Authors: Volkova NA, Romanov MN, Vetokh AN, Larionova PV, Volkova LA, Abdelmanova AS, Sermyagin AA, Griffin DK, Zinovieva NA
(Contact: m.romanov@kent.ac.uk ) Affiliation: L. K. Ernst Federal Research Center for Animal Husbandry, Dubrovitsy, Podolsk 142132, Moscow Oblast, Russia Title: Genome-Wide Association Study Reveals the Genetic Architecture of Growth and Meat Production Traits in a Chicken F2 Resource Population Journal: Genes, 15(10):1246 (2024)
DOI :
10.3390/genes15101246 Links:
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QTL for Body weight gain
Chr.1 : Asso:315328 , Asso:315329 , Asso:315330 , Asso:315331 , Asso:315332 , Asso:315333 , Asso:315334 , Asso:315335 , Asso:315336 , Asso:315337 , Asso:315338 , Asso:315339 , Asso:315340 , Asso:315341 , Asso:315342 . Chr.2 : Asso:315343 , Asso:315344 , Asso:315345 , Asso:315346 , Asso:315347 , Asso:315348 , Asso:315349 , Asso:315350 , Asso:315351 , Asso:315352 , Asso:315353 , Asso:315354 , Asso:315355 , Asso:315356 , Asso:315357 , Asso:315358 , Asso:315359 , Asso:315360 , Asso:315361 , Asso:315362 , Asso:315363 , Asso:315364 , Asso:315365 , Asso:315366 , Asso:315367 , Asso:315368 , Asso:315369 , Asso:315370 , Asso:315371 , Asso:315372 , Asso:315373 , Asso:315374 , Asso:315375 . Chr.3 : Asso:315376 , Asso:315377 , Asso:315378 , Asso:315379 , Asso:315380 , Asso:315381 , Asso:315382 , Asso:315383 , Asso:315384 , Asso:315385 , Asso:315386 , Asso:315387 . Chr.4 : Asso:315388 , Asso:315389 , Asso:315390 , Asso:315391 , Asso:315392 , Asso:315393 , Asso:315394 , Asso:315395 , Asso:315396 , Asso:315397 , Asso:315398 , Asso:315399 , Asso:315400 , Asso:315646 . Chr.5 : Asso:315401 , Asso:315402 , Asso:315403 , Asso:315404 , Asso:315405 , Asso:315406 , Asso:315407 . Chr.6 : Asso:315408 . Chr.7 : Asso:315409 , Asso:315410 , Asso:315411 , Asso:315412 , Asso:315413 , Asso:315414 . Chr.8 : Asso:315415 , Asso:315416 . Chr.9 : Asso:315417 . Chr.10 : Asso:315418 , Asso:315419 , Asso:315420 , Asso:315421 , Asso:315422 , Asso:315423 , Asso:315424 . Chr.11 : Asso:315425 , Asso:315426 , Asso:315427 , Asso:315428 , Asso:315429 , Asso:315430 , Asso:315431 . Chr.12 : Asso:315432 , Asso:315433 , Asso:315434 . Chr.13 : Asso:315435 , Asso:315436 , Asso:315437 , Asso:315438 , Asso:315439 , Asso:315440 , Asso:315441 , Asso:315442 , Asso:315443 , Asso:315444 , Asso:315445 , Asso:315446 . Chr.14 : Asso:315447 . Chr.15 : Asso:315448 , Asso:315449 . Chr.17 : Asso:315450 . Chr.18 : Asso:315451 , Asso:315452 , Asso:315453 , Asso:315454 . Chr.20 : Asso:315455 . Chr.21 : Asso:315456 . Chr.22 : Asso:315647 . Chr.23 : Asso:315457 . Chr.24 : Asso:315458 , Asso:315459 , Asso:315460 , Asso:315461 . Chr.25 : Asso:315462 , Asso:315463 . Chr.26 : Asso:315464 , Asso:315465 . Chr.27 : Asso:315466 . Chr.28 : Asso:315467 , Asso:315468 , Asso:315469 , Asso:315470 , Asso:315471 , Asso:315472 , Asso:315473 .
QTL for Breast weight
Chr.1 : Asso:315474 . Chr.2 : Asso:315475 . Chr.3 : Asso:315476 . Chr.4 : Asso:315477 , Asso:315478 . Chr.7 : Asso:315479 , Asso:315480 . Chr.8 : Asso:315481 . Chr.9 : Asso:315482 , Asso:315483 . Chr.15 : Asso:315484 . Chr.18 : Asso:315485 . Chr.19 : Asso:315486 . Chr.23 : Asso:315487 . Chr.27 : Asso:315488 , Asso:315489 .
