Authors: Yang R, Zhou D, Tan X, Zhao Z, Lv Y, Tian X, Ren L, Wang Y, Li J, Zhao Y, Zhang J
(Contact: dizhougz@163.com ) Affiliation: Guizhou Provincial Breeding Livestock and Poultry Germplasm Determination Center, Guiyang 550018, China Title: Genome-Wide Association Study of Body Conformation Traits in Tashi Goats (Capra hircus) Journal: Animals : An Open Access Journal From MDPI, 14(8):1145 (2024)
DOI :
10.3390/ani14081145 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body height
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QTL for Body length
Chr.2 : Asso:296271 , Asso:296282 . Chr.3 : Asso:296279 . Chr.8 : Asso:296273 . Chr.10 : Asso:296285 , Asso:296289 . Chr.11 : Asso:296270 , Asso:296275 , Asso:296283 , Asso:296286 , Asso:296287 . Chr.14 : Asso:296284 . Chr.21 : Asso:296274 , Asso:296277 . Chr.22 : Asso:296272 , Asso:296276 , Asso:296278 . Chr.29 : Asso:296280 , Asso:296281 , Asso:296288 .
QTL for Body depth
Chr.1 : Asso:296297 . Chr.2 : Asso:296314 , Asso:296318 , Asso:296321 . Chr.3 : Asso:296298 . Chr.4 : Asso:296293 , Asso:296303 . Chr.6 : Asso:296301 , Asso:296315 , Asso:296316 , Asso:296324 , Asso:296325 . Chr.7 : Asso:296334 . Chr.8 : Asso:296322 , Asso:296330 , Asso:296332 . Chr.9 : Asso:296317 . Chr.10 : Asso:296292 , Asso:296310 , Asso:296313 , Asso:296328 , Asso:296331 , Asso:296333 , Asso:296337 . Chr.11 : Asso:296290 , Asso:296291 , Asso:296295 , Asso:296309 , Asso:296319 , Asso:296323 , Asso:296335 , Asso:296339 , Asso:296340 . Chr.12 : Asso:296305 . Chr.13 : Asso:296296 , Asso:296326 . Chr.14 : Asso:296300 , Asso:296312 , Asso:296336 , Asso:296338 . Chr.16 : Asso:296306 . Chr.19 : Asso:296304 . Chr.20 : Asso:296294 , Asso:296311 . Chr.21 : Asso:296307 . Chr.22 : Asso:296341 . Chr.23 : Asso:296308 . Chr.25 : Asso:296299 , Asso:296302 , Asso:296320 . Chr.27 : Asso:296329 . Chr.28 : Asso:296327 .
QTL for Chest width
Chr.2 : Asso:296350 . Chr.5 : Asso:296344 , Asso:296347 . Chr.8 : Asso:296348 , Asso:296351 . Chr.9 : Asso:296346 . Chr.10 : Asso:296345 , Asso:296354 . Chr.13 : Asso:296349 , Asso:296352 , Asso:296353 . Chr.16 : Asso:296355 . Chr.29 : Asso:296342 , Asso:296343 .
QTL for Body circumference
Chr.1 : Asso:296393 . Chr.4 : Asso:296404 . Chr.5 : Asso:296378 , Asso:296401 . Chr.6 : Asso:296373 , Asso:296374 , Asso:296383 . Chr.7 : Asso:296402 . Chr.8 : Asso:296409 , Asso:296415 . Chr.9 : Asso:296361 , Asso:296362 , Asso:296377 . Chr.10 : Asso:296365 , Asso:296367 , Asso:296380 , Asso:296403 , Asso:296405 , Asso:296407 , Asso:296410 . Chr.11 : Asso:296356 , Asso:296357 , Asso:296364 , Asso:296366 , Asso:296371 , Asso:296372 , Asso:296392 , Asso:296395 , Asso:296399 , Asso:296408 , Asso:296412 , Asso:296413 . Chr.12 : Asso:296358 , Asso:296363 . Chr.13 : Asso:296385 . Chr.14 : Asso:296360 , Asso:296389 , Asso:296390 , Asso:296416 . Chr.15 : Asso:296388 . Chr.18 : Asso:296368 , Asso:296370 . Chr.21 : Asso:296375 , Asso:296391 , Asso:296417 . Chr.23 : Asso:296384 , Asso:296394 . Chr.24 : Asso:296369 , Asso:296411 . Chr.26 : Asso:296381 . Chr.27 : Asso:296376 . Chr.29 : Asso:296359 , Asso:296379 , Asso:296382 , Asso:296386 , Asso:296387 , Asso:296396 , Asso:296397 , Asso:296398 , Asso:296400 , Asso:296406 , Asso:296414 .
