Authors: Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S
(Contact: zhiquan@ualberta.ca ) Affiliation: Department of Agricultural, Food and Nutritional Science, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada T6G 2P5 Title: A whole-genome scan to map quantitative trait loci for conformation and functional traits in Canadian Holstein bulls Journal: Journal Of Dairy Science, 91(7): 2844-56 (2008)
DOI :
10.3168/jds.2007-0585 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Conformation score
Chr.4 : Asso:125855 . Chr.18 : Asso:125856 . Chr.21 : Asso:125857 . Chr.23 : Asso:125858 , Asso:125859 .
QTL for Udder structure
Chr.5 : Asso:125860 . Chr.18 : Asso:125861 . Chr.28 : Asso:125862 .
QTL for Feet and leg conformation
Chr.1 : Asso:125863 , Asso:125864 , Asso:125865 , Asso:125866 . Chr.2 : Asso:125867 . Chr.4 : Asso:125868 . Chr.10 : Asso:125869 , Asso:125870 , Asso:125871 . Chr.13 : Asso:125872 . Chr.14 : Asso:125873 , Asso:125874 . Chr.21 : Asso:125875 . Chr.22 : Asso:125876 , Asso:125877 . Chr.23 : Asso:125878 , Asso:125879 . Chr.27 : Asso:125880 , Asso:125881 .
QTL for Dairy capacity composite index
Chr.3 : Asso:125882 , Asso:125883 . Chr.5 : Asso:125884 , Asso:125885 , Asso:125886 , Asso:125887 , Asso:125888 , Asso:125889 , Asso:125890 , Asso:125891 . Chr.7 : Asso:125892 , Asso:125893 , Asso:125894 . Chr.10 : Asso:125895 . Chr.21 : Asso:125896 , Asso:125897 . Chr.25 : Asso:125898 . Chr.26 : Asso:125899 .
QTL for Rump conformation
Chr.2 : Asso:125900 . Chr.3 : Asso:125901 . Chr.7 : Asso:125903 . Chr.8 : Asso:125904 , Asso:125905 . Chr.11 : Asso:125906 . Chr.17 : Asso:125902 . Chr.18 : Asso:125907 . Chr.25 : Asso:125908 , Asso:125909 , Asso:125910 , Asso:125911 . Chr.27 : Asso:125912 .
QTL for Udder texture
Chr.3 : Asso:125913 . Chr.5 : Asso:125914 , Asso:125915 , Asso:125916 , Asso:125917 . Chr.25 : Asso:125918 . Chr.27 : Asso:125919 .
QTL for Udder cleft
Chr.2 : Asso:125920 , Asso:125921 . Chr.4 : Asso:125922 . Chr.5 : Asso:125923 . Chr.13 : Asso:125924 . Chr.22 : Asso:125925 . Chr.23 : Asso:125926 . Chr.25 : Asso:125927 , Asso:125928 .
QTL for Foot angle
Chr.1 : Asso:125929 . Chr.4 : Asso:125930 . Chr.5 : Asso:125931 , Asso:125932 . Chr.7 : Asso:125933 . Chr.10 : Asso:125934 , Asso:125935 , Asso:125936 , Asso:125937 , Asso:125938 . Chr.16 : Asso:125939 .
QTL for Bone quality
Chr.1 : Asso:125940 . Chr.3 : Asso:125941 . Chr.5 : Asso:125942 . Chr.7 : Asso:125943 , Asso:125944 , Asso:125945 , Asso:125946 . Chr.10 : Asso:125947 . Chr.11 : Asso:125948 . Chr.13 : Asso:125949 . Chr.14 : Asso:125950 . Chr.19 : Asso:125951 , Asso:125952 . Chr.21 : Asso:125953 , Asso:125954 . Chr.22 : Asso:125955 . Chr.23 : Asso:125956 . Chr.25 : Asso:125957 . Chr.26 : Asso:125958 . Chr.27 : Asso:125959 .
