Authors: McCoy AM, Beeson SK, Rubin CJ, Andersson L, Caputo P, Lykkjen S, Moore A, Piercy RJ, Mickelson JR, McCue ME
(Contact: mccoya@illinois.edu ) Affiliation: Veterinary Population Medicine Department, University of Minnesota, St. Paul, Minnesota, United States of America Title: Identification and validation of genetic variants predictive of gait in standardbred horses Journal: PLoS Genetics, 15(5): e1008146 (2019)
DOI :
10.1371/journal.pgen.1008146 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Alternate gaits
Chr.1 : Asso:172354 , Asso:172362 , Asso:172370 , Asso:172375 , Asso:172382 , Asso:172387 , Asso:172389 , Asso:172393 , Asso:172405 , Asso:172407 , Asso:172417 , Asso:172418 , Asso:172419 , Asso:172420 , Asso:172421 , Asso:172426 , Asso:172427 , Asso:172435 , Asso:172437 , Asso:172443 , Asso:172445 , Asso:172448 , Asso:172450 , Asso:172452 , Asso:172455 , Asso:172474 , Asso:172475 , Asso:172477 , Asso:172481 , Asso:172497 , Asso:172503 , Asso:172510 , Asso:172515 , Asso:172527 , Asso:172559 , Asso:172566 , Asso:172571 . Chr.2 : Asso:172371 , Asso:172383 , Asso:172385 , Asso:172386 , Asso:172390 , Asso:172397 , Asso:172401 , Asso:172504 , Asso:172505 , Asso:172525 , Asso:172534 , Asso:172540 , Asso:172545 , Asso:172561 . Chr.3 : Asso:172388 , Asso:172430 , Asso:172449 , Asso:172467 , Asso:172469 , Asso:172490 , Asso:172502 , Asso:172508 , Asso:172514 , Asso:172519 , Asso:172532 , Asso:172533 , Asso:172535 , Asso:172537 , Asso:172538 , Asso:172544 , Asso:172550 , Asso:172551 , Asso:172552 , Asso:172554 , Asso:172557 , Asso:172565 , Asso:172572 , Asso:172582 . Chr.5 : Asso:172394 , Asso:172530 . Chr.6 : Asso:172355 , Asso:172357 , Asso:172487 , Asso:172488 , Asso:172495 , Asso:172581 . Chr.9 : Asso:172368 , Asso:172402 , Asso:172494 , Asso:172521 , Asso:172579 . Chr.10 : Asso:172379 , Asso:172395 . Chr.11 : Asso:172536 , Asso:172470 , Asso:172471 , Asso:172473 , Asso:172491 , Asso:172507 , Asso:172522 , Asso:172528 , Asso:172542 , Asso:172547 , Asso:172577 , Asso:172578 . Chr.12 : Asso:172404 , Asso:172558 , Asso:172568 . Chr.14 : Asso:172496 , Asso:172501 , Asso:172513 , Asso:172518 . Chr.15 : Asso:172484 . Chr.16 : Asso:172451 , Asso:172456 , Asso:172459 , Asso:172460 , Asso:172506 . Chr.17 : Asso:172353 , Asso:172358 , Asso:172359 , Asso:172360 , Asso:172361 , Asso:172364 , Asso:172365 , Asso:172377 , Asso:172391 , Asso:172392 , Asso:172411 , Asso:172412 , Asso:172424 , Asso:172428 , Asso:172431 , Asso:172438 , Asso:172441 , Asso:172457 , Asso:172462 , Asso:172531 , Asso:172541 , Asso:172546 , Asso:172549 , Asso:172564 . Chr.19 : Asso:172366 , Asso:172396 , Asso:172408 , Asso:172524 , Asso:172583 . Chr.20 : Asso:172384 , Asso:172434 , Asso:172461 , Asso:172465 , Asso:172468 , Asso:172485 , Asso:172486 , Asso:172489 , Asso:172512 , Asso:172520 . Chr.23 : Asso:172356 , Asso:172381 , Asso:172413 , Asso:172414 , Asso:172415 , Asso:172432 , Asso:172433 , Asso:172446 , Asso:172478 , Asso:172492 , Asso:172500 , Asso:172529 , Asso:172553 . Chr.24 : Asso:172511 , Asso:172517 , Asso:172526 , Asso:172570 . Chr.25 : Asso:172363 , Asso:172380 , Asso:172436 , Asso:172439 , Asso:172442 , Asso:172447 , Asso:172453 , Asso:172454 , Asso:172458 , Asso:172463 , Asso:172464 , Asso:172466 , Asso:172472 , Asso:172476 , Asso:172479 , Asso:172480 , Asso:172482 , Asso:172483 , Asso:172493 , Asso:172498 , Asso:172499 , Asso:172509 , Asso:172516 , Asso:172539 , Asso:172543 , Asso:172548 , Asso:172555 , Asso:172556 , Asso:172560 , Asso:172562 , Asso:172563 , Asso:172567 , Asso:172575 , Asso:172580 . Chr.26 : Asso:172569 , Asso:172573 , Asso:172574 , Asso:172576 . Chr.29 : Asso:172523 . Chr.30 : Asso:172406 , Asso:172409 , Asso:172410 , Asso:172416 , Asso:172422 , Asso:172423 , Asso:172425 , Asso:172429 , Asso:172440 . Chr.31 : Asso:172367 , Asso:172369 , Asso:172372 , Asso:172373 , Asso:172374 , Asso:172376 , Asso:172378 , Asso:172398 , Asso:172399 , Asso:172400 , Asso:172403 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (37) ,
Chr.2 (14) ,
Chr.3 (24) ,
Chr.5 (2) ,
Chr.6 (6) ,
Chr.9 (5) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.11 (12) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.14 (4) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.16 (5) ,
Chr.17 (24) ,
Chr.19 (5) ,
Chr.20 (10) ,
Chr.23 (13) ,
Chr.24 (4) ,
Chr.25 (34) ,
Chr.26 (4) ,
Chr.29 (1) ,
Chr.30 (9) ,
Chr.31 (11) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from McCoy AM, Beeson SK, Rubin CJ, Andersson L, Caputo P, Lykkjen S, Moore A, Piercy RJ, Mickelson JR, McCue ME (2019). Identification and validation of genetic variants predictive of gait in standardbred horses. PLoS genetics, 15(5): e1008146;
Curated into QTLdb on 2019-06-26. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=RfHo2J4WeK
OR
McCoy AM, Beeson SK, Rubin CJ, Andersson L, Caputo P, Lykkjen S, Moore A, Piercy RJ, Mickelson JR, McCue ME (2019). Identification and validation of genetic variants predictive of gait in standardbred horses. PLoS genetics, 15(5): e1008146; DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1008146
