Authors: Wang K, Liu D, Hernandez-Sanchez J, Chen J, Liu C, Wu Z, Fang M, Li N
(Contact: meiying@cau.edu.cn ) Affiliation: State Key Laboratory for Agrobiotechnology, China Agricultural University, Beijing, 100094, People's Republic of China Title: Genome Wide Association Analysis Reveals New Production Trait Genes in a Male Duroc Population Journal: PloS One, 10(9): e0139207 (2015)
DOI :
10.1371/journal.pone.0139207 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Days to 100 kg
Chr.2 : Asso:62176 , Asso:62177 , Asso:62178 , Asso:62278 , Asso:62279 , Asso:62280 , Asso:62281 , Asso:62282 , Asso:62283 , Asso:62284 , Asso:62285 , Asso:62295 . Chr.5 : Asso:62286 , Asso:62287 . Chr.6 : Asso:62179 , Asso:62180 , Asso:62181 , Asso:62288 , Asso:62289 , Asso:62290 . Chr.8 : Asso:62291 , Asso:62292 , Asso:62293 , Asso:62294 , Asso:62296 , Asso:62297 , Asso:62298 , Asso:62299 , Asso:62300 , Asso:62301 , Asso:62302 , Asso:62303 , Asso:62304 , Asso:62305 , Asso:62306 , Asso:62307 , Asso:62308 , Asso:62309 , Asso:62310 , Asso:62311 , Asso:62312 , Asso:62313 , Asso:62314 . Chr.11 : Asso:62315 , Asso:62316 , Asso:62317 , Asso:62318 , Asso:62319 , Asso:62320 , Asso:62321 , Asso:62322 , Asso:62323 , Asso:62324 , Asso:62325 , Asso:62326 , Asso:62327 , Asso:62328 , Asso:62329 , Asso:62330 , Asso:62331 . Chr.12 : Asso:62332 , Asso:62333 , Asso:62334 , Asso:62335 , Asso:62336 , Asso:62337 , Asso:62338 , Asso:62339 , Asso:62340 , Asso:62341 . Chr.13 : Asso:62342 , Asso:62343 , Asso:62344 , Asso:62345 . Chr.16 : Asso:62346 , Asso:62347 , Asso:62348 , Asso:62349 , Asso:62350 , Asso:62351 . Chr.18 : Asso:62352 , Asso:62353 .
QTL for Feed conversion ratio
Chr.4 : Asso:62182 , Asso:62183 , Asso:62209 , Asso:62210 , Asso:62211 , Asso:62212 , Asso:62213 , Asso:62214 , Asso:62215 , Asso:62216 , Asso:62217 , Asso:62218 . Chr.5 : Asso:62219 , Asso:62220 , Asso:62221 , Asso:62222 , Asso:62223 . Chr.7 : Asso:62224 . Chr.8 : Asso:62225 , Asso:62226 , Asso:62227 . Chr.9 : Asso:62228 , Asso:62229 , Asso:62230 , Asso:62231 . Chr.10 : Asso:62232 , Asso:62233 . Chr.15 : Asso:62184 , Asso:62185 , Asso:62234 , Asso:62235 , Asso:62236 , Asso:62237 , Asso:62238 , Asso:62239 , Asso:62240 , Asso:62241 , Asso:62242 , Asso:62243 , Asso:62244 , Asso:62245 , Asso:62246 , Asso:62247 , Asso:62248 , Asso:62249 , Asso:62250 , Asso:62251 , Asso:62252 , Asso:62253 , Asso:62254 , Asso:62255 , Asso:62256 , Asso:62257 , Asso:62258 , Asso:62259 . Chr.16 : Asso:62260 , Asso:62261 , Asso:62262 , Asso:62263 , Asso:62264 , Asso:62265 , Asso:62266 , Asso:62267 , Asso:62268 , Asso:62269 , Asso:62270 , Asso:62271 , Asso:62272 , Asso:62273 . Chr.17 : Asso:62274 , Asso:62275 , Asso:62276 . Chr.18 : Asso:62277 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : Asso:62186 , Asso:62187 , Asso:62188 . Chr.2 : Asso:62189 . Chr.5 : Asso:62190 , Asso:62191 , Asso:62192 . Chr.7 : Asso:62193 . Chr.8 : Asso:62194 , Asso:62195 , Asso:62196 , Asso:62197 , Asso:62198 , Asso:62199 , Asso:62200 , Asso:62201 . Chr.10 : Asso:62202 , Asso:62203 , Asso:62204 , Asso:62205 , Asso:62206 , Asso:62207 . Chr.18 : Asso:62208 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (3) ,
Chr.2 (13) ,
Chr.4 (12) ,
Chr.5 (10) ,
Chr.6 (6) ,
Chr.7 (2) ,
Chr.8 (34) ,
Chr.9 (4) ,
Chr.10 (8) ,
Chr.11 (17) ,
Chr.12 (10) ,
Chr.13 (4) ,
Chr.15 (28) ,
Chr.16 (20) ,
Chr.17 (3) ,
Chr.18 (4) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Wang K, Liu D, Hernandez-Sanchez J, Chen J, Liu C, Wu Z, Fang M, Li N (2015). Genome Wide Association Analysis Reveals New Production Trait Genes in a Male Duroc Population. PloS one, 10(9): e0139207;
Curated into QTLdb on 2015-10-06. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=NwUd3B4ClY
OR
Wang K, Liu D, Hernandez-Sanchez J, Chen J, Liu C, Wu Z, Fang M, Li N (2015). Genome Wide Association Analysis Reveals New Production Trait Genes in a Male Duroc Population. PloS one, 10(9): e0139207; DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0139207
