Authors:
Li J, Wu J, Jian Y, Zhuang Z, Qiu Y, Huang R, Lu P, Guan X, Huang X, Li S, Min L, Ye Y
(Contact: minli@gdaas.cn )
Affiliation:
Guangdong Guangken Animal Husbandry Group Co., Ltd., Guangzhou 510000, China
Title:
Genome-Wide Association Studies Revealed Significant QTLs and Candidate Genes Associated with Backfat and Loin Muscle Area in Pigs Using Imputation-Based Whole Genome Sequencing Data
Journal:
Animals : An Open Access Journal From MDPI, 12(21):2911 (2022)
DOI :
10.3390/ani12212911
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Subcutaneous fat thickness reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:262195 , Asso:262196 , Asso:262197 , Asso:262198 , Asso:262199 , Asso:262200 , Asso:262201 , Asso:262202 , Asso:262203 , Asso:262204 , Asso:262205 , Asso:262231 , Asso:262232 , Asso:262233 , Asso:262234 , Asso:262235 , Asso:262236 , Asso:262237 , Asso:262238 , Asso:262239 , Asso:262435 , Asso:262436 , Asso:262437 , Asso:262446 , Asso:262447 , Asso:262448 . Chr.5 : Asso:262123 , Asso:262124 , Asso:262125 , Asso:262126 , Asso:262127 , Asso:262128 , Asso:262129 , Asso:262130 , Asso:262131 , Asso:262132 , Asso:262133 , Asso:262134 , Asso:262135 , Asso:262136 , Asso:262137 , Asso:262138 , Asso:262139 , Asso:262140 , Asso:262141 , Asso:262142 , Asso:262143 , Asso:262144 , Asso:262145 , Asso:262146 , Asso:262147 , Asso:262148 , Asso:262149 , Asso:262150 , Asso:262151 , Asso:262152 , Asso:262153 , Asso:262154 , Asso:262155 , Asso:262156 , Asso:262157 , Asso:262158 , Asso:262159 , Asso:262160 , Asso:262161 , Asso:262162 , Asso:262163 , Asso:262164 , Asso:262165 , Asso:262166 , Asso:262167 , Asso:262168 , Asso:262169 , Asso:262170 , Asso:262171 , Asso:262172 , Asso:262173 , Asso:262174 , Asso:262175 , Asso:262176 , Asso:262177 , Asso:262178 , Asso:262179 , Asso:262180 , Asso:262181 , Asso:262182 , Asso:262183 , Asso:262184 , Asso:262185 , Asso:262186 , Asso:262187 , Asso:262188 , Asso:262189 , Asso:262190 , Asso:262191 , Asso:262192 , Asso:262193 , Asso:262194 , Asso:262206 , Asso:262207 , Asso:262208 , Asso:262209 , Asso:262210 , Asso:262211 , Asso:262212 , Asso:262213 , Asso:262214 , Asso:262215 , Asso:262216 , Asso:262217 , Asso:262218 , Asso:262219 , Asso:262220 , Asso:262221 , Asso:262222 , Asso:262223 , Asso:262224 , Asso:262225 , Asso:262226 , Asso:262227 , Asso:262228 , Asso:262229 , Asso:262230 , Asso:262418 , Asso:262419 , Asso:262420 , Asso:262421 , Asso:262422 , Asso:262423 , Asso:262424 , Asso:262425 , Asso:262426 , Asso:262427 , Asso:262428 , Asso:262429 , Asso:262430 , Asso:262431 , Asso:262432 , Asso:262433 , Asso:262434 , Asso:262438 , Asso:262439 , Asso:262440 , Asso:262441 , Asso:262442 , Asso:262443 , Asso:262444 , Asso:262445 .
