Authors: Allais S, Levéziel H, Hocquette J F, Rousset S, Denoyelle C, Journaux L, Renand G
(Contact: gilles.renand@jouy.inra.fr ) Affiliation: INRA, Clermont Université, UMR1019 Unité de Nutrition Humaine, Centre de Recherches en Nutrition Humaine d'Auvergne, F-63001 Clermont-Ferrand, France Title: Fine mapping of quantitative trait loci underlying sensory meat quality traits in three French beef cattle breeds Journal: Journal Of Animal Science, 92(10): 4329-41 (2014)
DOI :
10.2527/jas.2014-7868 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Intramuscular fat
Chr.1 : Asso:36361 , Asso:36486 . Chr.2 : Asso:36369 , Asso:36371 . Chr.3 : Asso:36386 . Chr.4 : Asso:36388 . Chr.6 : Asso:36392 , Asso:36393 . Chr.7 : Asso:36403 . Chr.11 : Asso:36422 , Asso:36423 . Chr.12 : Asso:36430 . Chr.13 : Asso:36431 . Chr.15 : Asso:36437 . Chr.20 : Asso:36458 . Chr.23 : Asso:36463 .
QTL for Meat color
Chr.1 : Asso:36362 , Asso:36487 . Chr.2 : Asso:36368 , Asso:36370 , Asso:36488 . Chr.3 : Asso:36379 , Asso:36381 , Asso:36385 . Chr.7 : Asso:36404 , Asso:36405 . Chr.9 : Asso:36410 , Asso:36411 . Chr.10 : Asso:36413 . Chr.11 : Asso:36419 , Asso:36425 . Chr.12 : Asso:36427 , Asso:36428 . Chr.13 : Asso:36432 . Chr.15 : Asso:36438 . Chr.16 : Asso:36440 . Chr.17 : Asso:36442 , Asso:36444 . Chr.18 : Asso:36452 , Asso:36453 . Chr.19 : Asso:36455 . Chr.20 : Asso:36456 , Asso:36457 , Asso:36459 . Chr.21 : Asso:36460 . Chr.23 : Asso:36464 . Chr.24 : Asso:36465 . Chr.26 : Asso:36467 . Chr.27 : Asso:36471 , Asso:36472 . Chr.29 : Asso:36476 .
QTL for Shear force
Chr.1 : Asso:36363 , Asso:36364 . Chr.2 : Asso:36373 . Chr.3 : Asso:36374 , Asso:36375 , Asso:36376 , Asso:36380 , Asso:36382 , Asso:36383 , Asso:36384 , Asso:36489 . Chr.4 : Asso:36389 . Chr.5 : Asso:36390 , Asso:36391 . Chr.6 : Asso:36394 , Asso:36397 , Asso:36398 . Chr.7 : Asso:36399 . Chr.8 : Asso:36408 . Chr.10 : Asso:36414 , Asso:36415 , Asso:36416 . Chr.11 : Asso:36420 , Asso:36421 , Asso:36424 . Chr.12 : Asso:36426 , Asso:36429 . Chr.14 : Asso:36433 , Asso:36485 . Chr.15 : Asso:36435 , Asso:36436 , Asso:36439 , Asso:36484 . Chr.17 : Asso:36441 , Asso:36443 , Asso:36445 , Asso:36446 , Asso:36447 , Asso:36448 , Asso:36449 , Asso:36450 . Chr.18 : Asso:36454 . Chr.22 : Asso:36461 . Chr.27 : Asso:36469 . Chr.29 : Asso:36475 , Asso:36477 , Asso:36478 .
QTL for Tenderness score
Chr.1 : Asso:36365 , Asso:36366 , Asso:36367 . Chr.2 : Asso:36372 . Chr.3 : Asso:36377 , Asso:36378 , Asso:36387 . Chr.4 : Asso:36490 . Chr.6 : Asso:36395 , Asso:36396 . Chr.7 : Asso:36400 , Asso:36401 , Asso:36402 , Asso:36406 , Asso:36407 . Chr.9 : Asso:36409 . Chr.10 : Asso:36412 , Asso:36417 , Asso:36418 , Asso:36481 , Asso:36482 . Chr.14 : Asso:36434 , Asso:36483 . Chr.17 : Asso:36451 . Chr.22 : Asso:36462 . Chr.23 : Asso:36479 . Chr.24 : Asso:36466 . Chr.26 : Asso:36468 . Chr.27 : Asso:36470 . Chr.28 : Asso:36473 . Chr.29 : Asso:36474 , Asso:36480 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (9) ,
Chr.2 (7) ,
Chr.3 (15) ,
Chr.4 (3) ,
Chr.5 (2) ,
Chr.6 (7) ,
Chr.7 (9) ,
Chr.8 (1) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (9) ,
Chr.11 (7) ,
Chr.12 (5) ,
Chr.13 (2) ,
Chr.14 (4) ,
Chr.15 (6) ,
Chr.16 (1) ,
Chr.17 (11) ,
Chr.18 (3) ,
Chr.19 (1) ,
Chr.20 (4) ,
Chr.21 (1) ,
Chr.22 (2) ,
Chr.23 (3) ,
Chr.24 (2) ,
Chr.26 (2) ,
Chr.27 (4) ,
Chr.28 (1) ,
Chr.29 (6) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Allais S, Levéziel H, Hocquette J F, Rousset S, Denoyelle C, Journaux L, Renand G (2014). Fine mapping of quantitative trait loci underlying sensory meat quality traits in three French beef cattle breeds. Journal of animal science, 92(10): 4329-41;
Curated into QTLdb on 2015-02-26. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=WtMw2G9CeC
OR
Allais S, Levéziel H, Hocquette J F, Rousset S, Denoyelle C, Journaux L, Renand G (2014). Fine mapping of quantitative trait loci underlying sensory meat quality traits in three French beef cattle breeds. Journal of animal science, 92(10): 4329-41; DOI: https://dx.doi.org/10.2527/jas.2014-7868
