Authors:
Horodyska J, Hamill RM, Varley PF, Reyer H, Wimmers K
(Contact: reyer@fbn-dummerstorf.de )
Affiliation:
Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, University Rostock, Rostock, Germany
Title:
Genome-wide association analysis and functional annotation of positional candidate genes for feed conversion efficiency and growth rate in pigs
Journal:
PloS One, 12(6): e0173482 (2017)
DOI :
10.1371/journal.pone.0173482
Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Feed conversion ratio reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:139884 , Asso:139900 , Asso:139908 , Asso:139923 , Asso:139924 , Asso:139937 , Asso:139938 , Asso:139972 , Asso:139975 , Asso:140012 , Asso:140021 , Asso:140022 , Asso:140028 , Asso:140055 , Asso:140076 . Chr.1 : Asso:139914 , Asso:139927 , Asso:139931 , Asso:139932 , Asso:139933 , Asso:139934 , Asso:139942 , Asso:139951 , Asso:139952 , Asso:139953 , Asso:139954 , Asso:139960 , Asso:139962 , Asso:139963 , Asso:139964 , Asso:140023 , Asso:140037 , Asso:140044 , Asso:140045 , Asso:140046 , Asso:140058 , Asso:140061 , Asso:140075 , Asso:140078 , Asso:140079 , Asso:140090 . Chr.2 : Asso:139950 . Chr.3 : Asso:139995 , Asso:140041 , Asso:140043 . Chr.4 : Asso:139887 , Asso:139893 , Asso:139895 , Asso:139899 , Asso:139901 , Asso:139907 , Asso:139916 , Asso:139918 , Asso:139919 , Asso:139944 , Asso:139945 , Asso:139946 , Asso:139947 , Asso:139948 , Asso:139956 , Asso:139970 , Asso:139988 , Asso:139997 , Asso:139998 , Asso:140003 , Asso:140004 , Asso:140019 , Asso:140020 , Asso:140027 , Asso:140048 , Asso:140052 , Asso:140053 , Asso:140072 , Asso:140080 , Asso:140081 , Asso:140087 , Asso:140088 . Chr.5 : Asso:139889 , Asso:139897 , Asso:139903 , Asso:139981 , Asso:139982 , Asso:139983 , Asso:140074 . Chr.6 : Asso:139906 , Asso:139910 , Asso:139911 , Asso:139928 , Asso:139939 , Asso:139941 , Asso:139961 , Asso:139989 , Asso:140010 , Asso:140018 , Asso:140069 , Asso:140082 . Chr.7 : Asso:139896 , Asso:139940 . Chr.8 : Asso:139913 . Chr.9 : Asso:139904 , Asso:139922 , Asso:139936 , Asso:139969 , Asso:139990 , Asso:140025 . Chr.10 : Asso:140017 , Asso:140031 , Asso:140066 . Chr.11 : Asso:139966 , Asso:139968 , Asso:140086 . Chr.12 : Asso:139930 , Asso:140040 , Asso:140067 , Asso:140084 , Asso:140085 . Chr.13 : Asso:139935 , Asso:139967 . Chr.14 : Asso:139902 , Asso:139996 , Asso:140083 . Chr.15 : Asso:139890 , Asso:139909 , Asso:139917 , Asso:139929 , Asso:139955 , Asso:140039 , Asso:140070 . Chr.16 : Asso:139920 , Asso:140036 , Asso:140077 . Chr.17 : Asso:139999 , Asso:140008 , Asso:140014 , Asso:140015 .
QTL for Days to 110 kg reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:139987 . Chr.1 : Asso:139886 , Asso:139926 , Asso:139949 , Asso:139979 , Asso:140002 , Asso:140011 , Asso:140056 , Asso:140059 , Asso:140060 , Asso:140089 . Chr.3 : Asso:139921 , Asso:139925 , Asso:140000 , Asso:140001 , Asso:140005 , Asso:140033 , Asso:140050 , Asso:140073 . Chr.4 : Asso:139978 , Asso:139993 , Asso:140013 , Asso:140032 , Asso:140049 , Asso:140051 , Asso:140063 , Asso:140064 , Asso:140065 . Chr.5 : Asso:139973 , Asso:140062 , Asso:140068 . Chr.6 : Asso:139912 , Asso:140024 . Chr.8 : Asso:139965 , Asso:139976 , Asso:140071 . Chr.9 : Asso:140026 , Asso:140029 , Asso:140030 . Chr.10 : Asso:139891 , Asso:139915 , Asso:139971 , Asso:139984 , Asso:140016 . Chr.11 : Asso:139974 , Asso:140047 , Asso:140057 . Chr.12 : Asso:139985 . Chr.13 : Asso:139943 , Asso:139957 , Asso:139958 , Asso:139959 , Asso:139992 , Asso:139994 . Chr.14 : Asso:139905 , Asso:139977 , Asso:139986 . Chr.15 : Asso:139885 , Asso:139888 , Asso:139892 , Asso:139894 , Asso:139898 , Asso:139980 , Asso:140006 , Asso:140007 , Asso:140009 , Asso:140042 . Chr.16 : Asso:140034 , Asso:140035 , Asso:140038 . Chr.17 : Asso:139991 , Asso:140054 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (16) ,
Chr.1 (36) ,
Chr.2 (1) ,
Chr.3 (11) ,
Chr.4 (41) ,
Chr.5 (10) ,
Chr.6 (14) ,
Chr.7 (2) ,
Chr.8 (4) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (8) ,
Chr.11 (6) ,
Chr.12 (6) ,
Chr.13 (8) ,
Chr.14 (6) ,
Chr.15 (17) ,
Chr.16 (6) ,
Chr.17 (6) .
Number of gene-based eQTL/associations: