Authors: Onteru SK, Gorbach DM, Young JM, Garrick DJ, Dekkers JC, Rothschild MF
(Contact: mfrothsc@iastate.edu ) Affiliation: Department of Animal Science and Center for Integrated Animal Genomics, Iowa State University, Ames, Iowa, United States of America. Title: Whole Genome Association Studies of Residual Feed Intake and Related Traits in the Pig. Journal: PloS One, 8 (6): e61756 (2013)
DOI :
10.1371/journal.pone.0061756 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Residual feed intake
Chr.2 : Asso:22185 . Chr.7 : QTL:22171 , Asso:22173 , Asso:22174 . Chr.14 : QTL:22170 , QTL:22172 , Asso:22175 , Asso:22176 , Asso:22177 , Asso:22178 , Asso:22179 , Asso:22180 , Asso:22181 , Asso:22182 , Asso:22183 , Asso:22184 , Asso:22186 , Asso:22187 , Asso:22188 , Asso:22189 , Asso:22190 , Asso:22191 . Chr.17 : Asso:22192 .
QTL for Feed intake
Chr.1 : QTL:22196 , QTL:22198 , QTL:22205 , Asso:22209 , Asso:22210 , Asso:22211 . Chr.4 : QTL:22201 , Asso:22202 . Chr.6 : QTL:22199 . Chr.7 : Asso:22212 , Asso:22213 . Chr.11 : QTL:22204 . Chr.14 : QTL:22193 , QTL:22195 , QTL:22197 , QTL:22200 , QTL:22203 , Asso:22206 , Asso:22207 , Asso:22208 . Chr.15 : Asso:22214 , Asso:22215 . Chr.17 : QTL:22194 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : QTL:22216 , Asso:22217 , Asso:22218 , Asso:22219 , Asso:22220 , Asso:22221 , Asso:22222 , QTL:22224 , Asso:22225 , Asso:22226 , Asso:22227 , Asso:22228 , Asso:22229 , QTL:22232 , Asso:22233 , Asso:22234 , Asso:22235 , QTL:22245 , QTL:22258 , Asso:22259 , Asso:22260 , Asso:22261 , Asso:22262 , Asso:22263 , Asso:22264 , Asso:22265 , Asso:22266 , Asso:22267 , Asso:22268 , QTL:22269 . Chr.2 : QTL:22230 . Chr.5 : QTL:22247 . Chr.6 : QTL:22231 , QTL:22255 . Chr.7 : QTL:22246 , QTL:22278 . Chr.11 : QTL:22223 . Chr.12 : QTL:22256 . Chr.14 : QTL:22236 , Asso:22237 , Asso:22238 , Asso:22239 , Asso:22240 , Asso:22241 , Asso:22242 , Asso:22243 , Asso:22244 , QTL:22270 , Asso:22271 , Asso:22272 , Asso:22273 , Asso:22274 , Asso:22275 , Asso:22276 , Asso:22279 , Asso:22280 , Asso:22281 , Asso:22282 , Asso:22283 . Chr.16 : QTL:22257 . Chr.17 : QTL:22248 , Asso:22249 , Asso:22250 , Asso:22251 , Asso:22252 , Asso:22253 , Asso:22254 , QTL:22277 .
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.X : QTL:22290 . Chr.2 : QTL:22288 , Asso:22289 , QTL:22294 . Chr.3 : QTL:22285 , QTL:22292 . Chr.5 : Asso:22298 . Chr.6 : QTL:22293 . Chr.7 : QTL:22284 . Chr.8 : QTL:22296 , Asso:22297 , Asso:22299 . Chr.13 : QTL:22291 . Chr.14 : QTL:22295 . Chr.16 : QTL:22286 . Chr.18 : QTL:22287 .
QTL for Longissimus muscle area
Chr.1 : QTL:22332 , Asso:22333 , Asso:22334 , Asso:22335 , Asso:22336 , Asso:22337 , Asso:22338 , Asso:22339 , Asso:22340 , Asso:22341 , Asso:22342 , QTL:22343 , Asso:22344 , Asso:22345 , Asso:22351 , Asso:22352 , Asso:22353 , Asso:22354 , Asso:22355 , Asso:22356 , Asso:22357 , Asso:22358 , Asso:22359 . Chr.2 : QTL:22319 , QTL:22328 , QTL:22329 , Asso:22360 , Asso:22361 . Chr.5 : Asso:22347 , Asso:22364 . Chr.7 : QTL:22300 , Asso:22301 , Asso:22302 , Asso:22303 , Asso:22304 , Asso:22305 , Asso:22306 , Asso:22307 , Asso:22308 , QTL:22315 , QTL:22320 . Chr.8 : Asso:22369 . Chr.9 : Asso:22316 , Asso:22317 , QTL:22318 . Chr.10 : Asso:22348 , Asso:22350 . Chr.12 : Asso:22346 . Chr.14 : QTL:22321 , Asso:22322 . Chr.15 : Asso:22362 , Asso:22363 . Chr.16 : QTL:22311 , Asso:22312 , Asso:22313 , Asso:22314 , QTL:22323 , Asso:22324 , Asso:22325 , Asso:22326 , QTL:22327 , QTL:22330 , Asso:22365 , Asso:22366 , Asso:22367 , Asso:22368 . Chr.17 : QTL:22309 , Asso:22310 , QTL:22331 , Asso:22349 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (1) ,
Chr.1 (59) ,
Chr.2 (10) ,
Chr.3 (2) ,
Chr.4 (2) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (4) ,
Chr.7 (19) ,
Chr.8 (4) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.11 (2) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.13 (1) ,
Chr.14 (50) ,
Chr.15 (4) ,
Chr.16 (16) ,
Chr.17 (14) ,
Chr.18 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Onteru SK, Gorbach DM, Young JM, Garrick DJ, Dekkers JC, Rothschild MF (2013). Whole Genome Association Studies of Residual Feed Intake and Related Traits in the Pig.. PloS one, 8 (6): e61756;
Curated into QTLdb on 2013-10-24. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=KrKp9Y1XxO
OR
Onteru SK, Gorbach DM, Young JM, Garrick DJ, Dekkers JC, Rothschild MF (2013). Whole Genome Association Studies of Residual Feed Intake and Related Traits in the Pig.. PloS one, 8 (6): e61756; DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0061756
