Authors: Delpuech E, Aliakbari A, Labrune Y, Fève K, Billon Y, Gilbert H, Riquet J.
(Contact: juliette.riquet@inrae.fr ) Affiliation: GenPhySE, Université de Toulouse, INRAE, ENVT, 31320, Castanet-Tolosan, France Title: Identification of genomic regions affecting production traits in pigs divergently selected for feed efficiency Journal: Genetics, Selection, Evolution : GSE, 53(1): 49 (2021)
DOI :
10.1186/s12711-021-00642-1 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.1 : Asso:312031 , Asso:312032 , Asso:312033 . Chr.5 : Asso:312036 . Chr.7 : Asso:312034 , Asso:312035 , Asso:312037 . Chr.8 : Asso:312038 . Chr.11 : Asso:312039 .
QTL for Subcutaneous fat weight
Chr.1 : Asso:312042 . Chr.2 : Asso:312040 , Asso:312041 , Asso:312043 , Asso:312044 , Asso:312045 .
QTL for Water holding capacity
Chr.4 : Asso:312049 . Chr.6 : Asso:312046 , Asso:312047 , Asso:312050 , Asso:312051 . Chr.10 : Asso:312052 . Chr.18 : Asso:312048 , Asso:312053 .
QTL for Feed intake
Chr.1 : Asso:312056 , Asso:312057 . Chr.3 : Asso:312058 . Chr.7 : Asso:312054 . Chr.9 : Asso:312059 . Chr.11 : Asso:312055 .
QTL for Belly weight
Chr.9 : Asso:312060 . Chr.14 : Asso:312061 .
QTL for Lean meat percentage
Chr.2 : Asso:312062 , Asso:312063 . Chr.11 : Asso:312065 . Chr.12 : Asso:312064 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : Asso:312066 . Chr.4 : Asso:312067 . Chr.6 : Asso:312068 . Chr.12 : Asso:312069 .
QTL for Feed conversion ratio
Chr.7 : Asso:312070 , Asso:312072 . Chr.8 : Asso:312073 . Chr.17 : Asso:312071 .
QTL for Loin weight
Chr.10 : Asso:312094 . Chr.12 : Asso:312074 . Chr.13 : Asso:312075 .
QTL for Ham weight
Chr.2 : Asso:312076 , Asso:312077 , Asso:312095 . Chr.14 : Asso:312096 .
QTL for Shoulder weight
Chr.10 : Asso:312079 . Chr.18 : Asso:312078 .
QTL for Dressing percentage
Chr.3 : Asso:312082 . Chr.5 : Asso:312080 . Chr.6 : Asso:312097 . Chr.11 : Asso:312081 , Asso:312083 , Asso:312084 , Asso:312085 , Asso:312086 . Chr.14 : Asso:312087 , Asso:312088 .
QTL for Residual feed intake
Chr.9 : Asso:312089 . Chr.13 : Asso:312092 . Chr.14 : Asso:312090 , Asso:312093 . Chr.17 : Asso:312091 .
QTL for Muscle pH
Chr.2 : Asso:312102 , Asso:312106 . Chr.4 : Asso:312098 , Asso:312105 . Chr.6 : Asso:312107 , Asso:312111 , Asso:312114 , Asso:312118 , Asso:312121 , Asso:312163 . Chr.7 : Asso:312099 , Asso:312100 , Asso:312108 , Asso:312112 . Chr.8 : Asso:312109 , Asso:312110 , Asso:312115 , Asso:312116 . Chr.9 : Asso:312113 , Asso:312117 . Chr.13 : Asso:312103 , Asso:312104 , Asso:312119 , Asso:312162 . Chr.14 : Asso:312101 . Chr.15 : Asso:312120 . Chr.16 : Asso:312122 .
QTL for Meat color
Chr.1 : Asso:312123 , Asso:312124 , Asso:312153 . Chr.2 : Asso:312130 , Asso:312152 , Asso:312158 , Asso:312159 , Asso:312160 . Chr.4 : Asso:312133 , Asso:312147 , Asso:312148 , Asso:312149 , Asso:312150 . Chr.5 : Asso:312141 , Asso:312146 . Chr.6 : Asso:312126 , Asso:312135 , Asso:312136 , Asso:312142 , Asso:312143 , Asso:312154 , Asso:312155 , Asso:312156 . Chr.7 : Asso:312134 , Asso:312137 . Chr.8 : Asso:312151 . Chr.10 : Asso:312127 , Asso:312128 . Chr.11 : Asso:312131 , Asso:312132 . Chr.13 : Asso:312138 , Asso:312139 , Asso:312145 . Chr.14 : Asso:312125 , Asso:312144 , Asso:312157 , Asso:312161 . Chr.15 : Asso:312129 . Chr.17 : Asso:312140 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (10) ,
Chr.2 (17) ,
Chr.3 (2) ,
Chr.4 (9) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (20) ,
Chr.7 (12) ,
Chr.8 (7) ,
Chr.9 (5) ,
Chr.10 (5) ,
Chr.11 (10) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (9) ,
Chr.14 (11) ,
Chr.15 (2) ,
Chr.16 (1) ,
Chr.17 (3) ,
Chr.18 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Delpuech E, Aliakbari A, Labrune Y, Fève K, Billon Y, Gilbert H, Riquet J. (2021). Identification of genomic regions affecting production traits in pigs divergently selected for feed efficiency. Genetics, Selection, Evolution : GSE, 53(1): 49;
Curated into QTLdb on 2024-11-13. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=CjXb3N5MzU
OR
Delpuech E, Aliakbari A, Labrune Y, Fève K, Billon Y, Gilbert H, Riquet J. (2021). Identification of genomic regions affecting production traits in pigs divergently selected for feed efficiency. Genetics, Selection, Evolution : GSE, 53(1): 49; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/s12711-021-00642-1