QTL for Rump width
Chr.1 : Asso:296431 , Asso:296453 , Asso:296454 . Chr.2 : Asso:296451 . Chr.4 : Asso:296419 , Asso:296425 , Asso:296426 , Asso:296428 , Asso:296433 , Asso:296434 , Asso:296435 , Asso:296447 , Asso:296449 , Asso:296455 , Asso:296457 , Asso:296468 . Chr.6 : Asso:296439 , Asso:296446 . Chr.9 : Asso:296459 . Chr.10 : Asso:296441 , Asso:296445 , Asso:296458 , Asso:296461 , Asso:296463 , Asso:296465 , Asso:296466 . Chr.11 : Asso:296418 , Asso:296422 , Asso:296427 , Asso:296436 , Asso:296438 , Asso:296442 , Asso:296456 , Asso:296460 . Chr.13 : Asso:296420 , Asso:296423 , Asso:296437 , Asso:296444 . Chr.14 : Asso:296462 . Chr.15 : Asso:296450 . Chr.16 : Asso:296429 , Asso:296430 . Chr.18 : Asso:296432 . Chr.20 : Asso:296452 . Chr.21 : Asso:296424 . Chr.24 : Asso:296421 . Chr.27 : Asso:296440 , Asso:296443 . Chr.28 : Asso:296467 . Chr.29 : Asso:296448 , Asso:296464 .
QTL for Cannon bone circumference
Chr.2 : Asso:296540 . Chr.6 : Asso:296539 . Chr.7 : Asso:296544 . Chr.11 : Asso:296545 . Chr.16 : Asso:296543 . Chr.20 : Asso:296541 . Chr.27 : Asso:296542 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (7) ,
Chr.2 (13) ,
Chr.3 (7) ,
Chr.4 (16) ,
Chr.5 (7) ,
Chr.6 (18) ,
Chr.7 (16) ,
Chr.8 (8) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (36) ,
Chr.11 (66) ,
Chr.12 (46) ,
Chr.13 (14) ,
Chr.14 (11) ,
Chr.15 (5) ,
Chr.16 (6) ,
Chr.18 (5) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.20 (4) ,
Chr.21 (7) ,
Chr.22 (5) ,
Chr.23 (10) ,
Chr.24 (20) ,
Chr.25 (5) ,
Chr.26 (2) ,
Chr.27 (8) ,
Chr.28 (4) ,
Chr.29 (27) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Yang R, Zhou D, Tan X, Zhao Z, Lv Y, Tian X, Ren L, Wang Y, Li J, Zhao Y, Zhang J (2024). Genome-Wide Association Study of Body Conformation Traits in Tashi Goats (Capra hircus). Animals : an open access journal from MDPI, 14(8):1145;
Curated into QTLdb on 2024-05-17. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=YnGz6V2ZwH
OR
Yang R, Zhou D, Tan X, Zhao Z, Lv Y, Tian X, Ren L, Wang Y, Li J, Zhao Y, Zhang J (2024). Genome-Wide Association Study of Body Conformation Traits in Tashi Goats (Capra hircus). Animals : an open access journal from MDPI, 14(8):1145; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/ani14081145
