Blast Match of Query Sequences to Pig Genome Build 10.2 Genes
-- A Pilot Analysis of 3 Pig Array Platforms

Data sets Query Stable ENS IDs External Name (HGNC) Genome locations Gene length Strands Overlap lengths Overlap coordinates E-values
Oligo200610001_11501786ENSSSCG00000002668FAM92B6:4283085-42930729987+/+4164285285-42857010.0
Oligo200610001_CL1Contig2ENSSSCG00000006109FAM92A14:46381629-4640786626237+/--23746382455-463822181e-130
Oligo200610003_CL3Contig1ENSSSCG00000016510UBN218:10864060-1093373569675+/--45410933647-109331930.0
Oligo20061000_13307258ENSSSCG00000000272SP15:19024788-1906585141063+/+17719064925-190651025e-95
Oligo20061000_CL1Contig1ENSSSCG00000015962SP315:89251099-8929295941860+/+95289253102-892540540.0
Oligo20061000_CL2Contig1ENSSSCG00000000272SP15:19024788-1906585141063+/--21619065851-190656350.0
Oligo200610010_7056427ENSSSCG00000024479ELAC11:110449865-11046800318138+/+166110456935-1104571012e-88
Oligo200610013_CL1Contig2ENSSSCG00000013878PGLS2:59778644-597870328388+/--36259787018-597866560.0
Oligo200610014_CL1Contig13ENSSSCG00000001457SLA-DQB*G017:29180533-291887718238+/+26929186961-291872301e-111
Oligo200610014_CL1Contig17ENSSSCG00000001454SLA-DRB17:29093969-290987954826+/--10429098707-290986032e-16
Oligo200610017_CL1Contig1ENSSSCG00000003589MECR6:79984219-8001809233873+/--37079987330-799869600.0
Oligo20061001_14655775ENSSSCG00000011147AKR1C110:71833306-7184787514569+/+51871845827-718463450.0
Oligo20061001_49415667ENSSSCG00000011147AKR1C110:71833306-7184787514569+/+43971838528-718389670.0
Oligo20061001_49419528ENSSSCG00000028982AKR10:71747464-7176122313759+/+21071756520-717567302e-112
Oligo20061001_CL1Contig3ENSSSCG00000011147AKR1C110:71833306-7184787514569+/+10071847623-718477239e-16
Oligo20061001_CL3Contig2ENSSSCG00000016539AKR1B118:15596721-1561503018309+/+40115614629-156150300.0
Oligo20061001_CL6Contig1ENSSSCG00000016519AKR1D118:12091465-1213429142826+/+16812102368-121025365e-87
Oligo20061002_CL1Contig2ENSSSCG00000012074BACE213:214758853-21484518186328+/--254214845181-2148449270.0
Oligo200610039_CL1Contig2ENSSSCG00000003111SAE16:48331035-4840107270037+/+56148400031-484005920.0
Oligo200610044_CL1Contig1ENSSSCG00000005664LRRC8A1:303225709-30325640330694+/--878303253637-3032527590.0
Oligo200610044_CL3Contig1ENSSSCG00000006917LRRC8C4:138996946-13907760580659+/+111139003247-1390033586e-10
Oligo200610044_CL4Contig1ENSSSCG00000022798LRRC8B4:139107289-13912190014611+/--535139120288-1391197530.0
Oligo200610044_CL5Contig1ENSSSCG00000006917LRRC8C4:138996946-13907760580659+/--434139017622-1390171880.0
Oligo200610051_15413374ENSSSCG00000001050EDN17:9152654-91592516597+/+3209157985-91583052e-180
Oligo200610051_CL1Contig1ENSSSCG00000007527EDN317:66845665-6686911023445+/--41266846641-668462290.0
Oligo200610052_CL2Contig1ENSSSCG00000005286CEP781:257749460-25778050931049+/+177257756329-2577565068e-95
Oligo200610054_41139336ENSSSCG00000010005RNF21514:50433885-504416687783+/+59350440462-504410550.0
Oligo200610054_CL1Contig1ENSSSCG00000010005RNF21514:50433885-504416687783+/--67350437327-504366540.0
Oligo200610055_CL1Contig1ENSSSCG00000006947SYDE24:143280356-14332562845272+/+109143308739-1433088483e-18
Oligo200610055_CL2Contig1ENSSSCG00000006947SYDE24:143280356-14332562845272+/--89143308799-1433087102e-18
Oligo200610060_CL1Contig1ENSSSCG00000003268TSEN346:53280931-532885257594+/--48053288508-532880280.0
Oligo20061006_11073585ENSSSCG00000016131ADAM2315:121306038-121474753168715+/+195121456495-1214566904e-106
Oligo20061006_14658953ENSSSCG00000016131ADAM2315:121306038-121474753168715+/--258121458280-1214580223e-143
Oligo20061006_41135851ENSSSCG00000016131ADAM2315:121306038-121474753168715+/+263121464923-1214651862e-136
Oligo200610072_CL1Contig1ENSSSCG00000021007MRPL193:71096620-7110744510825+/--42371103691-711032680.0
Oligo200610073_CL1Contig1ENSSSCG00000015779CDKN2AIP15:51499660-515031863526+/+59651501949-515025450.0
Oligo200610076_7056908ENSSSCG00000004702STRC1:142665471-14268193116460+/+137142673539-1426736762e-71
Oligo200610078_CL2Contig1ENSSSCG00000005389TEX101:270442973-27048054437571+/--654270473089-2704724350.0
Oligo200610082_49327055ENSSSCG00000012520BHLHB9X:97848044-978497201676+/+26597848567-978488323e-47
Oligo200610082_CL1Contig1ENSSSCG00000012519GPRASP1X:97745856-977499984142+/+5397749881-977499343e-13
Oligo200610082_CL2Contig1ENSSSCG00000012521GPRASP2X:97828399-978324424043+/--5397832032-978319792e-13
Oligo200610087_CL1Contig1ENSSSCG00000008498HEATR5B3:109692688-109810357117669+/--893109810071-1098091780.0
Oligo200610087_CL2Contig1ENSSSCG00000008498HEATR5B3:109692688-109810357117669+/+252109759158-1097594106e-137
Oligo200610087_CL3Contig1ENSSSCG00000001970HEATR5A7:73042187-7314067898491+/+36773050970-730513370.0
Oligo200610087_CL4Contig1ENSSSCG00000008498HEATR5B3:109692688-109810357117669+/--253109713974-1097137215e-140
Oligo200610087_CL5Contig1ENSSSCG00000008498HEATR5B3:109692688-109810357117669+/+158109732094-1097322526e-84
Oligo200610093_CL1Contig1ENSSSCG00000002760NIP76:16587551-165922454694+/--83116590451-165896200.0
Oligo200610095_49411990ENSSSCG00000022952NMD313:109220805-109339504118699+/+429109337390-1093378190.0
Oligo200610096_34160396ENSSSCG00000012542FAM199XX:99087898-9912010432206+/--26899098882-990986141e-132
Oligo20061009_18532376ENSSSCG00000007988JMJD83:41385148-413868771729+/--21141386032-413858212e-111
Oligo200610105_CL1Contig3ENSSSCG00000011370DALRD313:34894141-348969942853+/--26534896374-348961095e-147
Oligo200610105_CL1Contig4ENSSSCG00000011370DALRD313:34894141-348969942853+/+42634894141-348945670.0
Oligo200610116_CL1Contig1ENSSSCG00000022061TRMT124:15556377-155577231346+/+85715556866-155577230.0
Oligo200610117_CL1Contig1ENSSSCG00000003377ACOT76:62103735-6217607872343+/--40562104152-621037470.0
Oligo200610124_CL1Contig1ENSSSCG00000006365NIT14:97178847-971833064459+/--54497181078-971805340.0
Oligo200610124_CL2Contig1ENSSSCG00000011968NIT213:168425736-16844511719381+/+92168445025-1684451170.0
Oligo200610125_CL1Contig2ENSSSCG00000005933CHRAC14:2425325-24274262101+/+4412426982-24274230.0
Oligo20061012_CL1Contig1ENSSSCG00000022930C14ORF1297:124844706-12486565720951+/+649124863496-1248641450.0
Oligo200610130_CL1Contig1ENSSSCG00000009367PROSER111:14261017-1430577444757+/+9614298938-142990341e-17
Oligo200610135_51329451ENSSSCG00000012100PNPLA4X:4788455-482375335298+/+1844788455-47886391e-113
Oligo200610135_CL1Contig1ENSSSCG00000012841ATGL2:156291-1612975006+/+334160918-1612520.0
Oligo200610140_15034282ENSSSCG00000009968TTC2814:48211177-48572363361186+/+59148225722-482263130.0
Oligo200610140_15417420ENSSSCG00000009968TTC2814:48211177-48572363361186+/+33948221078-482214170.0
Oligo200610142_33291681ENSSSCG00000025649SIK29:44262823-442671864363+/--24444267186-442669420.0
Oligo200610142_CL1Contig2ENSSSCG00000010829MOSC110:12272073-1236129389220+/+27912340489-123407687e-32
Oligo200610142_CL2Contig1ENSSSCG00000005344MELK1:265175024-265288283113259+/+530265287753-2652882830.0
Oligo200610142_CL3Contig1ENSSSCG00000010829MOSC110:12272073-1236129389220+/+69512340152-123408470.0
Oligo200610142_CL4Contig1ENSSSCG00000015071SIK39:49296590-49404314107724+/--47549311178-493107030.0
