Authors: Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S
(Contact: Adavood.kolbehdari@monsanto.com ) Affiliation: Department of Agricultural, Food and Nutritional Science, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada Title: A whole genome scan to map QTL for milk production traits and somatic cell score in Canadian Holstein bulls Journal: Journal Of Animal Breeding And Genetics, 126(3): 216-27 (2009)
DOI :
10.1111/j.1439-0388.2008.00793.x Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk yield
Chr.1 : Asso:125113 , Asso:125114 , Asso:125115 , Asso:125116 . Chr.3 : Asso:125117 . Chr.5 : Asso:125118 , Asso:125119 , Asso:125120 . Chr.8 : Asso:125121 . Chr.9 : Asso:125122 . Chr.11 : Asso:125123 . Chr.14 : Asso:125124 , Asso:125125 , Asso:125126 , Asso:125127 . Chr.18 : Asso:125128 . Chr.19 : Asso:125129 . Chr.21 : Asso:125130 , Asso:125131 , Asso:125132 . Chr.23 : Asso:125133 .
QTL for Milk protein yield
Chr.1 : Asso:125134 , Asso:125135 . Chr.4 : Asso:125136 . Chr.7 : Asso:125137 . Chr.8 : Asso:125138 . Chr.9 : Asso:125139 . Chr.11 : Asso:125140 . Chr.14 : Asso:125141 . Chr.18 : Asso:125142 , Asso:125143 . Chr.21 : Asso:125144 , Asso:125145 . Chr.23 : Asso:125146 . Chr.26 : Asso:125147 . Chr.28 : Asso:125148 .
QTL for Milk fat yield
Chr.1 : Asso:125149 , Asso:125150 , Asso:125151 , Asso:125152 , Asso:125153 . Chr.4 : Asso:125154 . Chr.5 : Asso:125155 , Asso:125156 , Asso:125157 . Chr.7 : Asso:125158 . Chr.10 : Asso:125159 . Chr.11 : Asso:125160 . Chr.14 : Asso:125161 , Asso:125162 . Chr.21 : Asso:125163 . Chr.23 : Asso:125164 . Chr.24 : Asso:125165 . Chr.28 : Asso:125166 , Asso:125167 , Asso:125168 .
QTL for Milk protein percentage
Chr.3 : Asso:125169 . Chr.4 : Asso:125170 . Chr.5 : Asso:125171 , Asso:125172 . Chr.10 : Asso:125173 . Chr.13 : Asso:125174 . Chr.17 : Asso:125175 . Chr.22 : Asso:125176 . Chr.23 : Asso:125177 .
QTL for Milk fat percentage
Chr.3 : Asso:125178 , Asso:125179 . Chr.6 : Asso:125180 . Chr.9 : Asso:125181 , Asso:125182 . Chr.10 : Asso:125183 . Chr.14 : Asso:125184 , Asso:125185 , Asso:125186 , Asso:125187 , Asso:125188 , Asso:125189 . Chr.17 : Asso:125190 , Asso:125191 . Chr.21 : Asso:125192 , Asso:125193 . Chr.23 : Asso:125194 . Chr.26 : Asso:125195 .
QTL for Somatic cell score
Chr.1 : Asso:125196 . Chr.13 : Asso:125197 , Asso:125198 , Asso:125199 . Chr.18 : Asso:125200 , Asso:125201 . Chr.23 : Asso:125202 . Chr.26 : Asso:125203 , Asso:125204 . Chr.28 : Asso:125205 . Chr.29 : Asso:125206 .
QTL for Lactation persistency
Chr.1 : Asso:125207 . Chr.8 : Asso:125208 , Asso:125209 , Asso:125210 . Chr.11 : Asso:125211 . Chr.12 : Asso:125212 , Asso:125213 . Chr.15 : Asso:125214 . Chr.19 : Asso:125215 , Asso:125216 . Chr.23 : Asso:125217 . Chr.27 : Asso:125218 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (13) ,
Chr.3 (4) ,
Chr.4 (3) ,
Chr.5 (8) ,
Chr.6 (1) ,
Chr.7 (2) ,
Chr.8 (5) ,
Chr.9 (4) ,
Chr.10 (3) ,
Chr.11 (4) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.13 (4) ,
Chr.14 (13) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.17 (3) ,
Chr.18 (5) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.21 (8) ,
Chr.22 (1) ,
Chr.23 (7) ,
Chr.24 (1) ,
Chr.26 (4) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (5) ,
Chr.29 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S (2009). A whole genome scan to map QTL for milk production traits and somatic cell score in Canadian Holstein bulls. Journal of animal breeding and genetics, 126(3): 216-27;
Curated into QTLdb on 2017-02-01. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=PxYp6K1OpR
OR
Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S (2009). A whole genome scan to map QTL for milk production traits and somatic cell score in Canadian Holstein bulls. Journal of animal breeding and genetics, 126(3): 216-27; DOI: https://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2008.00793.x
