Authors: Rohrer GA, Nonneman DJ, Wiedmann RT, Schneider JF
(Contact: james.f.schneider@gmail.com ) Affiliation: United States Department of Agriculture, Agricultural Research Service,, U.S. Meat Animal Research Center, Clay Center, NE, 68933, USA Title: A study of vertebra number in pigs confirms the association of vertnin and reveals additional QTL Journal: BMC Genetics, 16(1): 129 (2015)
DOI :
10.1186/s12863-015-0286-9 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Thoracic vertebra number
Chr.X : QTL:64676 , QTL:64677 . Chr.1 : QTL:64702 . Chr.2 : QTL:64703 . Chr.3 : QTL:64705 , QTL:64707 , QTL:64709 . Chr.4 : QTL:64626 . Chr.5 : QTL:64627 , QTL:64629 , QTL:64630 , QTL:64631 , QTL:64717 . Chr.6 : QTL:64632 , QTL:64633 , QTL:64638 , QTL:64641 , QTL:64695 , QTL:64721 , QTL:64723 , QTL:64729 . Chr.7 : QTL:64643 , QTL:64735 . Chr.10 : QTL:64756 . Chr.11 : QTL:64759 . Chr.12 : QTL:64653 , QTL:64766 . Chr.14 : QTL:64660 , QTL:64661 , QTL:64770 , QTL:64771 , QTL:64772 , QTL:64774 , QTL:64775 , QTL:64776 , QTL:64777 , QTL:64779 . Chr.17 : QTL:64783 . Chr.18 : QTL:64670 , QTL:64672 , QTL:64674 , QTL:64675 .
QTL for Lumbar vertebra number
Chr.X : QTL:64784 , QTL:64785 . Chr.1 : QTL:64697 , QTL:64698 , QTL:64700 . Chr.3 : QTL:64708 . Chr.5 : QTL:64628 , QTL:64716 . Chr.6 : QTL:64694 , QTL:64722 , QTL:64724 . Chr.7 : QTL:64644 . Chr.8 : QTL:64738 , QTL:64748 . Chr.9 : QTL:64648 , QTL:64649 , QTL:64650 , QTL:64750 , QTL:64751 , QTL:64753 . Chr.10 : QTL:64651 , QTL:64755 , QTL:64757 . Chr.12 : QTL:64654 , QTL:64656 , QTL:64764 . Chr.15 : QTL:64663 . Chr.16 : QTL:64664 , QTL:64666 , QTL:64667 , QTL:64668 . Chr.17 : QTL:64696 . Chr.18 : QTL:64671 , QTL:64673 .
QTL for Thoracolumbar vertebra number
Chr.1 : QTL:64699 . Chr.3 : QTL:64706 , QTL:64710 . Chr.5 : QTL:64693 , QTL:64718 , QTL:64720 . Chr.6 : QTL:64634 , QTL:64635 , QTL:64636 , QTL:64637 , QTL:64639 , QTL:64640 , QTL:64727 . Chr.7 : QTL:64642 , QTL:64645 , QTL:64730 , QTL:64731 , QTL:64733 , QTL:64737 . Chr.8 : QTL:64646 , QTL:64647 , QTL:64740 . Chr.9 : QTL:64749 , QTL:64752 . Chr.11 : QTL:64652 , QTL:64762 . Chr.12 : QTL:64655 , QTL:64657 , QTL:64658 , QTL:64659 , QTL:64763 , QTL:64765 , QTL:64767 . Chr.14 : QTL:64662 , QTL:64778 , QTL:64780 . Chr.15 : QTL:64781 . Chr.16 : QTL:64665 , QTL:64782 . Chr.17 : QTL:64669 .
QTL for Spinal curvature
Chr.X : QTL:64690 , QTL:64691 , QTL:64692 . Chr.1 : QTL:64678 , QTL:64701 . Chr.2 : QTL:64679 , QTL:64680 , QTL:64704 . Chr.4 : QTL:64711 , QTL:64712 , QTL:64713 , QTL:64714 , QTL:64715 . Chr.5 : QTL:64681 , QTL:64682 , QTL:64719 . Chr.6 : QTL:64683 , QTL:64684 , QTL:64728 . Chr.7 : QTL:64685 , QTL:64734 , QTL:64736 . Chr.8 : QTL:64686 , QTL:64747 . Chr.9 : QTL:64754 . Chr.10 : QTL:64758 . Chr.11 : QTL:64760 , QTL:64761 . Chr.13 : QTL:64687 , QTL:64768 , QTL:64769 . Chr.14 : QTL:64773 . Chr.15 : QTL:64688 . Chr.16 : QTL:64689 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (7) ,
Chr.1 (7) ,
Chr.2 (4) ,
Chr.3 (6) ,
Chr.4 (6) ,
Chr.5 (13) ,
Chr.6 (21) ,
Chr.7 (12) ,
Chr.8 (7) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (5) ,
Chr.11 (5) ,
Chr.12 (12) ,
Chr.13 (3) ,
Chr.14 (14) ,
Chr.15 (3) ,
Chr.16 (7) ,
Chr.17 (3) ,
Chr.18 (6) .
Number of gene-based eQTL/associations:
