Authors: Akanno EC, Chen L, Abo-Ismail MK, Crowley JJ, Wang Z, Li C, Basarab JA, MacNeil MD, Plastow GS
(Contact: akanno@ualberta.ca ) Affiliation: Livestock Gentec, Department of Agricultural, Food and Nutritional Science, University of Alberta, Edmonton, AB, Canada Title: Genome-wide association scan for heterotic quantitative trait loci in multi-breed and crossbred beef cattle Journal: Genetics, Selection, Evolution : GSE, 50(1): 48 (2018)
DOI :
10.1186/s12711-018-0405-y Links:
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QTL for Body weight
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QTL for Average daily gain
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QTL for Marbling score
Chr.4 : Asso:164015 , Asso:164016 . Chr.7 : Asso:164352 , Asso:164586 , Asso:164587 , Asso:164706 . Chr.15 : Asso:164588 . Chr.25 : Asso:164353 .
QTL for Yield grade
Chr.2 : Asso:164714 , Asso:164715 . Chr.6 : Asso:164716 , Asso:164717 . Chr.10 : Asso:164718 , Asso:164719 . Chr.13 : Asso:164720 , Asso:164721 . Chr.16 : Asso:164722 . Chr.21 : Asso:164053 .
QTL for Longissimus muscle area
Chr.1 : Asso:164056 . Chr.2 : Asso:164702 . Chr.6 : Asso:164229 , Asso:164230 , Asso:164231 , Asso:164232 , Asso:164233 , Asso:164234 , Asso:164235 , Asso:164236 , Asso:164237 , Asso:164571 , Asso:164572 , Asso:164573 , Asso:164574 , Asso:164575 , Asso:164576 , Asso:164577 , Asso:164578 , Asso:164703 . Chr.7 : Asso:164238 , Asso:164239 , Asso:164240 , Asso:164579 , Asso:164580 , Asso:164581 , Asso:164582 , Asso:164583 . Chr.8 : Asso:164704 . Chr.9 : Asso:164584 , Asso:164585 . Chr.21 : Asso:164057 . Chr.24 : Asso:164058 , Asso:164705 .
QTL for Lean meat yield
Chr.2 : Asso:164707 . Chr.6 : Asso:164589 , Asso:164590 , Asso:164591 , Asso:164592 , Asso:164708 , Asso:164709 . Chr.8 : Asso:164593 , Asso:164710 . Chr.10 : Asso:164594 , Asso:164595 . Chr.13 : Asso:164711 . Chr.16 : Asso:164712 . Chr.21 : Asso:164059 . Chr.22 : Asso:164713 .
QTL for Carcass weight
Chr.4 : Asso:164695 . Chr.6 : Asso:164209 , Asso:164210 , Asso:164211 , Asso:164212 , Asso:164213 , Asso:164214 , Asso:164215 , Asso:164216 , Asso:164217 , Asso:164218 , Asso:164219 , Asso:164220 , Asso:164343 , Asso:164344 , Asso:164345 , Asso:164346 , Asso:164347 , Asso:164545 , Asso:164544 , Asso:164543 , Asso:164542 , Asso:164541 , Asso:164546 , Asso:164547 , Asso:164548 , Asso:164549 , Asso:164550 , Asso:164551 , Asso:164552 , Asso:164553 , Asso:164696 , Asso:164697 , Asso:164698 , Asso:164699 . Chr.7 : Asso:164221 , Asso:164222 , Asso:164554 , Asso:164555 , Asso:164556 , Asso:164557 . Chr.8 : Asso:164558 , Asso:164559 . Chr.10 : Asso:164223 , Asso:164560 . Chr.14 : Asso:164224 , Asso:164348 , Asso:164561 , Asso:164562 , Asso:164563 . Chr.15 : Asso:164225 . Chr.22 : Asso:164564 .
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.6 : Asso:164226 , Asso:164227 , Asso:164228 , Asso:164349 , Asso:164350 , Asso:164565 , Asso:164566 , Asso:164567 , Asso:164568 , Asso:164569 , Asso:164700 . Chr.8 : Asso:164351 . Chr.17 : Asso:164570 . Chr.29 : Asso:164701 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (9) ,
Chr.2 (14) ,
Chr.3 (15) ,
Chr.4 (14) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (363) ,
Chr.7 (61) ,
Chr.8 (15) ,
Chr.9 (8) ,
Chr.10 (11) ,
Chr.11 (11) ,
Chr.12 (7) ,
Chr.13 (20) ,
Chr.14 (52) ,
Chr.15 (9) ,
Chr.16 (4) ,
Chr.17 (4) ,
Chr.18 (3) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.20 (22) ,
Chr.21 (7) ,
Chr.22 (9) ,
Chr.23 (3) ,
Chr.24 (2) ,
Chr.25 (8) ,
Chr.26 (1) ,
Chr.27 (2) ,
Chr.28 (1) ,
Chr.29 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
