Authors: Zhang J, Zhang Y, Gong H, Cui L, Ma J, Chen C, Ai H, Xiao S, Huang L, Yang B
(Contact: lushenghuang@hotmail.com; binyang@live.cn ) Affiliation: State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, China Title: Landscape of Loci and Candidate Genes for Muscle Fatty Acid Composition in Pigs Revealed by Multiple Population Association Analysis Journal: Frontiers In Genetics, 10:1067 (2020)
DOI :
10.3389/fgene.2019.01067 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Average chain length
Chr.2 : Asso:213842 . Chr.3 : Asso:213692 . Chr.4 : Asso:213693 . Chr.6 : Asso:213694 . Chr.7 : Asso:213695 . Chr.8 : Asso:213567 . Chr.12 : Asso:213568 , Asso:213696 . Chr.13 : Asso:213566 , Asso:213697 .
QTL for Myristic acid content
Chr.X : Asso:213570 , Asso:213703 . Chr.4 : Asso:213698 . Chr.6 : Asso:213699 . Chr.7 : Asso:213700 . Chr.9 : Asso:213701 . Chr.12 : Asso:213569 , Asso:213571 , Asso:213702 .
QTL for Palmitic acid content
Chr.X : Asso:213712 . Chr.2 : Asso:213704 . Chr.7 : Asso:213705 . Chr.8 : Asso:213706 . Chr.9 : Asso:213707 . Chr.11 : Asso:213708 . Chr.12 : Asso:213573 , Asso:213709 . Chr.14 : Asso:213572 , Asso:213710 . Chr.16 : Asso:213711 .
QTL for Palmitic acid to myristic acid ratio
Chr.6 : Asso:213713 . Chr.7 : Asso:213714 . Chr.9 : Asso:213575 , Asso:213715 . Chr.12 : Asso:213574 , Asso:213576 , Asso:213716 .
QTL for Palmitoleic acid content
Chr.6 : Asso:213717 . Chr.7 : Asso:213582 , Asso:213718 . Chr.8 : Asso:213577 , Asso:213579 , Asso:213581 , Asso:213719 . Chr.9 : Asso:213720 . Chr.12 : Asso:213580 , Asso:213721 . Chr.13 : Asso:213722 . Chr.14 : Asso:213578 , Asso:213723 , Asso:213843 .
QTL for Palmitoleic acid to palmitic acid ratio
Chr.4 : Asso:213724 . Chr.6 : Asso:213588 , Asso:213725 . Chr.8 : Asso:213583 , Asso:213585 , Asso:213587 , Asso:213726 . Chr.9 : Asso:213727 . Chr.12 : Asso:213586 , Asso:213728 . Chr.13 : Asso:213729 . Chr.14 : Asso:213584 , Asso:213730 , Asso:213844 .
QTL for Stearic acid content
Chr.1 : Asso:213589 . Chr.3 : Asso:213731 . Chr.4 : Asso:213732 , Asso:213845 , Asso:213846 . Chr.6 : Asso:213733 . Chr.12 : Asso:213591 . Chr.14 : Asso:213590 , Asso:213592 , Asso:213593 , Asso:213734 .
QTL for Stearic acid to palmitic acid ratio
Chr.4 : Asso:213735 . Chr.7 : Asso:213597 , Asso:213736 . Chr.8 : Asso:213594 , Asso:213737 . Chr.9 : Asso:213738 . Chr.12 : Asso:213596 , Asso:213739 . Chr.14 : Asso:213595 , Asso:213598 , Asso:213599 , Asso:213740 .
QTL for Oleic acid content
Chr.7 : Asso:213741 . Chr.8 : Asso:213742 . Chr.11 : Asso:213743 . Chr.12 : Asso:213600 , Asso:213744 . Chr.14 : Asso:213745 .
QTL for Oleic acid to palmitoleic acid ratio
Chr.7 : Asso:213601 , Asso:213607 , Asso:213746 . Chr.8 : Asso:213602 , Asso:213604 , Asso:213606 , Asso:213747 . Chr.9 : Asso:213748 . Chr.12 : Asso:213605 , Asso:213749 . Chr.13 : Asso:213750 . Chr.14 : Asso:213603 , Asso:213751 .
QTL for Oleic acid to stearic acid ratio
Chr.3 : Asso:213752 . Chr.4 : Asso:213609 , Asso:213753 . Chr.7 : Asso:213754 . Chr.9 : Asso:213755 . Chr.14 : Asso:213608 , Asso:213610 , Asso:213611 , Asso:213756 .
QTL for Linolenic acid content
Chr.6 : Asso:213759 . Chr.7 : Asso:213612 , Asso:213760 . Chr.9 : Asso:213761 . Chr.11 : Asso:213762 .
QTL for Arachidic acid content
Chr.5 : Asso:213763 . Chr.12 : Asso:213764 . Chr.15 : Asso:213617 , Asso:213765 . Chr.16 : Asso:213613 , Asso:213614 , Asso:213615 , Asso:213616 , Asso:213618 , Asso:213619 , Asso:213766 .
QTL for Arachidic acid to stearic acid ratio
Chr.5 : Asso:213625 , Asso:213767 . Chr.16 : Asso:213620 , Asso:213621 , Asso:213622 , Asso:213623 , Asso:213624 , Asso:213626 , Asso:213768 .
QTL for Cis-11-Eicosenoic acid content
Chr.3 : Asso:213630 , Asso:213769 . Chr.7 : Asso:213627 , Asso:213628 , Asso:213631 , Asso:213633 , Asso:213634 , Asso:213770 . Chr.12 : Asso:213632 , Asso:213771 . Chr.13 : Asso:213635 , Asso:213772 . Chr.16 : Asso:213629 , Asso:213773 .
QTL for Cis-11-Eicosenoic acid to oleic acid ratio
Chr.3 : Asso:213774 . Chr.7 : Asso:213636 , Asso:213637 , Asso:213639 , Asso:213640 , Asso:213641 , Asso:213775 . Chr.13 : Asso:213776 . Chr.16 : Asso:213638 , Asso:213777 .
QTL for Cis-11-Eicosenoic acid to arachidic acid ratio
Chr.2 : Asso:213778 . Chr.7 : Asso:213644 , Asso:213646 , Asso:213648 . Chr.10 : Asso:213779 . Chr.13 : Asso:213649 . Chr.14 : Asso:213780 . Chr.16 : Asso:213642 , Asso:213643 , Asso:213645 , Asso:213647 , Asso:213650 , Asso:213781 .
QTL for Eicosadienoic acid content
Chr.2 : Asso:213651 , Asso:213782 . Chr.4 : Asso:213653 . Chr.7 : Asso:213654 , Asso:213783 . Chr.12 : Asso:213652 , Asso:213784 .
QTL for Eicosadienoic acid to linoleic acid ratio
Chr.2 : Asso:213785 . Chr.3 : Asso:213786 . Chr.7 : Asso:213655 , Asso:213656 , Asso:213657 , Asso:213787 . Chr.12 : Asso:213788 .
QTL for Dihomo-gamma-linolenic acid content
Chr.2 : Asso:213658 , Asso:213659 , Asso:213789 . Chr.6 : Asso:213660 , Asso:213790 . Chr.9 : Asso:213791 . Chr.18 : Asso:213792 .
QTL for Dihomo-gamma-linolenic acid to linoleic acid ratio
Chr.2 : Asso:213661 , Asso:213662 , Asso:213793 .
QTL for Arachidonic acid to linoleic acid ratio
Chr.7 : Asso:213797 . Chr.9 : Asso:213798 . Chr.12 : Asso:213663 , Asso:213799 .
QTL for Arachidonic acid to eicosadienoic acid ratio
Chr.7 : Asso:213665 , Asso:213800 . Chr.8 : Asso:213664 . Chr.12 : Asso:213666 , Asso:213801 .