QTL for Longissimus muscle area reported for chromosome(s):
Chr.6 : Asso:262240 , Asso:262241 , Asso:262242 , Asso:262243 , Asso:262244 , Asso:262245 , Asso:262246 , Asso:262247 , Asso:262248 , Asso:262249 , Asso:262250 , Asso:262251 , Asso:262252 , Asso:262253 , Asso:262254 , Asso:262255 , Asso:262256 , Asso:262257 , Asso:262258 , Asso:262259 , Asso:262260 , Asso:262261 , Asso:262262 , Asso:262263 , Asso:262264 , Asso:262265 , Asso:262266 , Asso:262267 , Asso:262268 , Asso:262269 , Asso:262270 , Asso:262271 , Asso:262272 , Asso:262273 , Asso:262274 , Asso:262275 , Asso:262276 , Asso:262277 , Asso:262278 , Asso:262279 , Asso:262280 , Asso:262281 , Asso:262282 , Asso:262283 , Asso:262284 , Asso:262285 , Asso:262286 , Asso:262287 , Asso:262288 , Asso:262289 , Asso:262290 , Asso:262291 , Asso:262292 , Asso:262293 , Asso:262294 , Asso:262295 , Asso:262296 , Asso:262297 , Asso:262298 , Asso:262299 , Asso:262300 , Asso:262301 , Asso:262302 , Asso:262303 , Asso:262304 , Asso:262305 , Asso:262306 , Asso:262307 , Asso:262308 , Asso:262309 , Asso:262310 , Asso:262311 , Asso:262312 , Asso:262313 , Asso:262314 , Asso:262315 , Asso:262316 , Asso:262317 , Asso:262318 , Asso:262319 , Asso:262320 , Asso:262321 , Asso:262322 , Asso:262323 , Asso:262324 , Asso:262325 , Asso:262326 , Asso:262327 , Asso:262328 , Asso:262329 , Asso:262330 , Asso:262331 , Asso:262332 , Asso:262333 , Asso:262334 , Asso:262335 , Asso:262336 , Asso:262337 , Asso:262338 , Asso:262339 , Asso:262340 , Asso:262341 , Asso:262342 , Asso:262343 , Asso:262344 , Asso:262345 , Asso:262346 , Asso:262347 , Asso:262348 , Asso:262349 , Asso:262350 , Asso:262351 , Asso:262352 , Asso:262353 , Asso:262354 , Asso:262355 , Asso:262356 , Asso:262357 , Asso:262358 , Asso:262359 , Asso:262360 , Asso:262361 , Asso:262362 , Asso:262363 , Asso:262364 , Asso:262365 , Asso:262366 , Asso:262367 , Asso:262368 , Asso:262369 , Asso:262370 , Asso:262371 , Asso:262372 , Asso:262373 , Asso:262374 , Asso:262375 , Asso:262376 , Asso:262377 , Asso:262378 , Asso:262379 , Asso:262380 , Asso:262381 , Asso:262382 , Asso:262383 , Asso:262384 , Asso:262385 , Asso:262386 , Asso:262387 , Asso:262388 , Asso:262389 , Asso:262390 , Asso:262391 , Asso:262392 , Asso:262393 , Asso:262394 , Asso:262395 , Asso:262396 , Asso:262397 , Asso:262398 , Asso:262399 , Asso:262400 , Asso:262401 , Asso:262402 , Asso:262403 , Asso:262404 , Asso:262405 , Asso:262406 , Asso:262407 , Asso:262408 , Asso:262409 , Asso:262410 , Asso:262411 , Asso:262412 , Asso:262413 , Asso:262414 , Asso:262415 , Asso:262416 , Asso:262417 , Asso:262449 , Asso:262450 , Asso:262451 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Li J, Wu J, Jian Y, Zhuang Z, Qiu Y, Huang R, Lu P, Guan X, Huang X, Li S, Min L, Ye Y (2022). Genome-Wide Association Studies Revealed Significant QTLs and Candidate Genes Associated with Backfat and Loin Muscle Area in Pigs Using Imputation-Based Whole Genome Sequencing Data. Animals : an open access journal from MDPI, 12(21):2911;
Curated into QTLdb on 2022-12-08. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=SbKh5H6ExU
OR
Li J, Wu J, Jian Y, Zhuang Z, Qiu Y, Huang R, Lu P, Guan X, Huang X, Li S, Min L, Ye Y (2022). Genome-Wide Association Studies Revealed Significant QTLs and Candidate Genes Associated with Backfat and Loin Muscle Area in Pigs Using Imputation-Based Whole Genome Sequencing Data. Animals : an open access journal from MDPI, 12(21):2911; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/ani12212911