Authors: Yu H, Yu S, Guo J, Cheng G, Mei C, Zan L
(Contact: zanlinsen@163.com ) Affiliation: College of Animal Science and Technology, Northwest A&F University, Xianyang 712100, China. Title: Genome-Wide Association Study Reveals Novel Loci Associated with Body Conformation Traits in Qinchuan Cattle. Journal: Animals : An Open Access Journal From MDPI, 13(23):3628 (2023)
DOI :
10.3390/ani13233628 Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body weight
Chr.21 : Asso:287137 .
QTL for Body height
Chr.1 : Asso:287165 . Chr.2 : Asso:287170 , Asso:287171 , Asso:287172 . Chr.3 : Asso:287373 . Chr.5 : Asso:287173 , Asso:287174 , Asso:287311 . Chr.7 : Asso:287312 , Asso:287374 . Chr.8 : Asso:287313 , Asso:287314 , Asso:287315 , Asso:287316 , Asso:287317 , Asso:287318 , Asso:287319 , Asso:287320 , Asso:287321 , Asso:287322 , Asso:287323 , Asso:287380 , Asso:287381 , Asso:287382 . Chr.11 : Asso:287175 , Asso:287176 . Chr.12 : Asso:287177 . Chr.17 : Asso:287166 , Asso:287324 . Chr.18 : Asso:287167 . Chr.20 : Asso:287168 , Asso:287178 . Chr.21 : Asso:287138 , Asso:287139 , Asso:287140 , Asso:287141 , Asso:287142 , Asso:287143 , Asso:287144 , Asso:287145 , Asso:287146 , Asso:287147 , Asso:287148 , Asso:287149 , Asso:287150 , Asso:287151 , Asso:287152 , Asso:287153 , Asso:287154 , Asso:287155 , Asso:287156 , Asso:287157 , Asso:287158 , Asso:287159 , Asso:287160 , Asso:287161 , Asso:287162 , Asso:287163 , Asso:287164 , Asso:287179 . Chr.22 : Asso:287169 . Chr.26 : Asso:287180 , Asso:287325 , Asso:287326 . Chr.27 : Asso:287181 , Asso:287182 , Asso:287183 .
QTL for Body depth
Chr.1 : Asso:287184 , Asso:287185 , Asso:287186 , Asso:287187 , Asso:287188 . Chr.2 : Asso:287189 , Asso:287190 , Asso:287191 , Asso:287192 , Asso:287193 , Asso:287194 , Asso:287195 , Asso:287196 . Chr.3 : Asso:287197 . Chr.4 : Asso:287198 , Asso:287199 , Asso:287200 , Asso:287201 , Asso:287202 , Asso:287203 , Asso:287204 , Asso:287205 . Chr.5 : Asso:287206 , Asso:287207 , Asso:287208 , Asso:287209 . Chr.7 : Asso:287210 , Asso:287211 , Asso:287212 , Asso:287213 , Asso:287214 . Chr.8 : Asso:287215 , Asso:287216 . Chr.9 : Asso:287217 , Asso:287218 . Chr.10 : Asso:287219 , Asso:287220 , Asso:287221 . Chr.12 : Asso:287222 , Asso:287223 , Asso:287224 , Asso:287225 , Asso:287226 . Chr.13 : Asso:287227 . Chr.14 : Asso:287228 . Chr.15 : Asso:287229 , Asso:287230 . Chr.16 : Asso:287231 , Asso:287232 , Asso:287233 . Chr.17 : Asso:287234 , Asso:287235 . Chr.19 : Asso:287236 . Chr.20 : Asso:287237 , Asso:287238 . Chr.21 : Asso:287239 . Chr.22 : Asso:287240 . Chr.24 : Asso:287241 , Asso:287242 , Asso:287243 , Asso:287244 , Asso:287245 , Asso:287246 , Asso:287247 , Asso:287248 , Asso:287249 , Asso:287250 , Asso:287251 , Asso:287252 , Asso:287253 , Asso:287254 , Asso:287255 , Asso:287256 , Asso:287257 , Asso:287258 , Asso:287259 , Asso:287260 , Asso:287261 , Asso:287262 . Chr.28 : Asso:287263 , Asso:287264 , Asso:287265 .