QTL for Arachidonic acid to dihomo-gamma-linolenic acid ratio
Chr.2 : Asso:213667 , Asso:213668 , Asso:213802 . Chr.9 : Asso:213669 , Asso:213803 . Chr.12 : Asso:213670 , Asso:213804 . Chr.17 : Asso:213805 .
QTL for Double-bond index
Chr.12 : Asso:213672 , Asso:213806 . Chr.14 : Asso:213671 , Asso:213807 .
QTL for Fatty acid atherogenic index
Chr.X : Asso:213676 . Chr.2 : Asso:213673 . Chr.8 : Asso:213808 . Chr.9 : Asso:213809 . Chr.12 : Asso:213675 , Asso:213810 . Chr.14 : Asso:213674 , Asso:213811 .
QTL for Fatty acid thrombogenic index
Chr.4 : Asso:213812 . Chr.5 : Asso:213813 . Chr.8 : Asso:213814 . Chr.9 : Asso:213815 . Chr.12 : Asso:213679 , Asso:213816 . Chr.14 : Asso:213677 , Asso:213678 , Asso:213817 .
QTL for Monounsaturated fatty acid content
Chr.4 : Asso:213818 . Chr.7 : Asso:213819 . Chr.12 : Asso:213820 . Chr.14 : Asso:213680 , Asso:213681 , Asso:213821 .
QTL for Monounsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio
Chr.4 : Asso:213683 , Asso:213822 . Chr.7 : Asso:213823 . Chr.12 : Asso:213824 . Chr.13 : Asso:213825 . Chr.14 : Asso:213682 , Asso:213684 , Asso:213826 .
QTL for Omega-3 fatty acid content
Chr.6 : Asso:213827 . Chr.7 : Asso:213685 , Asso:213828 . Chr.11 : Asso:213829 .
QTL for Saturated fatty acid content
Chr.X : Asso:213839 . Chr.4 : Asso:213835 . Chr.11 : Asso:213836 . Chr.12 : Asso:213687 , Asso:213688 , Asso:213837 . Chr.14 : Asso:213686 , Asso:213689 , Asso:213838 .
QTL for Unsaturated index
Chr.12 : Asso:213691 , Asso:213840 . Chr.14 : Asso:213690 , Asso:213841 .
QTL for Linoleic acid content
Chr.4 : Asso:213757 . Chr.7 : Asso:213758 .
QTL for Arachidonic acid content
Chr.4 : Asso:213794 . Chr.7 : Asso:213795 . Chr.9 : Asso:213796 .
QTL for Omega-6 fatty acid content
Chr.4 : Asso:213830 .
QTL for Polyunsaturated fatty acid content
Chr.4 : Asso:213831 . Chr.7 : Asso:213832 .
QTL for Polyunsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio
Chr.7 : Asso:213833 . Chr.16 : Asso:213834 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (5) ,
Chr.1 (1) ,
Chr.2 (16) ,
Chr.3 (7) ,
Chr.4 (19) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (11) ,
Chr.7 (47) ,
Chr.8 (20) ,
Chr.9 (17) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.11 (5) ,
Chr.12 (46) ,
Chr.13 (10) ,
Chr.14 (42) ,
Chr.15 (2) ,
Chr.16 (26) ,
Chr.17 (1) ,
Chr.18 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Zhang J, Zhang Y, Gong H, Cui L, Ma J, Chen C, Ai H, Xiao S, Huang L, Yang B (2020). Landscape of Loci and Candidate Genes for Muscle Fatty Acid Composition in Pigs Revealed by Multiple Population Association Analysis. Frontiers in Genetics, 10:1067;
Curated into QTLdb on 2020-10-07. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=KoXq2B2VrS
OR
Zhang J, Zhang Y, Gong H, Cui L, Ma J, Chen C, Ai H, Xiao S, Huang L, Yang B (2020). Landscape of Loci and Candidate Genes for Muscle Fatty Acid Composition in Pigs Revealed by Multiple Population Association Analysis. Frontiers in Genetics, 10:1067; DOI: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2019.01067
