Authors: Chen H, Huang T, Zhang Z, Yang B, Jiang C, Wu J, Zhou Z, Zheng H, Xin W, Huang M, Zhang M, Chen C, Ren J, Ai H, Huang L
(Contact: aihsh@hotmail.com ) Affiliation: State Key Laboratory of Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, 330045, China Title: Genome-wide association studies and meta-analysis reveal novel quantitative trait loci and pleiotropic loci for swine head-related traits Journal: Journal Of Animal Science, 95(6): 2354-2366 (2018)
DOI :
10.2527/jas.2016.1137 Links:
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QTL for Distance from eye to end of snout
Chr.1 : Asso:152804 , Asso:152809 , Asso:152816 , Asso:152819 , Asso:152820 . Chr.15 : Asso:153057 , Asso:153101 , Asso:153117 , Asso:153118 , Asso:153178 , Asso:153179 , Asso:153180 , Asso:153206 .
QTL for Head length
Chr.1 : Asso:152805 , Asso:152808 , Asso:152817 , Asso:152821 .
QTL for Head weight
Chr.4 : Asso:152833 , Asso:152834 , Asso:152845 , Asso:152853 , Asso:152862 , Asso:153056 , Asso:153058 , Asso:153059 , Asso:153060 , Asso:153061 , Asso:153062 , Asso:153063 , Asso:153064 , Asso:153065 , Asso:153066 , Asso:153067 , Asso:153068 , Asso:153069 , Asso:153070 , Asso:153071 , Asso:153072 , Asso:153073 , Asso:153074 , Asso:153075 , Asso:153076 , Asso:153077 , Asso:153078 , Asso:153079 , Asso:153080 , Asso:153082 , Asso:153083 , Asso:153084 , Asso:153085 , Asso:153086 , Asso:153087 , Asso:153088 , Asso:153089 , Asso:153090 , Asso:153091 , Asso:153092 , Asso:153093 , Asso:153094 , Asso:153095 , Asso:153096 , Asso:153097 , Asso:153098 , Asso:153099 , Asso:153100 , Asso:153102 , Asso:153103 , Asso:153104 , Asso:153105 , Asso:153106 , Asso:153107 , Asso:153108 , Asso:153110 , Asso:153112 , Asso:153113 , Asso:153115 , Asso:153116 , Asso:153119 , Asso:153120 , Asso:153121 , Asso:153122 , Asso:153123 , Asso:153124 , Asso:153125 , Asso:153126 , Asso:153127 , Asso:153128 , Asso:153129 , Asso:153130 , Asso:153132 , Asso:153133 , Asso:153134 , Asso:153136 , Asso:153138 , Asso:153139 , Asso:153140 , Asso:153141 , Asso:153142 , Asso:153143 , Asso:153144 , Asso:153146 , Asso:153147 , Asso:153148 , Asso:153149 , Asso:153150 , Asso:153151 , Asso:153152 , Asso:153158 , Asso:153159 , Asso:153160 , Asso:153163 , Asso:153167 , Asso:153168 , Asso:153174 , Asso:153175 , Asso:153182 , Asso:153189 , Asso:153191 , Asso:153192 , Asso:153194 , Asso:153198 , Asso:153215 , Asso:153217 , Asso:153230 , Asso:153235 , Asso:153236 , Asso:153239 , Asso:153240 , Asso:153250 . Chr.5 : Asso:152810 , Asso:152812 , Asso:152813 , Asso:152814 , Asso:152815 . Chr.7 : Asso:152806 , Asso:152807 , Asso:152811 , Asso:152818 , Asso:152822 , Asso:152823 , Asso:152824 , Asso:152825 , Asso:152826 , Asso:152827 , Asso:152829 , Asso:152830 , Asso:152831 , Asso:152839 , Asso:152840 , Asso:152843 , Asso:152844 , Asso:152848 , Asso:152851 , Asso:152858 , Asso:152865 , Asso:152867 , Asso:152870 , Asso:152873 , Asso:152875 , Asso:152876 , Asso:152877 , Asso:152881 , Asso:152882 , Asso:152883 , Asso:152885 , Asso:152894 , Asso:152896 , Asso:152897 , Asso:152898 , Asso:152899 , Asso:152900 , Asso:152901 , Asso:152902 , Asso:152903 , Asso:152904 , Asso:152905 , Asso:152906 , Asso:152907 , Asso:152908 , Asso:152909 , Asso:152910 , Asso:152911 , Asso:152912 , Asso:152913 , Asso:152914 , Asso:152915 , Asso:152916 , Asso:152917 , Asso:152918 , Asso:152919 , Asso:152920 , Asso:152921 , Asso:152922 , Asso:152923 , Asso:152924 , Asso:152925 , Asso:152926 , Asso:152927 , Asso:152928 , Asso:152929 , Asso:152930 , Asso:152931 , Asso:152932 , Asso:152933 , Asso:152934 , Asso:152935 , Asso:152936 , Asso:152937 , Asso:152938 , Asso:152939 , Asso:152940 , Asso:152941 , Asso:152942 , Asso:152943 , Asso:152944 , Asso:152945 , Asso:152946 , Asso:152947 , Asso:152948 , Asso:152949 , Asso:152950 , Asso:152951 , Asso:152952 , Asso:152953 , Asso:152954 , Asso:152955 , Asso:152956 , Asso:152957 , Asso:152958 , Asso:152959 , Asso:152960 , Asso:152961 , Asso:152962 , Asso:152963 , Asso:152964 , Asso:152965 , Asso:152966 , Asso:152967 , Asso:152968 , Asso:152969 , Asso:152970 , Asso:152971 , Asso:152972 , Asso:152973 , Asso:152974 , Asso:152975 , Asso:152976 , Asso:152977 , Asso:152978 , Asso:152979 , Asso:152980 , Asso:152981 , Asso:152982 , Asso:152983 , Asso:152984 , Asso:152985 , Asso:152986 , Asso:152987 , Asso:152988 , Asso:152989 , Asso:152990 , Asso:152991 , Asso:152992 , Asso:152993 , Asso:152994 , Asso:152995 , Asso:152996 , Asso:152997 , Asso:152998 , Asso:152999 , Asso:153000 , Asso:153001 , Asso:153002 , Asso:153003 , Asso:153004 , Asso:153005 , Asso:153006 , Asso:153007 , Asso:153008 , Asso:153009 , Asso:153010 , Asso:153011 , Asso:153012 , Asso:153013 , Asso:153014 , Asso:153015 , Asso:153016 , Asso:153017 , Asso:153018 , Asso:153019 , Asso:153020 , Asso:153021 , Asso:153022 , Asso:153023 , Asso:153024 , Asso:153025 , Asso:153026 , Asso:153027 , Asso:153028 , Asso:153029 , Asso:153030 , Asso:153031 , Asso:153032 , Asso:153033 , Asso:153034 , Asso:153035 , Asso:153036 , Asso:153037 , Asso:153038 , Asso:153039 , Asso:153040 , Asso:153041 , Asso:153042 , Asso:153043 , Asso:153044 , Asso:153045 , Asso:153046 , Asso:153047 , Asso:153048 , Asso:153049 , Asso:153050 , Asso:153051 , Asso:153052 , Asso:153053 , Asso:153054 , Asso:153055 , Asso:153233 , Asso:153238 , Asso:153251 , Asso:153253 .
QTL for Lip thickness
Chr.7 : Asso:152828 , Asso:152835 , Asso:152837 , Asso:152846 , Asso:152849 , Asso:152850 , Asso:152852 , Asso:152854 , Asso:152859 , Asso:152860 , Asso:152861 , Asso:152864 , Asso:152866 , Asso:152868 , Asso:152871 , Asso:152879 , Asso:152884 , Asso:152886 , Asso:152889 , Asso:152892 , Asso:152893 .
QTL for Tongue length
Chr.1 : Asso:153247 , Asso:153248 , Asso:153249 , Asso:153252 . Chr.4 : Asso:152832 , Asso:152842 , Asso:152857 , Asso:152872 .
QTL for Mouth width, including lips
Chr.7 : Asso:152836 , Asso:152838 , Asso:152841 , Asso:152863 , Asso:152869 , Asso:152874 , Asso:152880 , Asso:152887 , Asso:152890 , Asso:152895 .
QTL for Tongue weight
Chr.2 : Asso:153237 , Asso:153241 , Asso:153242 , Asso:153243 , Asso:153254 . Chr.4 : Asso:152847 , Asso:152855 , Asso:152856 , Asso:152878 , Asso:152888 , Asso:152891 , Asso:153081 , Asso:153109 , Asso:153111 , Asso:153114 , Asso:153131 , Asso:153135 , Asso:153137 , Asso:153145 , Asso:153153 , Asso:153154 , Asso:153155 , Asso:153156 , Asso:153157 , Asso:153161 , Asso:153162 , Asso:153164 , Asso:153165 , Asso:153166 , Asso:153169 , Asso:153170 , Asso:153171 , Asso:153172 , Asso:153173 , Asso:153176 , Asso:153177 , Asso:153181 , Asso:153183 , Asso:153184 , Asso:153185 , Asso:153186 , Asso:153187 , Asso:153188 , Asso:153190 , Asso:153193 , Asso:153195 , Asso:153196 , Asso:153197 , Asso:153199 , Asso:153200 , Asso:153201 , Asso:153202 , Asso:153203 , Asso:153204 , Asso:153205 , Asso:153207 , Asso:153208 , Asso:153209 , Asso:153210 , Asso:153211 , Asso:153212 , Asso:153213 , Asso:153214 , Asso:153216 , Asso:153218 , Asso:153219 , Asso:153220 , Asso:153221 , Asso:153222 , Asso:153223 , Asso:153224 , Asso:153225 , Asso:153226 , Asso:153227 , Asso:153228 , Asso:153229 , Asso:153231 , Asso:153232 , Asso:153234 .
QTL for Distance from eye to corner of mouth
Chr.9 : Asso:153244 , Asso:153245 , Asso:153246 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Chen H, Huang T, Zhang Z, Yang B, Jiang C, Wu J, Zhou Z, Zheng H, Xin W, Huang M, Zhang M, Chen C, Ren J, Ai H, Huang L (2018). Genome-wide association studies and meta-analysis reveal novel quantitative trait loci and pleiotropic loci for swine head-related traits. Journal of animal science, 95(6): 2354-2366;
Curated into QTLdb on 2018-03-01. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=TxDx5H2WdX
OR
Chen H, Huang T, Zhang Z, Yang B, Jiang C, Wu J, Zhou Z, Zheng H, Xin W, Huang M, Zhang M, Chen C, Ren J, Ai H, Huang L (2018). Genome-wide association studies and meta-analysis reveal novel quantitative trait loci and pleiotropic loci for swine head-related traits. Journal of animal science, 95(6): 2354-2366; DOI: https://dx.doi.org/10.2527/jas.2016.1137