Oligo200610142_CL8Contig1ENSSSCG00000024598PRKAA116:26857519-2686810510586+/+49226861118-268616100.0
Oligo200610142_CL9Contig1ENSSSCG00000003837PRKAA26:143547628-14357394726319+/--226143553519-1435532936e-124
Oligo200610143_CL1Contig1ENSSSCG00000008305SMYD53:72756038-7276930613268+/--19972757278-727570794e-95
Oligo200610151_CL1Contig1ENSSSCG00000021746MRPL353:61248709-6126395115242+/--34161261284-612609430.0
Oligo200610152_CL1Contig1ENSSSCG00000005312SIT11:264096731-2640984601729+/--481264097558-2640970770.0
Oligo20061015_CL1Contig1ENSSSCG00000029886LYVE12:52284701-5230155616855+/+31852297558-522978767e-179
Oligo200610163_6762284ENSSSCG00000001977STXBP67:79510868-79712569201701+/+14379510868-795110112e-93
Oligo200610165_CL1Contig1ENSSSCG00000006540PYGO24:103588676-1035929454269+/--923103591659-1035907360.0
Oligo200610166_CL1Contig1ENSSSCG00000023277NDUFA1X:113388325-1133919563631+/--102113391956-1133918540.0
ENSSSCG00000022359RNF113AX:113392115-1133933191204+/--203113392318-1133921150.0
Oligo200610168_CL1Contig1ENSSSCG00000015473TMEM183A9:125173393-12518603412641+/--696125185767-1251850710.0
Oligo200610169_CL1Contig1ENSSSCG00000007730CALN13:15865928-16190523324595+/--14515917395-159172508e-76
Oligo200610170_CL1Contig3ENSSSCG00000014393GNPDA12:149805752-14981759611844+/--161149809482-1498093212e-18
Oligo20061017_CL1Contig1ENSSSCG00000020725ERBB35:22968087-23092644124557+/+43623036422-230368580.0
ENSSSCG00000000384OBFC2B5:23036755-230438417086+/+10323036755-230368580.0
Oligo20061017_CL2Contig1ENSSSCG00000016062OBFC2A15:107658457-1076666858228+/+753107665932-1076666850.0
Oligo200610181_CL1Contig1ENSSSCG00000009305GTF3A11:4330672-434375013078+/+3164343412-43437281e-177
Oligo200610185_CL1Contig1ENSSSCG00000014044NSD12:82120288-8221417593887+/--24582120533-821202881e-145
Oligo200610186_15055869ENSSSCG00000017331C17ORF4612:18432685-184415978912+/+15918440286-184404454e-70
Oligo200610190_41142388ENSSSCG00000007106INSM117:32162172-321634191247+/+64832162172-321628200.0
Oligo200610197_CL1Contig1ENSSSCG00000012290WDR45X:47998631-480039205289+/+46247998632-479990940.0
Oligo200610197_CL2Contig1ENSSSCG00000017133WDR45L12:190348-21526124913+/--791191433-1906420.0
Oligo200610206_CL1Contig1ENSSSCG00000015756XKR515:43093144-4311089217748+/+21443099842-431000568e-117
Oligo200610212_CL1Contig1ENSSSCG00000014961CWC159:30788867-3080067711810+/+89430788884-307897780.0
Oligo200610213_49346472ENSSSCG00000004425LAMA41:87740894-8780880567911+/--13587774922-877747874e-70
Oligo200610213_CL1Contig1ENSSSCG00000004425LAMA41:87740894-8780880567911+/+45487740894-877413480.0
Oligo200610214_CL1Contig1ENSSSCG00000007098DTD117:30300695-30435498134803+/--36130435493-304351320.0
Oligo200610239_CL1Contig1ENSSSCG00000029708SLC25A3813:26291237-2630450813271+/+42826291237-262916650.0
Oligo200610246_49416603ENSSSCG00000017733C17ORF7512:44372023-4438543313410+/+27644383104-443833802e-149
Oligo20061024_CL1Contig1ENSSSCG00000029967PEX19:79114663-7917323758574+/--26979160659-791603901e-145
Oligo200610250_CL1Contig1ENSSSCG00000029843NPHP46:61659254-6175652397269+/+41861659254-616596720.0
Oligo200610253_51310059ENSSSCG00000002774FAM65A6:25438878-254479259047+/+27625439577-254398534e-154
Oligo200610253_CL1Contig2ENSSSCG00000002774FAM65A6:25438878-254479259047+/--9825447925-254478270.0
Oligo200610254_CL1Contig1ENSSSCG00000021093C10orf6710:57355457-5743880083343+/+16857417882-574180502e-89
Download

 

© 2003-2025: USA · USDA · NRPSP8 · Program to Accelerate Animal Genomics Applications. Contact: Bioinformatics Team