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:315492 , Asso:315493 , Asso:315494 , Asso:315495 , Asso:315496 , Asso:315526 , Asso:315527 , Asso:315528 , Asso:315529 , Asso:315530 , Asso:315531 , Asso:315532 , Asso:315533 , Asso:315534 , Asso:315535 . Chr.2 : Asso:315490 , Asso:315497 , Asso:315498 , Asso:315499 , Asso:315500 , Asso:315501 , Asso:315502 , Asso:315503 , Asso:315504 , Asso:315536 , Asso:315537 , Asso:315538 , Asso:315539 , Asso:315540 , Asso:315541 , Asso:315542 , Asso:315543 , Asso:315544 , Asso:315545 , Asso:315546 , Asso:315547 , Asso:315548 , Asso:315549 , Asso:315550 , Asso:315551 . Chr.3 : Asso:315552 , Asso:315553 , Asso:315554 , Asso:315555 . Chr.4 : Asso:315556 , Asso:315557 , Asso:315558 , Asso:315559 , Asso:315560 , Asso:315561 , Asso:315562 , Asso:315563 , Asso:315648 . Chr.5 : Asso:315564 , Asso:315565 , Asso:315566 . Chr.6 : Asso:315491 , Asso:315505 . Chr.7 : Asso:315506 , Asso:315507 , Asso:315508 , Asso:315509 , Asso:315510 , Asso:315511 , Asso:315567 , Asso:315568 , Asso:315569 , Asso:315570 , Asso:315571 . Chr.8 : Asso:315512 , Asso:315572 , Asso:315573 . Chr.10 : Asso:315574 , Asso:315575 , Asso:315576 . Chr.11 : Asso:315513 , Asso:315514 , Asso:315577 . Chr.13 : Asso:315515 , Asso:315516 , Asso:315578 , Asso:315579 , Asso:315580 , Asso:315581 , Asso:315582 , Asso:315583 , Asso:315584 , Asso:315585 . Chr.14 : Asso:315517 , Asso:315586 . Chr.15 : Asso:315587 . Chr.17 : Asso:315588 . Chr.21 : Asso:315518 , Asso:315589 . Chr.23 : Asso:315519 , Asso:315590 . Chr.27 : Asso:315591 . Chr.28 : Asso:315520 , Asso:315521 , Asso:315522 , Asso:315523 , Asso:315524 , Asso:315525 , Asso:315592 , Asso:315593 .
QTL for Carcass weight
Chr.1 : Asso:315594 , Asso:315595 . Chr.2 : Asso:315596 . Chr.3 : Asso:315597 . Chr.4 : Asso:315598 , Asso:315599 . Chr.5 : Asso:315600 , Asso:315601 . Chr.6 : Asso:315602 . Chr.7 : Asso:315603 , Asso:315604 , Asso:315605 . Chr.8 : Asso:315606 . Chr.9 : Asso:315607 , Asso:315608 , Asso:315609 . Chr.13 : Asso:315610 , Asso:315611 , Asso:315612 , Asso:315613 , Asso:315614 . Chr.15 : Asso:315615 . Chr.17 : Asso:315616 . Chr.18 : Asso:315617 . Chr.19 : Asso:315618 . Chr.23 : Asso:315619 . Chr.24 : Asso:315620 , Asso:315621 , Asso:315622 . Chr.27 : Asso:315623 .
QTL for Drumstick weight
Chr.1 : Asso:315624 . Chr.2 : Asso:315625 . Chr.4 : Asso:315626 , Asso:315627 . Chr.5 : Asso:315628 , Asso:315629 . Chr.7 : Asso:315630 , Asso:315631 , Asso:315632 , Asso:315633 . Chr.9 : Asso:315634 , Asso:315635 , Asso:315636 . Chr.13 : Asso:315637 . Chr.15 : Asso:315638 . Chr.17 : Asso:315639 , Asso:315640 . Chr.18 : Asso:315641 . Chr.19 : Asso:315642 . Chr.23 : Asso:315643 . Chr.26 : Asso:315644 .
QTL for Thigh weight
Chr.10 : Asso:315645 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (34) ,
Chr.2 (61) ,
Chr.3 (18) ,
Chr.4 (29) ,
Chr.5 (14) ,
Chr.6 (4) ,
Chr.7 (26) ,
Chr.8 (7) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (11) ,
Chr.11 (10) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (28) ,
Chr.14 (3) ,
Chr.15 (6) ,
Chr.17 (5) ,
Chr.18 (7) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.20 (1) ,
Chr.21 (3) ,
Chr.22 (1) ,
Chr.23 (6) ,
Chr.24 (7) ,
Chr.25 (2) ,
Chr.26 (3) ,
Chr.27 (5) ,
Chr.28 (15) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Volkova NA, Romanov MN, Vetokh AN, Larionova PV, Volkova LA, Abdelmanova AS, Sermyagin AA, Griffin DK, Zinovieva NA (2024). Genome-Wide Association Study Reveals the Genetic Architecture of Growth and Meat Production Traits in a Chicken F2 Resource Population. Genes, 15(10):1246;
Curated into QTLdb on 2025-04-08. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=TnYo3E7YkX
OR
Volkova NA, Romanov MN, Vetokh AN, Larionova PV, Volkova LA, Abdelmanova AS, Sermyagin AA, Griffin DK, Zinovieva NA (2024). Genome-Wide Association Study Reveals the Genetic Architecture of Growth and Meat Production Traits in a Chicken F2 Resource Population. Genes, 15(10):1246; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/genes15101246
