Authors: Höglund JK, Sahana G, Guldbrandtsen B, Lund MS
(Contact: Johanna.hoglund@agrsci.dk ) Affiliation: Faculty of Science and Technology, Department of Molecular Biology and Genetics, Aarhus University, P,O, Box 50, DK-8830 Tjele, Denmark Title: Validation of associations for female fertility traits in Nordic Holstein, Nordic Red and Jersey dairy cattle Journal: BMC Genetics, 15: 8 (2014)
DOI :
10.1186/1471-2156-15-8 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Inseminations per conception
Chr.1 : Asso:28543 , Asso:28545 , Asso:28549 , Asso:28553 , Asso:28557 , Asso:28568 , Asso:28584 , Asso:28627 . Chr.3 : Asso:28583 , Asso:28607 . Chr.4 : Asso:28537 , Asso:28558 , Asso:28573 , Asso:28579 , Asso:28600 , Asso:28616 . Chr.7 : Asso:28587 , Asso:28617 , Asso:28647 . Chr.8 : Asso:28638 . Chr.9 : Asso:28602 , Asso:28604 , Asso:28662 . Chr.10 : Asso:28590 . Chr.11 : Asso:28679 .
QTL for Fertility index
Chr.1 : Asso:28547 , Asso:28550 , Asso:28552 , Asso:28555 , Asso:28585 , Asso:28599 . Chr.3 : Asso:28542 , Asso:28608 , Asso:28612 , Asso:28675 . Chr.4 : Asso:28580 , Asso:28594 . Chr.7 : Asso:28538 , Asso:28588 , Asso:28648 , Asso:28668 . Chr.8 : Asso:28563 , Asso:28619 , Asso:28636 , Asso:28639 . Chr.9 : Asso:28640 , Asso:28646 , Asso:28660 , Asso:28682 . Chr.10 : Asso:28670 . Chr.11 : Asso:28606 , Asso:28654 . Chr.12 : Asso:28653 . Chr.13 : Asso:28633 . Chr.20 : Asso:28592 . Chr.23 : Asso:28571 . Chr.24 : Asso:28625 , Asso:28645 , Asso:28677 .
QTL for Interval from first to last insemination
Chr.1 : Asso:28544 , Asso:28551 , Asso:28570 , Asso:28586 , Asso:28626 , Asso:28628 . Chr.4 : Asso:28574 , Asso:28634 . Chr.6 : Asso:28546 . Chr.7 : Asso:28539 , Asso:28589 , Asso:28618 , Asso:28649 , Asso:28664 , Asso:28669 . Chr.8 : Asso:28637 . Chr.9 : Asso:28578 , Asso:28603 , Asso:28641 . Chr.11 : Asso:28564 , Asso:28655 . Chr.12 : Asso:28597 . Chr.14 : Asso:28622 . Chr.15 : Asso:28656 . Chr.22 : Asso:28565 , Asso:28650 . Chr.23 : Asso:28572 , Asso:28651 .
QTL for Non-return rate
Chr.1 : Asso:28554 , Asso:28566 , Asso:28595 , Asso:28598 . Chr.2 : Asso:28569 . Chr.3 : Asso:28613 , Asso:28615 , Asso:28630 , Asso:28658 . Chr.4 : Asso:28561 , Asso:28601 , Asso:28632 , Asso:28642 . Chr.5 : Asso:28577 , Asso:28593 , Asso:28674 . Chr.8 : Asso:28540 , Asso:28560 , Asso:28581 , Asso:28623 . Chr.9 : Asso:28620 , Asso:28631 , Asso:28659 . Chr.11 : Asso:28609 , Asso:28611 , Asso:28661 , Asso:28671 , Asso:28673 . Chr.13 : Asso:28624 , Asso:28657 , Asso:28663 . Chr.14 : Asso:28567 . Chr.16 : Asso:28665 . Chr.17 : Asso:28676 . Chr.22 : Asso:28643 . Chr.23 : Asso:28559 , Asso:28591 , Asso:28610 .
QTL for Interval to first estrus after calving
Chr.1 : Asso:28556 . Chr.4 : Asso:28681 . Chr.5 : Asso:28576 . Chr.9 : Asso:28541 , Asso:28666 . Chr.10 : Asso:28562 , Asso:28575 , Asso:28605 , Asso:28652 , Asso:28678 . Chr.11 : Asso:28582 . Chr.12 : Asso:28621 . Chr.13 : Asso:28548 , Asso:28644 , Asso:28667 , Asso:28672 , Asso:28680 . Chr.14 : Asso:28614 . Chr.18 : Asso:28629 . Chr.23 : Asso:28635 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (25) ,
Chr.2 (1) ,
Chr.3 (10) ,
Chr.4 (15) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (1) ,
Chr.7 (13) ,
Chr.8 (10) ,
Chr.9 (15) ,
Chr.10 (7) ,
Chr.11 (11) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (9) ,
Chr.14 (3) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.16 (1) ,
Chr.17 (1) ,
Chr.18 (1) ,
Chr.20 (1) ,
Chr.22 (3) ,
Chr.23 (7) ,
Chr.24 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Höglund JK, Sahana G, Guldbrandtsen B, Lund MS (2014). Validation of associations for female fertility traits in Nordic Holstein, Nordic Red and Jersey dairy cattle. BMC genetics, 15: 8;
Curated into QTLdb on 2014-08-13. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=SoUd7W0MaQ
OR
Höglund JK, Sahana G, Guldbrandtsen B, Lund MS (2014). Validation of associations for female fertility traits in Nordic Holstein, Nordic Red and Jersey dairy cattle. BMC genetics, 15: 8; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/1471-2156-15-8
