Authors:
Liu H, Hou L, Zhou W, Wang B, Han P, Gao C, Niu P, Zhang Z, Li Q, Huang R, Li P
(Contact: lipinghua718@njau.edu.cn )
Affiliation:
Institute of Swine Science, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China
Title:
Genome-Wide Association Study and FST Analysis Reveal Four Quantitative Trait Loci and Six Candidate Genes for Meat Color in Pigs
Journal:
Frontiers In Genetics, 13: 768710 (2022)
DOI :
10.3389/fgene.2022.768710
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Meat color reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:257829 , Asso:257830 , Asso:257875 , Asso:257876 , Asso:257877 , Asso:257878 , Asso:257879 , Asso:257880 , Asso:257881 , Asso:257882 , Asso:257883 , Asso:257884 , Asso:257885 , Asso:257886 . Chr.2 : Asso:257792 , Asso:257793 , Asso:257834 , Asso:257835 , Asso:257887 , Asso:257888 , Asso:257889 , Asso:257890 , Asso:257891 , Asso:257909 . Chr.3 : Asso:257794 , Asso:257795 , Asso:257831 , Asso:257873 , Asso:257874 , Asso:257892 , Asso:257893 , Asso:257894 , Asso:257910 , Asso:257911 , Asso:257912 , Asso:257913 , Asso:257914 , Asso:257915 , Asso:257916 , Asso:257917 , Asso:257918 , Asso:257919 , Asso:257920 . Chr.4 : Asso:257836 , Asso:257837 , Asso:257838 , Asso:257839 . Chr.6 : Asso:257832 , Asso:257921 . Chr.7 : Asso:257895 , Asso:257896 , Asso:257897 , Asso:257898 , Asso:257899 . Chr.8 : Asso:257900 . Chr.9 : Asso:257833 , Asso:257922 , Asso:257923 , Asso:257924 , Asso:257925 , Asso:257926 , Asso:257927 , Asso:257928 . Chr.11 : Asso:257796 , Asso:257797 , Asso:257798 , Asso:257799 , Asso:257800 , Asso:257801 , Asso:257802 , Asso:257803 , Asso:257804 , Asso:257805 , Asso:257806 , Asso:257807 , Asso:257808 , Asso:257809 , Asso:257810 , Asso:257811 , Asso:257812 , Asso:257813 , Asso:257814 , Asso:257815 , Asso:257816 , Asso:257817 , Asso:257818 , Asso:257819 , Asso:257820 , Asso:257821 , Asso:257822 , Asso:257823 , Asso:257824 , Asso:257825 , Asso:257826 , Asso:257827 , Asso:257828 , Asso:257930 . Chr.13 : Asso:257840 , Asso:257841 , Asso:257842 , Asso:257843 , Asso:257844 , Asso:257901 , Asso:257902 , Asso:257903 , Asso:257904 , Asso:257905 , Asso:257906 , Asso:257907 , Asso:257929 . Chr.14 : Asso:257845 , Asso:257846 , Asso:257847 . Chr.15 : Asso:257908 . Chr.16 : Asso:257848 , Asso:257849 , Asso:257850 , Asso:257851 , Asso:257852 , Asso:257853 , Asso:257854 , Asso:257855 , Asso:257856 , Asso:257857 , Asso:257858 , Asso:257859 , Asso:257860 , Asso:257861 , Asso:257862 , Asso:257863 , Asso:257864 , Asso:257865 , Asso:257866 , Asso:257867 , Asso:257868 , Asso:257869 . Chr.17 : Asso:257870 , Asso:257871 , Asso:257872 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (14) ,
Chr.2 (10) ,
Chr.3 (19) ,
Chr.4 (4) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (5) ,
Chr.8 (1) ,
Chr.9 (8) ,
Chr.11 (34) ,
Chr.13 (13) ,
Chr.14 (3) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.16 (22) ,
Chr.17 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Liu H, Hou L, Zhou W, Wang B, Han P, Gao C, Niu P, Zhang Z, Li Q, Huang R, Li P (2022). Genome-Wide Association Study and FST Analysis Reveal Four Quantitative Trait Loci and Six Candidate Genes for Meat Color in Pigs. Frontiers in Genetics, 13: 768710;
Curated into QTLdb on 2022-06-20. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=ZeEt4L3PkS
OR
Liu H, Hou L, Zhou W, Wang B, Han P, Gao C, Niu P, Zhang Z, Li Q, Huang R, Li P (2022). Genome-Wide Association Study and FST Analysis Reveal Four Quantitative Trait Loci and Six Candidate Genes for Meat Color in Pigs. Frontiers in Genetics, 13: 768710; DOI: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2022.768710