Authors: Abo-Ismail M K, Lansink N, Akanno E, Karisa B K, Crowley J J, Moore S S, Bork E, Stothard P, Basarab J A, Plastow G S
(Contact: plastow@ualberta.ca ) Affiliation: Livestock Gentec at University of Alberta, Edmonton, AB, Canada Title: Development and validation of a small SNP panel for feed efficiency in beef cattle Journal: Journal Of Animal Science, 96(2): 375-397 (2018)
DOI :
10.1093/jas/sky020 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Residual feed intake
Chr.1 : Asso:154046 , Asso:154047 . Chr.2 : Asso:153953 , Asso:153954 , Asso:153955 , Asso:153956 , Asso:153957 , Asso:153959 , Asso:153960 . Chr.6 : Asso:153970 , Asso:153972 , Asso:153973 , Asso:154048 , Asso:154049 . Chr.7 : Asso:153976 , Asso:153977 , Asso:153978 , Asso:153979 , Asso:153983 , Asso:153984 . Chr.10 : Asso:153989 . Chr.15 : Asso:154002 . Chr.16 : Asso:154007 , Asso:154008 . Chr.19 : Asso:154011 , Asso:154012 . Chr.20 : Asso:154013 , Asso:154014 , Asso:154015 , Asso:154016 , Asso:154017 , Asso:154018 . Chr.21 : Asso:154025 , Asso:154026 . Chr.22 : Asso:154050 . Chr.23 : Asso:154029 . Chr.26 : Asso:154032 , Asso:154033 , Asso:154036 , Asso:154037 , Asso:154040 , Asso:154041 . Chr.28 : Asso:154044 , Asso:154045 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : Asso:154051 , Asso:154053 . Chr.2 : Asso:153958 , Asso:154055 , Asso:154056 . Chr.6 : Asso:153966 , Asso:153975 . Chr.7 : Asso:153980 , Asso:154058 . Chr.8 : Asso:153988 . Chr.11 : Asso:153990 , Asso:153993 . Chr.14 : Asso:153999 , Asso:154000 . Chr.16 : Asso:154005 , Asso:154006 , Asso:154009 , Asso:154010 . Chr.20 : Asso:154019 , Asso:154020 .
QTL for Metabolic body weight
Chr.3 : Asso:153961 . Chr.4 : Asso:153963 . Chr.5 : Asso:153965 . Chr.6 : Asso:153967 , Asso:153969 , Asso:153971 . Chr.7 : Asso:153981 , Asso:153986 . Chr.11 : Asso:153991 . Chr.12 : Asso:154064 . Chr.14 : Asso:153995 , Asso:153998 . Chr.20 : Asso:154022 . Chr.21 : Asso:154024 . Chr.22 : Asso:154027 , Asso:154028 . Chr.26 : Asso:154035 , Asso:154039 . Chr.27 : Asso:154043 .
QTL for Dry matter intake
Chr.1 : Asso:154052 , Asso:154054 . Chr.2 : Asso:154057 . Chr.4 : Asso:153962 . Chr.11 : Asso:153994 . Chr.12 : Asso:154059 . Chr.14 : Asso:153997 . Chr.20 : Asso:154021 . Chr.21 : Asso:154023 . Chr.22 : Asso:154060 . Chr.26 : Asso:154030 , Asso:154031 , Asso:154034 , Asso:154038 .
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.1 : Asso:154061 . Chr.2 : Asso:154062 , Asso:154063 . Chr.4 : Asso:153964 . Chr.6 : Asso:153968 , Asso:153974 . Chr.7 : Asso:153982 , Asso:153985 , Asso:153987 . Chr.11 : Asso:153992 . Chr.14 : Asso:153996 , Asso:154001 . Chr.15 : Asso:154003 . Chr.16 : Asso:154004 . Chr.20 : Asso:154065 . Chr.26 : Asso:154042 . Chr.27 : Asso:154066 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (7) ,
Chr.2 (13) ,
Chr.3 (1) ,
Chr.4 (3) ,
Chr.5 (1) ,
Chr.6 (12) ,
Chr.7 (13) ,
Chr.8 (1) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.11 (5) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.14 (7) ,
Chr.15 (2) ,
Chr.16 (7) ,
Chr.19 (2) ,
Chr.20 (11) ,
Chr.21 (4) ,
Chr.22 (4) ,
Chr.23 (1) ,
Chr.26 (13) ,
Chr.27 (2) ,
Chr.28 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Abo-Ismail M K, Lansink N, Akanno E, Karisa B K, Crowley J J, Moore S S, Bork E, Stothard P, Basarab J A, Plastow G S (2018). Development and validation of a small SNP panel for feed efficiency in beef cattle. Journal of animal science, 96(2): 375-397;
Curated into QTLdb on 2018-04-03. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=XxWm9Q1QnW
OR
Abo-Ismail M K, Lansink N, Akanno E, Karisa B K, Crowley J J, Moore S S, Bork E, Stothard P, Basarab J A, Plastow G S (2018). Development and validation of a small SNP panel for feed efficiency in beef cattle. Journal of animal science, 96(2): 375-397; DOI: https://dx.doi.org/10.1093/jas/sky020
