Authors: Ao X, Rong Y, Han M, Wang X, Xia Q, Shang F, Liu Y, Lv Q, Wang Z, Su R, Zhang Y, Wang R
(Contact: yanjunz@imau.edu.cn ) Affiliation: College of Animal Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China Title: Combined Genome-Wide Association Study and Haplotype Analysis Identifies Candidate Genes Affecting Growth Traits of Inner Mongolian Cashmere Goats Journal: Veterinary Sciences, 11(9):428 (2024)
DOI :
10.3390/vetsci11090428 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body height
Chr.1 : Asso:301340 , Asso:301341 , Asso:301342 . Chr.3 : Asso:301343 , Asso:301344 , Asso:301345 , Asso:301346 , Asso:301347 , QTL:301595 . Chr.4 : Asso:301348 . Chr.6 : Asso:301349 , Asso:301350 , Asso:301351 , Asso:301352 , Asso:301353 , QTL:301596 . Chr.8 : Asso:301354 , Asso:301355 , Asso:301356 , Asso:301357 , Asso:301358 , Asso:301359 , Asso:301360 , Asso:301361 , Asso:301362 , Asso:301363 , Asso:301364 , QTL:301597 . Chr.14 : Asso:301365 . Chr.16 : Asso:301366 , Asso:301367 , Asso:301368 , Asso:301369 , Asso:301370 , Asso:301371 , Asso:301372 , Asso:301373 , Asso:301374 , Asso:301375 , Asso:301376 , Asso:301377 , Asso:301378 , Asso:301379 , Asso:301380 , Asso:301381 , Asso:301382 , Asso:301383 , Asso:301384 , Asso:301385 , Asso:301386 , Asso:301387 , Asso:301388 , Asso:301389 , Asso:301390 , Asso:301391 , Asso:301392 , Asso:301393 , Asso:301394 , Asso:301395 , Asso:301396 . Chr.19 : Asso:301397 . Chr.21 : Asso:301398 . Chr.23 : Asso:301399 , Asso:301400 . Chr.24 : Asso:301401 , Asso:301402 , Asso:301403 , Asso:301404 , Asso:301405 , Asso:301406 , Asso:301407 , Asso:301408 , Asso:301409 , Asso:301410 , Asso:301411 , Asso:301412 , Asso:301413 , Asso:301414 , Asso:301415 , Asso:301416 , Asso:301417 , Asso:301418 , Asso:301419 , Asso:301420 , Asso:301421 , Asso:301422 , Asso:301423 , Asso:301424 , Asso:301425 , Asso:301426 , Asso:301427 , Asso:301428 . Chr.27 : Asso:301429 . Chr.28 : Asso:301430 .
QTL for Body length
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QTL for Body circumference
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QTL for Body depth
Chr.1 : Asso:301475 , Asso:301476 , Asso:301477 . Chr.5 : Asso:301478 , Asso:301479 , Asso:301480 , Asso:301481 , Asso:301482 . Chr.9 : Asso:301483 , Asso:301484 , Asso:301485 , Asso:301486 , Asso:301487 , Asso:301488 , Asso:301489 , Asso:301490 , Asso:301491 , Asso:301492 , Asso:301493 , Asso:301494 , Asso:301495 , Asso:301496 , Asso:301497 , Asso:301498 , Asso:301499 , Asso:301500 , Asso:301501 , Asso:301502 , Asso:301503 , Asso:301504 , Asso:301505 , Asso:301506 , Asso:301507 , Asso:301508 , Asso:301509 , Asso:301510 , Asso:301511 , Asso:301512 , Asso:301513 , Asso:301514 , Asso:301515 , Asso:301516 , Asso:301517 , Asso:301518 , Asso:301519 , Asso:301520 , Asso:301521 , Asso:301522 , Asso:301523 , Asso:301524 , Asso:301525 , Asso:301526 , Asso:301527 , Asso:301528 , Asso:301529 , Asso:301530 , Asso:301531 , QTL:301600 , QTL:301601 , QTL:301602 , QTL:301603 . Chr.10 : Asso:301532 . Chr.13 : Asso:301533 . Chr.14 : Asso:301534 , Asso:301535 , Asso:301536 . Chr.15 : Asso:301537 . Chr.18 : Asso:301538 . Chr.19 : Asso:301539 , Asso:301540 , Asso:301541 , QTL:301604 . Chr.21 : Asso:301542 . Chr.26 : Asso:301543 , Asso:301544 , Asso:301545 , Asso:301546 , Asso:301547 . Chr.27 : Asso:301548 , Asso:301549 , Asso:301550 .
QTL for Chest width
Chr.1 : Asso:301551 , Asso:301552 . Chr.7 : Asso:301553 . Chr.13 : Asso:301554 . Chr.14 : Asso:301555 . Chr.16 : Asso:301556 , Asso:301557 , Asso:301558 , Asso:301559 , Asso:301560 , Asso:301561 , Asso:301562 , Asso:301563 , Asso:301564 , Asso:301565 , Asso:301566 , Asso:301567 , Asso:301568 , QTL:301605 , QTL:301606 . Chr.17 : Asso:301569 .
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:301570 . Chr.2 : Asso:301571 , Asso:301572 , Asso:301573 , Asso:301574 , Asso:301575 , Asso:301576 , Asso:301577 , Asso:301578 , Asso:301579 , Asso:301580 , Asso:301581 , QTL:301607 . Chr.6 : Asso:301582 . Chr.9 : Asso:301583 , Asso:301584 . Chr.10 : Asso:301585 , Asso:301586 , QTL:301608 . Chr.11 : Asso:301587 , Asso:301588 , Asso:301589 , Asso:301590 , QTL:301609 . Chr.17 : Asso:301591 . Chr.19 : Asso:301592 , Asso:301593 . Chr.21 : Asso:301594 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (10) ,
Chr.2 (12) ,
Chr.3 (10) ,
Chr.4 (8) ,
Chr.5 (6) ,
Chr.6 (7) ,
Chr.7 (3) ,
Chr.8 (14) ,
Chr.9 (55) ,
Chr.10 (4) ,
Chr.11 (5) ,
Chr.12 (1) ,
Chr.13 (2) ,
Chr.14 (5) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.16 (65) ,
Chr.17 (6) ,
Chr.18 (2) ,
Chr.19 (7) ,
Chr.21 (3) ,
Chr.22 (2) ,
Chr.23 (2) ,
Chr.24 (28) ,
Chr.26 (6) ,
Chr.27 (4) ,
Chr.28 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Ao X, Rong Y, Han M, Wang X, Xia Q, Shang F, Liu Y, Lv Q, Wang Z, Su R, Zhang Y, Wang R (2024). Combined Genome-Wide Association Study and Haplotype Analysis Identifies Candidate Genes Affecting Growth Traits of Inner Mongolian Cashmere Goats. Veterinary sciences, 11(9):428;
Curated into QTLdb on 2024-10-25. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=XaOp0W4JvX
OR
Ao X, Rong Y, Han M, Wang X, Xia Q, Shang F, Liu Y, Lv Q, Wang Z, Su R, Zhang Y, Wang R (2024). Combined Genome-Wide Association Study and Haplotype Analysis Identifies Candidate Genes Affecting Growth Traits of Inner Mongolian Cashmere Goats. Veterinary sciences, 11(9):428; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/vetsci11090428
