Authors: Selionova M, Aibazov M, Sermyagin A, Belous A, Deniskova T, Mamontova T, Zharkova E, Zinovieva N
(Contact: ekzharkova@rgau-msha.ru ) Affiliation: Subdepartment of Animal Breeding, Genetics and Biotechnology, Moscow Timiryazev Agricultural Academy, Russian State Agrarian University, Timiryazevskaya Street, 41, 127343 Moscow, Russia Title: Genome-Wide Association and Pathway Analysis of Carcass and Meat Quality Traits in Karachai Young Goats Journal: Animals : An Open Access Journal From MDPI, 13(20):3237 (2023)
DOI :
10.3390/ani13203237 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:286055 , Asso:286058 , Asso:286060 , Asso:286062 . Chr.2 : Asso:286064 , Asso:286071 , Asso:286076 . Chr.3 : Asso:286078 . Chr.4 : Asso:286086 , Asso:286088 , Asso:286090 , Asso:286091 . Chr.5 : Asso:286092 , Asso:286093 , Asso:286094 , Asso:286098 , Asso:286099 , Asso:286100 , Asso:286101 , Asso:286103 , Asso:286104 , Asso:286105 . Chr.6 : Asso:286107 , Asso:286112 , Asso:286115 , Asso:286117 , Asso:286118 , Asso:286233 . Chr.7 : Asso:286119 , Asso:286120 , Asso:286129 . Chr.8 : Asso:286137 . Chr.9 : Asso:286138 , Asso:286140 , Asso:286142 , Asso:286149 . Chr.10 : Asso:286154 , Asso:286156 . Chr.11 : Asso:286164 , Asso:286166 , Asso:286168 , Asso:286169 . Chr.12 : Asso:286176 , Asso:286186 , Asso:286191 . Chr.13 : Asso:286193 . Chr.14 : Asso:286195 , Asso:286197 , Asso:286198 , Asso:286199 , Asso:286200 , Asso:286201 , Asso:286204 , Asso:286205 . Chr.15 : Asso:286206 , Asso:286207 , Asso:286209 . Chr.16 : Asso:286210 , Asso:286211 . Chr.17 : Asso:286220 , Asso:286221 , Asso:286222 . Chr.18 : Asso:286226 , Asso:286227 , Asso:286229 , Asso:286230 . Chr.19 : Asso:286232 .
QTL for Body height
Chr.1 : Asso:286056 , Asso:286063 . Chr.2 : Asso:286065 , Asso:286066 , Asso:286067 , Asso:286068 , Asso:286074 , Asso:286075 . Chr.3 : Asso:286079 , Asso:286080 , Asso:286082 , Asso:286083 . Chr.4 : Asso:286087 . Chr.5 : Asso:286095 , Asso:286096 . Chr.6 : Asso:286108 , Asso:286109 , Asso:286113 . Chr.7 : Asso:286121 , Asso:286122 , Asso:286125 , Asso:286126 , Asso:286130 , Asso:286131 , Asso:286132 , Asso:286133 . Chr.9 : Asso:286141 , Asso:286143 , Asso:286144 , Asso:286145 , Asso:286146 , Asso:286151 , Asso:286152 . Chr.10 : Asso:286157 , Asso:286158 , Asso:286159 , Asso:286160 . Chr.11 : Asso:286165 , Asso:286171 . Chr.12 : Asso:286177 , Asso:286178 , Asso:286179 , Asso:286180 , Asso:286188 , Asso:286189 . Chr.14 : Asso:286202 , Asso:286203 . Chr.16 : Asso:286212 , Asso:286213 . Chr.17 : Asso:286223 , Asso:286224 .
QTL for Chest width
Chr.1 : Asso:286057 , Asso:286061 . Chr.2 : Asso:286072 , Asso:286077 . Chr.3 : Asso:286084 . Chr.5 : Asso:286102 , Asso:286106 . Chr.6 : Asso:286116 , Asso:286234 . Chr.9 : Asso:286139 , Asso:286150 . Chr.10 : Asso:286155 , Asso:286162 . Chr.11 : Asso:286172 . Chr.12 : Asso:286190 , Asso:286192 . Chr.13 : Asso:286194 . Chr.14 : Asso:286196 . Chr.15 : Asso:286208 . Chr.16 : Asso:286217 . Chr.17 : Asso:286225 . Chr.18 : Asso:286228 . Chr.19 : Asso:286231 .
QTL for Body length
Chr.1 : Asso:286059 . Chr.2 : Asso:286069 , Asso:286070 , Asso:286073 . Chr.3 : Asso:286081 . Chr.4 : Asso:286089 . Chr.5 : Asso:286097 . Chr.6 : Asso:286110 . Chr.7 : Asso:286123 , Asso:286127 , Asso:286134 , Asso:286135 . Chr.8 : Asso:286136 . Chr.9 : Asso:286147 , Asso:286148 , Asso:286153 . Chr.10 : Asso:286161 . Chr.11 : Asso:286167 . Chr.12 : Asso:286181 , Asso:286182 , Asso:286187 . Chr.16 : Asso:286214 , Asso:286215 .
QTL for Body depth
Chr.3 : Asso:286085 . Chr.6 : Asso:286114 . Chr.10 : Asso:286163 . Chr.11 : Asso:286170 . Chr.12 : Asso:286173 , Asso:286174 , Asso:286184 . Chr.16 : Asso:286218 , Asso:286219 .
QTL for Body circumference
Chr.6 : Asso:286111 . Chr.7 : Asso:286124 , Asso:286128 . Chr.12 : Asso:286175 , Asso:286183 . Chr.16 : Asso:286216 .
QTL for Rump width
Chr.12 : Asso:286185 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (9) ,
Chr.2 (14) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (6) ,
Chr.5 (15) ,
Chr.6 (14) ,
Chr.7 (17) ,
Chr.8 (2) ,
Chr.9 (16) ,
Chr.10 (10) ,
Chr.11 (9) ,
Chr.12 (20) ,
Chr.13 (2) ,
Chr.14 (11) ,
Chr.15 (4) ,
Chr.16 (10) ,
Chr.17 (6) ,
Chr.18 (5) ,
Chr.19 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Selionova M, Aibazov M, Sermyagin A, Belous A, Deniskova T, Mamontova T, Zharkova E, Zinovieva N (2023). Genome-Wide Association and Pathway Analysis of Carcass and Meat Quality Traits in Karachai Young Goats. Animals : an open access journal from MDPI, 13(20):3237;
Curated into QTLdb on 2023-11-15. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=ZkMk6F9OlB
OR
Selionova M, Aibazov M, Sermyagin A, Belous A, Deniskova T, Mamontova T, Zharkova E, Zinovieva N (2023). Genome-Wide Association and Pathway Analysis of Carcass and Meat Quality Traits in Karachai Young Goats. Animals : an open access journal from MDPI, 13(20):3237; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/ani13203237
