Authors: Li C, Sun D, Zhang S, Wang S, Wu X, Zhang Q, Liu L, Li Y, Qiao L
(Contact: sundx@cau.edu.cn ) Affiliation: Beijing Dairy Cattle Center, Beijing, China. Title: Genome wide association study identifies 20 novel promising genes associated with milk fatty acid traits in Chinese Holstein. Journal: PloS One, 9(5): e96186 (2014)
DOI :
10.1371/journal.pone.0096186 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk myristic acid content
Chr.5 : Asso:32507 . Chr.12 : Asso:32515 . Chr.17 : Asso:32511 , Asso:32512 , Asso:32513 .
QTL for Milk lauric acid content
Chr.19 : Asso:32510 . Chr.21 : Asso:32508 .
QTL for Milk capric acid content
Chr.9 : Asso:32509 , Asso:32514 .
QTL for Milk myristoleic acid content
Chr.2 : Asso:32557 . Chr.14 : Asso:32541 . Chr.17 : Asso:32531 , Asso:32532 , Asso:32549 , Asso:32554 . Chr.26 : Asso:32516 , Asso:32517 , Asso:32518 , Asso:32519 , Asso:32520 , Asso:32521 , Asso:32522 , Asso:32523 , Asso:32524 , Asso:32525 , Asso:32526 , Asso:32527 , Asso:32528 , Asso:32529 , Asso:32530 , Asso:32533 , Asso:32534 , Asso:32535 , Asso:32537 , Asso:32538 , Asso:32539 , Asso:32540 , Asso:32542 , Asso:32543 , Asso:32544 , Asso:32545 , Asso:32547 , Asso:32548 , Asso:32550 , Asso:32552 , Asso:32553 , Asso:32555 , Asso:32558 . Chr.28 : Asso:32559 .
QTL for Milk linoleic acid content
Chr.14 : Asso:32536 , Asso:32551 . Chr.16 : Asso:32546 .
QTL for Milk oleic acid content
Chr.14 : Asso:32556 .
QTL for Milk C14 index
Chr.6 : Asso:32652 . Chr.7 : Asso:32633 . Chr.14 : Asso:32642 . Chr.17 : Asso:32621 , Asso:32628 , Asso:32649 . Chr.26 : Asso:32560 , Asso:32561 , Asso:32562 , Asso:32563 , Asso:32564 , Asso:32565 , Asso:32566 , Asso:32567 , Asso:32568 , Asso:32569 , Asso:32570 , Asso:32571 , Asso:32572 , Asso:32573 , Asso:32574 , Asso:32575 , Asso:32576 , Asso:32603 , Asso:32604 , Asso:32605 , Asso:32606 , Asso:32607 , Asso:32608 , Asso:32609 , Asso:32610 , Asso:32611 , Asso:32612 , Asso:32613 , Asso:32614 , Asso:32615 , Asso:32617 , Asso:32618 , Asso:32620 , Asso:32622 , Asso:32623 , Asso:32624 , Asso:32629 , Asso:32631 , Asso:32635 , Asso:32638 , Asso:32640 , Asso:32643 , Asso:32644 , Asso:32651 . Chr.27 : Asso:32639 .
QTL for Milk stearic acid content
Chr.X : Asso:32580 . Chr.1 : Asso:32584 , Asso:32592 , Asso:32602 . Chr.2 : Asso:32586 , Asso:32587 , Asso:32599 . Chr.5 : Asso:32583 , Asso:32588 . Chr.8 : Asso:32591 , Asso:32595 , Asso:32601 . Chr.11 : Asso:32581 , Asso:32585 . Chr.12 : Asso:32577 , Asso:32578 . Chr.14 : Asso:32593 , Asso:32596 . Chr.16 : Asso:32579 . Chr.17 : Asso:32589 , Asso:32590 . Chr.20 : Asso:32597 , Asso:32600 . Chr.26 : Asso:32598 .
QTL for Milk docosanoic acid content
Chr.1 : Asso:32582 .
QTL for Milk palmitic acid content
Chr.21 : Asso:32594 .
QTL for Milk C18 index
Chr.X : Asso:32653 . Chr.1 : Asso:32645 , Asso:32646 . Chr.2 : Asso:32625 , Asso:32627 , Asso:32636 , Asso:32648 . Chr.5 : Asso:32650 . Chr.6 : Asso:32647 . Chr.10 : Asso:32637 . Chr.11 : Asso:32616 , Asso:32619 , Asso:32630 . Chr.12 : Asso:32626 . Chr.14 : Asso:32634 . Chr.16 : Asso:32632 . Chr.17 : Asso:32655 . Chr.28 : Asso:32641 , Asso:32654 .
QTL for Milk saturated fatty acid content
Chr.10 : Asso:32656 , Asso:32657 . Chr.11 : Asso:32663 . Chr.21 : Asso:32667 .
QTL for Milk saturated to unsaturated fatty acid ratio
Chr.5 : Asso:32671 . Chr.10 : Asso:32658 , Asso:32659 . Chr.14 : Asso:32662 , Asso:32665 . Chr.21 : Asso:32664 .
QTL for Milk unsaturated fatty acid content
Chr.5 : Asso:32666 , Asso:32668 . Chr.10 : Asso:32660 , Asso:32661 . Chr.21 : Asso:32670 . Chr.25 : Asso:32669 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (2) ,
Chr.1 (6) ,
Chr.2 (8) ,
Chr.5 (7) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (1) ,
Chr.8 (3) ,
Chr.9 (2) ,
Chr.10 (7) ,
Chr.11 (6) ,
Chr.12 (4) ,
Chr.14 (10) ,
Chr.16 (3) ,
Chr.17 (13) ,
Chr.19 (1) ,
Chr.20 (2) ,
Chr.21 (5) ,
Chr.25 (1) ,
Chr.26 (78) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Li C, Sun D, Zhang S, Wang S, Wu X, Zhang Q, Liu L, Li Y, Qiao L (2014). Genome wide association study identifies 20 novel promising genes associated with milk fatty acid traits in Chinese Holstein.. PloS one, 9(5): e96186;
Curated into QTLdb on 2015-01-13. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=AiIl6B9ZdW
OR
Li C, Sun D, Zhang S, Wang S, Wu X, Zhang Q, Liu L, Li Y, Qiao L (2014). Genome wide association study identifies 20 novel promising genes associated with milk fatty acid traits in Chinese Holstein.. PloS one, 9(5): e96186; DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0096186