QTL for Chest width
Chr.3 : Asso:287266 , Asso:287267 , Asso:287268 , Asso:287269 , Asso:287270 , Asso:287375 , Asso:287376 , Asso:287377 , Asso:287378 , Asso:287379 .
QTL for Body length
Chr.8 : Asso:287271 . Chr.10 : Asso:287272 , Asso:287273 , Asso:287274 , Asso:287275 , Asso:287276 , Asso:287277 . Chr.18 : Asso:287278 , Asso:287279 , Asso:287280 .
QTL for Hip width
Chr.1 : Asso:287281 . Chr.3 : Asso:287282 . Chr.4 : Asso:287283 , Asso:287284 , Asso:287285 . Chr.5 : Asso:287286 , Asso:287287 . Chr.7 : Asso:287288 . Chr.8 : Asso:287289 , Asso:287290 . Chr.15 : Asso:287291 . Chr.20 : Asso:287292 . Chr.21 : Asso:287293 , Asso:287294 . Chr.24 : Asso:287295 .
QTL for Rump length
Chr.1 : Asso:287296 , Asso:287297 , Asso:287298 . Chr.2 : Asso:287299 . Chr.8 : Asso:287300 . Chr.10 : Asso:287301 , Asso:287302 , Asso:287303 . Chr.24 : Asso:287304 .
QTL for Rump width
Chr.5 : Asso:287305 . Chr.7 : Asso:287306 . Chr.8 : Asso:287307 , Asso:287308 , Asso:287309 , Asso:287310 , Asso:287327 , Asso:287328 , Asso:287329 , Asso:287330 , Asso:287331 , Asso:287332 , Asso:287333 , Asso:287383 , Asso:287384 , Asso:287385 . Chr.17 : Asso:287334 . Chr.26 : Asso:287335 , Asso:287336 .
QTL for Body circumference
Chr.1 : Asso:287337 . Chr.2 : Asso:287338 , Asso:287348 . Chr.3 : Asso:287349 . Chr.4 : Asso:287350 . Chr.5 : Asso:287339 . Chr.6 : Asso:287351 . Chr.9 : Asso:287340 . Chr.10 : Asso:287352 . Chr.11 : Asso:287353 . Chr.13 : Asso:287354 , Asso:287355 , Asso:287356 , Asso:287357 . Chr.14 : Asso:287358 . Chr.17 : Asso:287359 . Chr.19 : Asso:287360 , Asso:287361 . Chr.20 : Asso:287362 . Chr.21 : Asso:287363 . Chr.22 : Asso:287341 , Asso:287342 . Chr.23 : Asso:287343 , Asso:287344 . Chr.27 : Asso:287345 , Asso:287346 , Asso:287386 . Chr.29 : Asso:287347 , Asso:287364 , Asso:287365 .
QTL for Cannon bone circumference
Chr.4 : Asso:287366 . Chr.6 : Asso:287367 . Chr.8 : Asso:287368 . Chr.10 : Asso:287369 , Asso:287370 , Asso:287371 . Chr.13 : Asso:287372 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (11) ,
Chr.2 (14) ,
Chr.3 (14) ,
Chr.4 (13) ,
Chr.5 (11) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (9) ,
Chr.8 (35) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (16) ,
Chr.11 (3) ,
Chr.12 (6) ,
Chr.13 (6) ,
Chr.14 (2) ,
Chr.15 (3) ,
Chr.16 (3) ,
Chr.17 (6) ,
Chr.18 (4) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.20 (6) ,
Chr.21 (33) ,
Chr.22 (4) ,
Chr.23 (2) ,
Chr.24 (24) ,
Chr.26 (5) ,
Chr.27 (6) ,
Chr.28 (3) ,
Chr.29 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
