , Asso:65316 , Asso:65317 , Asso:65318 , Asso:65319 , Asso:65320 , Asso:65321 , Asso:65322 , Asso:65323 , Asso:65324 , Asso:65325 , Asso:65326 .
QTL for Maturity rate
Chr.X : Asso:65659 , Asso:65660 , Asso:65661 , Asso:65662 , Asso:65663 , Asso:65664 , Asso:65665 , Asso:65666 , Asso:65667 . Chr.1 : Asso:65406 , Asso:65407 , Asso:65408 , Asso:65409 , Asso:65410 , Asso:65411 , Asso:65412 , Asso:65413 , Asso:65414 , Asso:65415 , Asso:65416 . Chr.2 : Asso:65417 , Asso:65418 , Asso:65419 , Asso:65420 , Asso:65421 , Asso:65422 , Asso:65423 , Asso:65424 , Asso:65425 , Asso:65426 . Chr.3 : Asso:65427 , Asso:65428 , Asso:65429 , Asso:65430 , Asso:65431 . Chr.4 : Asso:65432 , Asso:65433 , Asso:65434 , Asso:65435 , Asso:65436 , Asso:65437 , Asso:65438 , Asso:65439 . Chr.5 : Asso:65440 , Asso:65441 , Asso:65442 , Asso:65443 , Asso:65444 , Asso:65445 , Asso:65446 , Asso:65447 , Asso:65448 , Asso:65449 , Asso:65450 , Asso:65451 , Asso:65452 , Asso:65453 , Asso:65454 , Asso:65455 , Asso:65456 . Chr.6 : Asso:65457 , Asso:65458 , Asso:65459 , Asso:65460 , Asso:65461 , Asso:65462 , Asso:65463 , Asso:65464 , Asso:65465 , Asso:65466 , Asso:65467 , Asso:65468 , Asso:65469 , Asso:65470 , Asso:65471 , Asso:65472 . Chr.8 : Asso:65473 , Asso:65474 , Asso:65475 , Asso:65476 , Asso:65477 . Chr.9 : Asso:65478 , Asso:65479 , Asso:65480 , Asso:65481 . Chr.10 : Asso:65482 , Asso:65483 , Asso:65484 , Asso:65485 , Asso:65486 , Asso:65487 , Asso:65488 , Asso:65489 , Asso:65490 , Asso:65491 , Asso:65492 , Asso:65493 . Chr.11 : Asso:65494 , Asso:65495 , Asso:65496 , Asso:65497 . Chr.12 : Asso:65498 , Asso:65499 , Asso:65500 , Asso:65501 . Chr.13 : Asso:65502 . Chr.14 : Asso:65503 , Asso:65504 , Asso:65505 , Asso:65506 , Asso:65507 , Asso:65508 , Asso:65509 , Asso:65510 , Asso:65511 . Chr.15 : Asso:65512 , Asso:65513 , Asso:65514 , Asso:65515 , Asso:65516 , Asso:65517 . Chr.16 : Asso:65518 . Chr.17 : Asso:65519 , Asso:65520 , Asso:65521 , Asso:65522 , Asso:65523 , Asso:65524 , Asso:65525 , Asso:65526 , Asso:65527 , Asso:65528 , Asso:65529 , Asso:65530 , Asso:65531 , Asso:65532 , Asso:65533 , Asso:65534 , Asso:65535 . Chr.18 : Asso:65536 , Asso:65537 , Asso:65538 , Asso:65539 . Chr.19 : Asso:65540 , Asso:65541 , Asso:65542 , Asso:65543 . Chr.20 : Asso:65544 , Asso:65545 , Asso:65546 , Asso:65547 , Asso:65548 , Asso:65549 , Asso:65550 , Asso:65551 , Asso:65552 , Asso:65553 , Asso:65554 , Asso:65555 , Asso:65556 , Asso:65557 , Asso:65558 , Asso:65559 , Asso:65560 , Asso:65561 , Asso:65562 , Asso:65563 , Asso:65564 , Asso:65565 , Asso:65566 , Asso:65567 , Asso:65568 , Asso:65569 , Asso:65570 , Asso:65571 , Asso:65572 , Asso:65573 , Asso:65574 , Asso:65575 , Asso:65576 , Asso:65577 , Asso:65578 , Asso:65579 , Asso:65580 , Asso:65581 , Asso:65582 , Asso:65583 , Asso:65584 , Asso:65585 , Asso:65586 , Asso:65587 , Asso:65588 , Asso:65589 , Asso:65590 , Asso:65591 , Asso:65592 , Asso:65593 , Asso:65594 , Asso:65595 , Asso:65596 , Asso:65597 , Asso:65598 , Asso:65599 , Asso:65600 , Asso:65601 , Asso:65602 , Asso:65603 , Asso:65604 , Asso:65605 , Asso:65606 , Asso:65607 . Chr.21 : Asso:65608 , Asso:65609 , Asso:65610 , Asso:65611 , Asso:65612 , Asso:65613 , Asso:65614 , Asso:65615 , Asso:65616 , Asso:65617 , Asso:65618 , Asso:65619 , Asso:65620 , Asso:65621 . Chr.22 : Asso:65622 , Asso:65623 , Asso:65624 , Asso:65625 , Asso:65626 , Asso:65627 , Asso:65628 , Asso:65629 . Chr.23 : Asso:65630 , Asso:65631 , Asso:65632 , Asso:65633 . Chr.24 : Asso:65634 , Asso:65635 , Asso:65636 , Asso:65637 , Asso:65638 , Asso:65639 , Asso:65640 , Asso:65641 , Asso:65642 , Asso:65643 , Asso:65644 , Asso:65645 , Asso:65646 . Chr.25 : Asso:65647 , Asso:65648 . Chr.26 : Asso:65649 . Chr.27 : Asso:65650 , Asso:65651 , Asso:65652 , Asso:65653 , Asso:65654 , Asso:65655 , Asso:65656 . Chr.28 : Asso:65657 , Asso:65658 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (12) ,
Chr.1 (11) ,
Chr.2 (17) ,
Chr.3 (7) ,
Chr.4 (21) ,
Chr.5 (32) ,
Chr.6 (59) ,
Chr.8 (20) ,
Chr.9 (6) ,
Chr.10 (13) ,
Chr.11 (11) ,
Chr.12 (8) ,
Chr.13 (2) ,
Chr.14 (9) ,
Chr.15 (7) ,
Chr.16 (4) ,
Chr.17 (19) ,
Chr.18 (8) ,
Chr.19 (13) ,
Chr.20 (66) ,
Chr.21 (16) ,
Chr.22 (15) ,
Chr.23 (12) ,
Chr.24 (15) ,
Chr.25 (2) ,
Chr.26 (1) ,
Chr.27 (20) ,
Chr.28 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