QTL for Stature
Chr.1 : Asso:125960 . Chr.3 : Asso:125961 . Chr.4 : Asso:125962 . Chr.5 : Asso:125963 , Asso:125964 . Chr.7 : Asso:125965 . Chr.11 : Asso:125966 . Chr.19 : Asso:125967 . Chr.24 : Asso:125968 .
QTL for Angularity
Chr.3 : Asso:125969 . Chr.5 : Asso:125970 , Asso:125971 , Asso:125972 , Asso:125974 . Chr.7 : Asso:125973 , Asso:125975 , Asso:125976 . Chr.26 : Asso:125977 . Chr.28 : Asso:125978 . Chr.29 : Asso:125979 .
QTL for Length of productive life
Chr.2 : Asso:125980 . Chr.3 : Asso:125981 . Chr.7 : Asso:125982 . Chr.9 : Asso:125983 , Asso:125984 . Chr.11 : Asso:125985 , Asso:125986 . Chr.12 : Asso:125987 . Chr.20 : Asso:125988 , Asso:125989 , Asso:125990 , Asso:125991 . Chr.22 : Asso:125992 , Asso:125993 , Asso:125994 . Chr.23 : Asso:125995 .
QTL for Fertility index
Chr.2 : Asso:125996 , Asso:125997 . Chr.4 : Asso:125998 . Chr.11 : Asso:125999 , Asso:126000 . Chr.12 : Asso:126001 . Chr.14 : Asso:126002 . Chr.19 : Asso:126003 . Chr.20 : Asso:126004 . Chr.22 : Asso:126005 , Asso:126006 , Asso:126007 , Asso:126008 . Chr.23 : Asso:126009 . Chr.27 : Asso:126010 . Chr.29 : Asso:126011 .
QTL for Milking speed
Chr.1 : Asso:126012 , Asso:126013 . Chr.19 : Asso:126014 . Chr.26 : Asso:126015 . Chr.27 : Asso:126016 .
QTL for Temperament
Chr.4 : Asso:126017 . Chr.13 : Asso:126018 . Chr.22 : Asso:126019 . Chr.23 : Asso:126020 . Chr.26 : Asso:126021 . Chr.29 : Asso:126022 , Asso:126023 , Asso:126024 , Asso:126025 .
QTL for Calving ease
Chr.6 : Asso:126026 . Chr.7 : Asso:126034 . Chr.8 : Asso:126027 . Chr.9 : Asso:126035 . Chr.11 : Asso:126028 . Chr.18 : Asso:126029 . Chr.21 : Asso:126030 , Asso:126031 . Chr.23 : Asso:126032 , Asso:126033 , Asso:126036 . Chr.24 : Asso:126037 . Chr.28 : Asso:126038 , Asso:126039 . Chr.29 : Asso:126040 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (9) ,
Chr.2 (7) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (7) ,
Chr.5 (23) ,
Chr.6 (1) ,
Chr.7 (15) ,
Chr.8 (3) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (10) ,
Chr.11 (8) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.13 (4) ,
Chr.14 (4) ,
Chr.16 (1) ,
Chr.17 (1) ,
Chr.18 (4) ,
Chr.19 (5) ,
Chr.20 (5) ,
Chr.21 (8) ,
Chr.22 (12) ,
Chr.23 (12) ,
Chr.24 (2) ,
Chr.25 (9) ,
Chr.26 (5) ,
Chr.27 (7) ,
Chr.28 (4) ,
Chr.29 (7) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S (2008). A whole-genome scan to map quantitative trait loci for conformation and functional traits in Canadian Holstein bulls. Journal of dairy science, 91(7): 2844-56;
Curated into QTLdb on 2017-03-13. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=SxMc4B9WkP
OR
Kolbehdari D, Wang Z, Grant J R, Murdoch B, Prasad A, Xiu Z, Marques E, Stothard P, Moore S S (2008). A whole-genome scan to map quantitative trait loci for conformation and functional traits in Canadian Holstein bulls. Journal of dairy science, 91(7): 2844-56; DOI: https://dx.doi.org/10.3168/jds.2007-0585
