Authors: Fowler KE, Pong-Wong R, Bauer J, Clemente EJ, Reitter CP, Affara NA, Waite S, Walling GA, Griffin DK
(Contact: d.k.griffin@kent.ac.uk ) Affiliation: School of Biosciences, University of Kent, Canterbury, Kent CT2 7NH, UK Title: Genome wide analysis reveals single nucleotide polymorphisms associated with fatness and putative novel copy number variants in three pig breeds Journal: BMC Genomics, 14: 784 (2013)
DOI :
10.1186/1471-2164-14-784 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.1 : Asso:31233 , Asso:31234 , Asso:31235 , Asso:31236 , Asso:31237 , Asso:121914 . Chr.2 : Asso:31238 . Chr.3 : Asso:31220 , Asso:31239 , Asso:31240 , Asso:31241 , Asso:31287 . Chr.4 : Asso:31228 , Asso:31230 , Asso:31242 , Asso:31243 , Asso:121907 , Asso:121908 , Asso:121915 . Chr.5 : Asso:31216 , Asso:31244 , Asso:31245 , Asso:121909 . Chr.6 : Asso:31246 , Asso:31247 , Asso:31248 , Asso:121905 . Chr.7 : Asso:31231 , Asso:31232 , Asso:31275 , Asso:31276 , Asso:31277 , Asso:31278 . Chr.8 : Asso:31218 , Asso:31249 , Asso:31250 , Asso:31288 . Chr.9 : Asso:31219 , Asso:31221 , Asso:31251 , Asso:31252 , Asso:31289 . Chr.10 : Asso:31225 , Asso:31290 . Chr.12 : Asso:31224 , Asso:31229 , Asso:31253 , Asso:31254 , Asso:31255 , Asso:31256 . Chr.13 : Asso:31223 , Asso:31227 , Asso:31257 , Asso:31258 , Asso:31259 , Asso:31260 , Asso:31261 , Asso:31262 , Asso:31263 , Asso:31264 , Asso:31265 , Asso:31291 , Asso:31292 , Asso:31293 . Chr.14 : Asso:31226 , Asso:31266 , Asso:31267 , Asso:31268 , Asso:121904 , Asso:121906 , Asso:121910 , Asso:121912 . Chr.15 : Asso:31222 , Asso:31269 , Asso:31270 , Asso:31271 , Asso:31279 , Asso:31280 , Asso:31281 , Asso:31282 , Asso:31283 , Asso:31284 , Asso:31286 , Asso:31294 , Asso:121911 , Asso:121913 . Chr.16 : Asso:31217 , Asso:31285 , Asso:31296 . Chr.17 : Asso:31272 , Asso:31273 , Asso:31274 , Asso:31295 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (6) ,
Chr.2 (1) ,
Chr.3 (5) ,
Chr.4 (7) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (4) ,
Chr.7 (6) ,
Chr.8 (4) ,
Chr.9 (5) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.12 (6) ,
Chr.13 (14) ,
Chr.14 (8) ,
Chr.15 (14) ,
Chr.16 (3) ,
Chr.17 (4) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Fowler KE, Pong-Wong R, Bauer J, Clemente EJ, Reitter CP, Affara NA, Waite S, Walling GA, Griffin DK (2013). Genome wide analysis reveals single nucleotide polymorphisms associated with fatness and putative novel copy number variants in three pig breeds. BMC genomics, 14: 784;
Curated into QTLdb on 2014-11-04. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=VcVv2D1HiE
OR
Fowler KE, Pong-Wong R, Bauer J, Clemente EJ, Reitter CP, Affara NA, Waite S, Walling GA, Griffin DK (2013). Genome wide analysis reveals single nucleotide polymorphisms associated with fatness and putative novel copy number variants in three pig breeds. BMC genomics, 14: 784; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-14-784
