Authors:
Doran Anthony G, Berry Donagh P, Creevey Christopher J
(Contact: chris.creevey@aber.ac.uk )
Affiliation:
Teagasc Animal and Bioscience Research Department, Animal & Grassland Research and Innovation Centre, Teagasc, Grange, Dunsany, Co, Meath, Ireland
Title:
Whole genome association study identifies regions of the bovine genome and biological pathways involved in carcass trait performance in Holstein-Friesian cattle
Journal:
BMC Genomics, 15: 837 (2014)
DOI :
10.1186/1471-2164-15-837
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Carcass weight reported for chromosome(s):
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QTL for Fat cover reported for chromosome(s):
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QTL for Lean meat yield reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:36673 , Asso:36674 , Asso:36675 , Asso:36678 , Asso:36679 , Asso:36744 , Asso:36747 , Asso:37229 , Asso:37225 , Asso:37203 , Asso:37193 , Asso:37188 , Asso:37186 , Asso:37185 , Asso:37184 , Asso:37163 , Asso:37161 , Asso:37148 , Asso:37142 , Asso:37119 , Asso:37117 , Asso:37111 , Asso:37108 , Asso:37092 , Asso:37079 , Asso:37064 , Asso:37045 , Asso:37040 , Asso:37031 , Asso:37020 , Asso:37015 , Asso:37014 , Asso:36991 , Asso:36960 , Asso:36949 , Asso:36948 , Asso:36938 , Asso:36927 , Asso:36925 , Asso:36921 , Asso:36896 , Asso:36889 , Asso:36885 , Asso:36865 , Asso:36851 , Asso:36844 , Asso:36843 , Asso:36822 , Asso:36815 . Chr.2 : Asso:36709 , Asso:37135 , Asso:37063 , Asso:37026 , Asso:37017 , Asso:36959 , Asso:36931 , Asso:36928 , Asso:36888 , Asso:36879 , Asso:36841 . 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Chr.22 : Asso:36703 , Asso:36741 , Asso:37219 , Asso:37213 , Asso:37205 , Asso:37180 , Asso:37178 , Asso:37169 , Asso:37164 , Asso:37140 , Asso:37130 , Asso:37112 , Asso:37102 , Asso:37023 , Asso:37001 , Asso:36954 , Asso:36937 , Asso:36935 , Asso:36903 , Asso:36901 , Asso:36899 , Asso:36883 , Asso:36863 , Asso:36855 , Asso:36846 . Chr.23 : Asso:37107 , Asso:37025 , Asso:37002 , Asso:36990 , Asso:36944 , Asso:36887 . Chr.24 : Asso:36715 , Asso:37121 . Chr.25 : Asso:36708 , Asso:37143 , Asso:37103 , Asso:37082 , Asso:37032 , Asso:36946 , Asso:36869 , Asso:36831 , Asso:36827 . Chr.26 : Asso:37192 , Asso:37149 , Asso:37081 , Asso:37057 , Asso:36862 . Chr.27 : Asso:37137 . Chr.28 : Asso:36735 , Asso:37182 , Asso:37154 , Asso:37122 , Asso:37086 , Asso:37011 , Asso:37006 , Asso:36906 , Asso:36856 , Asso:36814 . Chr.29 : Asso:37175 , Asso:37127 , Asso:37109 , Asso:36867 , Asso:36830 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (51) ,
Chr.2 (27) ,
Chr.3 (44) ,
Chr.4 (17) ,
Chr.5 (17) ,
Chr.6 (32) ,
Chr.7 (31) ,
Chr.8 (32) ,
Chr.9 (11) ,
Chr.10 (34) ,
Chr.11 (34) ,
Chr.12 (20) ,
Chr.13 (20) ,
Chr.14 (23) ,
Chr.15 (14) ,
Chr.16 (14) ,
Chr.17 (19) ,
Chr.18 (9) ,
Chr.19 (24) ,
Chr.20 (69) ,
Chr.21 (2) ,
Chr.22 (25) ,
Chr.23 (6) ,
Chr.24 (2) ,
Chr.25 (10) ,
Chr.26 (5) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (10) ,
Chr.29 (10) .
Number of gene-based eQTL/associations: